Örümceklerde (Ordo: Araneae) farklı muhafaza koşullarının DNA Sekanslama ve Barkotlama Analizleri Üzerine Etkileri
Öz
Bu
çalışmada farklı koşullarda muhafaza edilen Lycosidae ve Thomisidae (Ordo: Araneae) familyalarına ait müze
örneklerinden DNA izole edilmiş ve DNA barkotlama çalışmaları yapılmıştır. Örümceklerin vücut büyüklüğü, farklı alkol
değerleri ve DNA konsantrasyonlarının DNA sekansları üzerine etkisi
araştırılmıştır. 15 yıllık örneklerden genomik DNA izolasyonları yapılmış, iki
farklı gen bölgesi (COI, ITS) PCR ile çoğaltılmış ve sekanslama işlemlerine
tabi tutulmuştur. Sekanslama üzerine örneklerde vücut büyüklüğü ile DNA
konsantrasyonu arasında bir ilişki belirlenemezken, saklama koşullarının DNA
kalitesini ve sekanslamayı etkilediği belirlenmiştir.
Anahtar Kelimeler
Kaynakça
- Kaynaklar A’Haea, S., Harling R, McKinlay RG, Topping CJ(1998). RAPD profiling of spider (Araneae) DNA. Journal of Arachnology. 26: 397-400.
- Anderson JC, Mills NJ(2012). DNA extraction from museum specimens of parasitic Hymenoptera. PloS ONE 7:e45549.
- Barret RDH, Hebert PDN (2005). Identifying spiders through DNA barcodes. Canadian Journal of Zoology.83: 481-491.
- Bayram, A., Kunt, K.B. and Danışman, T. (2017). The Checklist of the Spiders of Turkey. Version 2017, Online at http://www.spidersofturkey.info
- Dayrat B (2005). towards integrative taxonomy. Biological Journal of the Linnean Society.85:407-415.
- Folmer O, Black M, Hoeh W, Lutz R, Vrijenhoek R (1994).DNA primers for amplification of mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I from diverse metazoan invertebrates. Mol Mar Biol Biotechnol.3(5):294-9.
- Goldstein PZ, DeSalle R (2011). Integrating DNA barcode data and taxonomic practise: Determination, discovery and description. Bioessays. 33:135-147.
- Ji, Y.-J., Zhang, D.-H.&He,L,-J. (2003). Rvolutionary conservation and versatility of a new set of primers amplifying internal transcribed spacer regions in insect and other invertabrates.Molecular Ecology Notes.3:581-585.
- Nentwig W, Blick T, Gloor D, Hänggi A, Kropf C (2017). Spiders of Europe. www.araneae.unibe.ch. Version of access date : 10.2017
- Qıagen.(2006). DNeasy Blood & Tissue Handbook.(USA).
- Vink CJ, Thomas SM, Paquin P, Hayashi CY, Hedin M (2005).The effect of preservatives and temparatures on Arachnid DNA. İnvertebrate Systematics.19:99-104.
- Will KW, Mishler BD, Wheeler QD (2005). The perils of DNA barcoding and the need for integrative taxonomy. Systematic Biology. 54:844-851.
- Zuccon D, Brisset j, Corbari L, Puillandre N, Utge J, Samadi S (2012). An optimised protocol for barcoding museum collections of decapod crustaceans: a case-study for a 10-40 years- old collection. Invertebrate Systematics.26:592-600.
Öz
Kaynakça
- Kaynaklar A’Haea, S., Harling R, McKinlay RG, Topping CJ(1998). RAPD profiling of spider (Araneae) DNA. Journal of Arachnology. 26: 397-400.
- Anderson JC, Mills NJ(2012). DNA extraction from museum specimens of parasitic Hymenoptera. PloS ONE 7:e45549.
- Barret RDH, Hebert PDN (2005). Identifying spiders through DNA barcodes. Canadian Journal of Zoology.83: 481-491.
- Bayram, A., Kunt, K.B. and Danışman, T. (2017). The Checklist of the Spiders of Turkey. Version 2017, Online at http://www.spidersofturkey.info
- Dayrat B (2005). towards integrative taxonomy. Biological Journal of the Linnean Society.85:407-415.
- Folmer O, Black M, Hoeh W, Lutz R, Vrijenhoek R (1994).DNA primers for amplification of mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I from diverse metazoan invertebrates. Mol Mar Biol Biotechnol.3(5):294-9.
- Goldstein PZ, DeSalle R (2011). Integrating DNA barcode data and taxonomic practise: Determination, discovery and description. Bioessays. 33:135-147.
- Ji, Y.-J., Zhang, D.-H.&He,L,-J. (2003). Rvolutionary conservation and versatility of a new set of primers amplifying internal transcribed spacer regions in insect and other invertabrates.Molecular Ecology Notes.3:581-585.
- Nentwig W, Blick T, Gloor D, Hänggi A, Kropf C (2017). Spiders of Europe. www.araneae.unibe.ch. Version of access date : 10.2017
- Qıagen.(2006). DNeasy Blood & Tissue Handbook.(USA).
- Vink CJ, Thomas SM, Paquin P, Hayashi CY, Hedin M (2005).The effect of preservatives and temparatures on Arachnid DNA. İnvertebrate Systematics.19:99-104.
- Will KW, Mishler BD, Wheeler QD (2005). The perils of DNA barcoding and the need for integrative taxonomy. Systematic Biology. 54:844-851.
- Zuccon D, Brisset j, Corbari L, Puillandre N, Utge J, Samadi S (2012). An optimised protocol for barcoding museum collections of decapod crustaceans: a case-study for a 10-40 years- old collection. Invertebrate Systematics.26:592-600.
Ayrıntılar
| Birincil Dil | Türkçe |
|---|---|
| Konular | Yapısal Biyoloji |
| Bölüm | Araştırma Makaleleri |
| Yazarlar | |
| Yayımlanma Tarihi | 30 Nisan 2018 |
| Gönderilme Tarihi | 30 Ekim 2017 |
| Yayımlandığı Sayı | Yıl 2018 Cilt: 44 Sayı: 1 |
Kaynak Göster
Dergi Sahibi: Selçuk Üniversitesi Fen Fakültesi Adına Rektör Prof. Dr. Metin AKSOY
Selçuk Üniversitesi Fen Fakültesi Fen Dergisi temel bilimlerde ve diğer uygulamalı bilimlerde özgün sonuçları olan Türkçe ve İngilizce makaleleri kabul eder. Dergide ayrıca güncel yenilikleri içeren derlemelere de yer verilebilir.
Selçuk Üniversitesi Fen Fakültesi Fen Dergisi;
İlk olarak 1981 yılında S.Ü. Fen-Edebiyat Fakültesi Dergisi olarak yayın hayatına başlamış; 1984 yılına kadar (Sayı 1-4) bu adla yayınlanmıştır.
1984 yılında S.Ü. Fen-Edeb. Fak. Fen Dergisi olarak adı değiştirilmiş 5. sayıdan itibaren bu isimle yayınlanmıştır.
3 Aralık 2008 tarih ve 27073 sayılı Resmi Gazetede yayımlanan 2008/4344 sayılı Bakanlar Kurulu Kararı ile Fen-Edebiyat Fakültesi; Fen Fakültesi ve Edebiyat Fakültesi olarak ayrılınca 2009 yılından itibaren dergi Fen Fakültesi Fen Dergisi olarak çıkmıştır.
2016 yılından itibaren DergiPark’ta taranmaktadır.
Selçuk Üniversitesi Fen Fakültesi Fen Dergisi Creative Commons Atıf 4.0 Uluslararası Lisansı (CC BY-NC 4.0) ile lisanslanmıştır.