Erratum
BibTex RIS Cite

Erratum: Orta Karadeniz Bölgesinden Toplanan Dactylis glomerata, Festuca arundinacea, Trifolium repens Genotiplerinin Çekirdek DNA İçeriklerinin Belirlenmesi ve Ploidi Analiziyle Tür Teşhisinde Kullanılması

Year 2022, Volume: 5 Issue: 3, 274 - 294, 15.12.2022
The original article was published on August 15, 2021. https://dergipark.org.tr/en/pub/ijlsb/issue/58412/789825

Erratum Note

Düzeltme Yazısı/Erratum 2021 yılında 4(2): p. 274-294 yayınlanan ’’Orta Karadeniz Bölgesinden Toplanan Dactylis glomerata, Festuca arundinaceae, Trifolium repens Genotiplerinin Çekirdek DNA İçeriklerinin Belirlenmesi ve Ploidi Analiziyle Tür Teşhisinde Kullanılması’’ başlıklı makalede yapılan düzeltmeler aşağıdaki gibidir. Yayınlanmış olan: Fatih Alay1*, Kadir İspirli1, Necda Çankaya1, Metin Tuna2, İlknur Ayan3* Bildirilen Düzeltilmiş hali: Fatih Alay1*, Kadir İspirli1, Necda Çankaya1, İlknur Ayan2* Düzeltme Açıklaması: ’’International Journal of Life Sciences and Biotechnology’’ dergisinin 2021 yılı 4(2): p. 274-294 sayısında yer alan Alay, F., İspirli, K., Çankaya, N., Tuna, M., Ayan İ., (2021). ‘’Orta Karadeniz Bölgesinden Toplanan Dactylis glomerata, Festuca arundinaceae, Trifolium repens Genotiplerinin Çekirdek DNA İçeriklerinin Belirlenmesi ve Ploidi Analiziyle Tür Teşhisinde Kullanılması’’’International Journal of Life Sciences and Biotechnology Dergisi, 4(2): p. 274-294. Retrieved from https://dergipark.org.tr/en/download/article-file/1271700’’ referanslı makalede sorumlu yazar tarafından dördüncü sırada adı geçen ‘’Metin TUNA’’ adlı yazar kendi isteğiyle makaleden adının çıkarılmasını talep etmektedir. Makalede yer alan düzeltmenin yapılması için bu düzeltme metni sunulmuştur.

Abstract

Bu çalışma, Orta Karadeniz Bölgesi doğal florasından toplanan domuz ayrığı (Dactylis glomerata ssp.), kamışsı yumak (Festuca arundinaceae ssp.) ve ak üçgül (Trifolium repens ssp.) popülasyonlarının çekirdek DNA içeriklerinin flow sitometri yöntemiyle belirlenmesi ve ploidi analizi ile tür teşhisinde kullanılması amacıyla yürütülmüştür. Proje kapsamında ak üçgülden mera tipi 80, domuz ayrığından ot ve mera tipi 80 ve kamışsı yumaktan ot, mera ve çim tipi 130 adet genotip kullanılmıştır. Analizlerde tarlada yetişmekte olan bitkilerden alınan taze yaprak dokuları kullanılmıştır. Floresan boya olarak ise propidium iodide kullanılmıştır. İnternal standard, Dactylis glomerata ve Trifolium repens genotiplerinde Vicia sativa, Festuca arundinecea genotiplerinde ise Hordeum vulgare kullanılmıştır. Elde edilen sonuçlara göre araştırmada kullanılan Dactylis glomerata genotiplerinin ortalama 2C çekirdek DNA içeriği 9.12 pg (8.32 pg-9.66 pg); Trifolium repens genotiplerinin ortalama 2C çekirdek DNA içeriği 2.33 pg (2.22 pg-2.44 pg); Festuca arundinecea genotiplerinin ortalama 2C çekirdek DNA içeriği 17.47 pg (17.02 pg-17.98 pg) arasında değiştiği belirlenmiştir. Çekirdek DNA içerikleri ile genotiplerin ploidi düzeylerini ilişkilendirmek amacıyla yapılan kromozom sayımlarında domuz ayrığı genotiplerinin 2n=4x=28, ak üçgül genotiplerinin 2n=4x=32 ve kamışsı yumak genotiplerinin 2n= 6x=42 kromozoma sahip oldukları belirlenmiştir. Elde edilen bu sonuçlara göre çalışmada kullanılan Dactylis ve Trifolium genotiplerinin tetraploid, Festuca genotiplerinin ise hekzaploid olduğu saptanmıştır. Ayrıca çalışmada kullanılan tüm genotipler çekirdek DNA içeriklerinin de yardımıyla taksonomik olarak teşhis edilmiş ve Trifolium repens ssp.’nin Trifolium repens var. repens, Dactylis glomerata ssp.’nin Dactylis glomerata subsp. glomerata ve Festuca arundineceae ssp.’nin de Festuca arundinacea subsp. arundinacea olduğu ve genotiplerin içerisinde başka türlere ait hiç bir genotipin bulunmadığı belirlenmiştir.

Supporting Institution

TÜBİTAK

Project Number

218O099

Thanks

TÜBİTAK a maddi desteklerinden dolayı teşekkürlerimi sunarım.

References

  • 1. Anonim, Karadeniz Tarımsal Araştırma Enstitüsü Toprak Gübre ve Su Laboratuarı, Samsun, 2014.
  • 2. Alay, F., K. İspirli, and N. Çankaya, Yıllara Göre Yem Bitkileri Ekiliş Alanları, Kaba Yem Üretimi, Tohum İthalatı ve İhracatı. SAMTİM, 2015. Sayı: 50 ISSN 1305-7588.
  • 3. Ayan, İ., et al.,. Orta Karadeniz Bölgesi’nde Bazı Buğdaygil Yembitkilerinin Toplanması, Tanımlanması ve Kültüre Alınma Olanaklarının Araştırılması. 106 O 738 nolu TÜBİTAK Proje Sonuç Raporu, 2011.
  • 4. Creber, L.H., et al., Variation in DNA C value in natural populations of Dactylis glomerata’’ School of Pure and Applied Biology. Universitv of Wales, PO Box 915, Cardiff CFl 3TL, 1994. 128, 555-561.
  • 5. Davis, P.H. Flora of Turkey and the East Aegean Islands. – Pp:.? in Davis PH (ed.) , Flora of Turkey and the East Aegean Islands 9. 1985. Edinburgh: Edinburgh University.
  • 6. Özbek, H. and S. Keskin, Standart sapma mı yoksa standart hata mı? Van Tıp Dergisi, 2007. 14(2): p.64-67.
  • 7. Reeves, G., et al., Genome Size is Negatively Correlated with Altitude in Natural Populations of Dactylis glomerata. Annals of Botany, 1998. 82: p. 99–105.
  • 8. Rizza, D. M., et al., Genetic diversity and DNA content of three South American and three Eurasiatic Trifolium species. Genet. Mol. Biol. 2007. vol.30 no.4.
  • 9. Šmarda, P., et al., Ploidy level variability of some Central European fescues (Festuca subg. Festuca, Poaceae) Biologia. 2005. 60/1:p. 25—36.
  • 10. Smarda P., et al.,. Genome Size and GC Content Evolution of Festuca: Ancestral Expansion and Subsequent Reduction. Annals of Botany, 2008. 101: p.421–433.
  • 11. Tuna, M., et al., Cite as Characterization of natural orchardgrass (Dactylis glomerata L.) populations of the Thrace Region of Turkey based on ploidy and DNA polymorphism. 2004. 135(1): p.39–46.
  • 12. Tuna, S, G., et al., Flow Sitometri ile Çok Yıllık Buğdaygil Yem Bitkisi Genetik Kaynaklarının Karakterizasyonu. Tarla Bitkileri Merkez Araştırma Enstitüsü Dergisi, 2016. 25 (2):p.7-12.
  • 13. Turan, İ. Temel İstatistik, https://s3.amazonaws.com/academia.edu.documents/2011.
  • 14. Vilhar, B., et al., Genome size and the nucleolar number as estimators of ploidy level in Dactylis glomeratain the Slovenian Alps. Plant Systematics and Evolution, 2002. 234(1):p.1–13.
  • 15. Vižintin, L., B. Javornik, and B. Bohanec, Genetic characterization of selected Trifolium species as revealed by nuclear DNA content and ITS rDNA region analysis. Plant Science, 2006. 170(1).p.859-866.

Erratum: Determination of Core DNA Contents and Use in Species Identification by Ploidy Analysis of Dactylis glomerata ssp., and Festuca arundinaceae ssp. of Trifolium repens ssp. Collected from the Central Black Sea Region

Year 2022, Volume: 5 Issue: 3, 274 - 294, 15.12.2022
The original article was published on August 15, 2021. https://dergipark.org.tr/en/pub/ijlsb/issue/58412/789825

Erratum Note

Düzeltme Yazısı/Erratum 2021 yılında 4(2): p. 274-294 yayınlanan ’’Orta Karadeniz Bölgesinden Toplanan Dactylis glomerata, Festuca arundinaceae, Trifolium repens Genotiplerinin Çekirdek DNA İçeriklerinin Belirlenmesi ve Ploidi Analiziyle Tür Teşhisinde Kullanılması’’ başlıklı makalede yapılan düzeltmeler aşağıdaki gibidir. Yayınlanmış olan: Fatih Alay1*, Kadir İspirli1, Necda Çankaya1, Metin Tuna2, İlknur Ayan3* Bildirilen Düzeltilmiş hali: Fatih Alay1*, Kadir İspirli1, Necda Çankaya1, İlknur Ayan2* Düzeltme Açıklaması: ’’International Journal of Life Sciences and Biotechnology’’ dergisinin 2021 yılı 4(2): p. 274-294 sayısında yer alan Alay, F., İspirli, K., Çankaya, N., Tuna, M., Ayan İ., (2021). ‘’Orta Karadeniz Bölgesinden Toplanan Dactylis glomerata, Festuca arundinaceae, Trifolium repens Genotiplerinin Çekirdek DNA İçeriklerinin Belirlenmesi ve Ploidi Analiziyle Tür Teşhisinde Kullanılması’’’International Journal of Life Sciences and Biotechnology Dergisi, 4(2): p. 274-294. Retrieved from https://dergipark.org.tr/en/download/article-file/1271700’’ referanslı makalede sorumlu yazar tarafından dördüncü sırada adı geçen ‘’Metin TUNA’’ adlı yazar kendi isteğiyle makaleden adının çıkarılmasını talep etmektedir. Makalede yer alan düzeltmenin yapılması için bu düzeltme metni sunulmuştur.

Abstract

This study was carried out for the purpose to the determination of the nuclear DNA contents by flow cytometry method and its use in species identification with ploidy analysis of the populations of Dactylis glomerata, Festuca arundinaceae and Trifolium repens collected from the natural flora of the Central Black Sea Region. Pasture type 80 from T. repens, hay and pasture type 80 from D. glomerata and grass, pasture and hay type 130 from F. arundinaceae genotypes were used. Fresh leaf tissues from plants growing in the field were used in the analysis. Propidium iodide was used as fluorescent dye. Used Hordeum vulgare in Festuca arundinecea genotypes and Vicia sativa in Dactylis glomerata and Trifolium repens genotypes as internal standard. According to the results obtained average 2C core DNA content of Dactylis glomerata genotypes 9.12 pg (8.32 pg-9.66 pg); average 2C core DNA content of Trifolium repens genotypes 2.33 pg (2.22 pg-2.44 pg); average 2C core DNA content of Festuca arundinecea genotypes 17.47 pg (17.02 pg-17.98 pg) was determined. Chromosome counts were performed to correlate the core DNA contents with the ploidy levels of genotypes. 2n = 4x = 28 of D. glomerata genotypes and 2n = 4x = 32 of T. repens genotypes and 2n = 6x = 42 of F. arundinaceae genotypes was determined to have chromosomes. According to these results, tetraploid of Dactylis and Trifolium genotypes and hekzaploid of Festuca genotypes were determined to be. In addition, all the genotypes used in the study were taxonomically diagnosed with the help of the core DNA contents and Trifolium repens var. repens of Trifolium repens ssp., Dactylis glomerata subsp. glomerata of Dactylis glomerata ssp. and Festuca arundinacea subsp. arundinacea of Festuca arundineceae ssp. was founded. It was determined that genotypes did not contain any genotypes of other species.

Project Number

218O099

References

  • 1. Anonim, Karadeniz Tarımsal Araştırma Enstitüsü Toprak Gübre ve Su Laboratuarı, Samsun, 2014.
  • 2. Alay, F., K. İspirli, and N. Çankaya, Yıllara Göre Yem Bitkileri Ekiliş Alanları, Kaba Yem Üretimi, Tohum İthalatı ve İhracatı. SAMTİM, 2015. Sayı: 50 ISSN 1305-7588.
  • 3. Ayan, İ., et al.,. Orta Karadeniz Bölgesi’nde Bazı Buğdaygil Yembitkilerinin Toplanması, Tanımlanması ve Kültüre Alınma Olanaklarının Araştırılması. 106 O 738 nolu TÜBİTAK Proje Sonuç Raporu, 2011.
  • 4. Creber, L.H., et al., Variation in DNA C value in natural populations of Dactylis glomerata’’ School of Pure and Applied Biology. Universitv of Wales, PO Box 915, Cardiff CFl 3TL, 1994. 128, 555-561.
  • 5. Davis, P.H. Flora of Turkey and the East Aegean Islands. – Pp:.? in Davis PH (ed.) , Flora of Turkey and the East Aegean Islands 9. 1985. Edinburgh: Edinburgh University.
  • 6. Özbek, H. and S. Keskin, Standart sapma mı yoksa standart hata mı? Van Tıp Dergisi, 2007. 14(2): p.64-67.
  • 7. Reeves, G., et al., Genome Size is Negatively Correlated with Altitude in Natural Populations of Dactylis glomerata. Annals of Botany, 1998. 82: p. 99–105.
  • 8. Rizza, D. M., et al., Genetic diversity and DNA content of three South American and three Eurasiatic Trifolium species. Genet. Mol. Biol. 2007. vol.30 no.4.
  • 9. Šmarda, P., et al., Ploidy level variability of some Central European fescues (Festuca subg. Festuca, Poaceae) Biologia. 2005. 60/1:p. 25—36.
  • 10. Smarda P., et al.,. Genome Size and GC Content Evolution of Festuca: Ancestral Expansion and Subsequent Reduction. Annals of Botany, 2008. 101: p.421–433.
  • 11. Tuna, M., et al., Cite as Characterization of natural orchardgrass (Dactylis glomerata L.) populations of the Thrace Region of Turkey based on ploidy and DNA polymorphism. 2004. 135(1): p.39–46.
  • 12. Tuna, S, G., et al., Flow Sitometri ile Çok Yıllık Buğdaygil Yem Bitkisi Genetik Kaynaklarının Karakterizasyonu. Tarla Bitkileri Merkez Araştırma Enstitüsü Dergisi, 2016. 25 (2):p.7-12.
  • 13. Turan, İ. Temel İstatistik, https://s3.amazonaws.com/academia.edu.documents/2011.
  • 14. Vilhar, B., et al., Genome size and the nucleolar number as estimators of ploidy level in Dactylis glomeratain the Slovenian Alps. Plant Systematics and Evolution, 2002. 234(1):p.1–13.
  • 15. Vižintin, L., B. Javornik, and B. Bohanec, Genetic characterization of selected Trifolium species as revealed by nuclear DNA content and ITS rDNA region analysis. Plant Science, 2006. 170(1).p.859-866.
There are 15 citations in total.

Details

Primary Language Turkish
Subjects Agricultural Engineering
Journal Section Proofreading
Authors

Fatih Alay 0000-0003-2121-5847

Kadir İspirli This is me 0000-0002-7266-4311

Necda Çankaya This is me

İlknur Ayan 0000-0002-5097-9013

Project Number 218O099
Early Pub Date May 14, 2022
Publication Date December 15, 2022
Published in Issue Year 2022 Volume: 5 Issue: 3

Cite

EndNote Alay F, İspirli K, Çankaya N, Ayan İ (December 1, 2022) Orta Karadeniz Bölgesinden Toplanan Dactylis glomerata, Festuca arundinacea, Trifolium repens Genotiplerinin Çekirdek DNA İçeriklerinin Belirlenmesi ve Ploidi Analiziyle Tür Teşhisinde Kullanılması. International Journal of Life Sciences and Biotechnology 5 3 274–294.



Follow us on social networks  19277 19276 20153  22366