Detection of Beta-Lactoglobulin Gene Polymorphism by PCR-RFLP in Simmental, Brown Swiss, South Anatolian Red and Turkish Grey Cattle Breeds Reared Privately
Abstract
The purpose of this work was to examine the allele structures of beta-‐lactoglobulin gene with restriction fragment length polymorphism (RFLP) method in Simmental, Brown Swiss, South Anatolian Red and Turkish Grey cattle breeds being raised in Turkey. The material of the study consisted of 75 heads of Simmental, 75 heads of Brown Swiss, 40 heads South Anatolian Red and 40 heads Turkish Grey cattle. DNA materials were isolated from blood samples using phenol-‐chloroform extraction method. In order to determine the beta-‐lactoglobulin alleles in polymerase chain reaction (PCR) products, the PCR products were digested with HaeIII endonuclease enzyme. The digest products obtained were determined by electrophoresis using 4% agarose gel. The AA genotypic frequency was found the highest in Simmental breed; the BB genotypic frequency was found the highest in the South Anatolian Red (SAR) breed and the AB genotypic frequency was found the highest in Brown Swiss breed in beta-‐lactoglobulin gene. In this study, the B allele frequency was found higher than the A allele in SAR cattle breeds. But, the A allele frequency was found higher than the B allele in the Simmental breed. At the end of this study, a deviation in Hardy-‐Weinberg equilibrium (HWE) was observed in terms of beta-‐lactoglobulin locus in the breeds examined. Key words: Beta-‐lactoglobulin, Cattle, Genetic marker, RFLP.
Keywords
Halk Elinde Yetiştirilen Simental, İsviçre Esmeri, Güney Anadolu Kırmızısı ve Boz Irk Sığırlarında Beta-Laktoglobulin Gen Polimorfizminin PCR-RFLP Yöntemi ile Belirlenmesi
Abstract
Bu çalışmada Türkiye’de yetiştirilen sığır ırklarından Simental, İsviçre Esmeri, Güney Anadolu Kırmızısı ve Boz Irk sığırlarında beta-laktoglobulin geninin allel yapılarının restriksiyon fragment uzunluk polimorfizmi (RFLP) yöntemi ile belirlenmesi amaçlanmıştır. Çalışmanın materyalini, halk elinde yetiştirilen 75 baş Simental, 75 baş İsviçre Esmeri, 40 baş Güney Anadolu Kırmızısı ve 40 baş Boz Irk sığırı oluşturmuştur. Çalışmada kullanılan DNA’lar kandan fenol-kloroform yöntemi ile elde edilmiştir. Beta-laktoglobulin allellerinin belirlenmesinde uygulanan polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) işlemini takiben elde edilen PCR ürünleri HaeIII endonükleaz enzimi ile kesilmiştir. Elde edilen kesim ürünleri %4’lük agaroz jel eletroforez yöntemi ile belirlenmiştir. Beta-laktoglubulin geni için en yüksek AA genotip frekansı Simental ırkında, en yüksek BB genotip frekansı Güney Anadolu Kırmızısı (GAK) ırkında ve en yüksek AB genotip frekansı İsviçre Esmeri ırkında görülmüştür. GAK ırkında B allelinin frekansı, Simental ırkında ise A allelinin frekansı en yüksek bulunmuştur. Çalışma sonunda incelenen ırklarda beta-laktogrobulin lokusu yönünden Hardy-Weinberg dengesinden (HWE) sapma görülmüştür.
Keywords
Details
| Primary Language | Turkish |
|---|---|
| Subjects | Health Care Administration |
| Journal Section | Araştırma Makaleleri |
| Authors | |
| Publication Date | March 31, 2014 |
| Published in Issue | Year 2014 Volume: 9 Issue: 1 |
