Plum pox virus (PPV) Türkiye’de ilk olarak 1968 yılında Edirne ilinde tespitinden sonra birçok meyve bahçesinde saptanmıştır. Ülkesel keşif ve takip sürveyleri kapsamında PPV’nin varlığının araştırılması için Zonguldak ilinde 2019-2021 yılları arasında toplam 2539 örnek toplanmıştır. Toplanan örnekler içinde aynı ev bahçesine ait 6 adet erik ağacının yapılan DAS-ELISA ve RT-PCR sonucunda PPV ile enfekteli olduğu belirlenmiştir. Enfekteli olduğu belirlenen 6 adet izolatın P3, 6K1, CI ve CP gen bölgelerini içeren toplam 1533 nükleotitlik diziler GenBank’a kaydedilmiştir. Zonguldak PPV-izolatlarına ait diziler ile yapılan BlastN analizi sonucunda yüksek benzerlik oranı ile PPV-M ırkına ait olduğu belirlenmiştir. Enfekteli izolatlar için Maximum Likelihood (ML), Maximum Parsimony (MP) ve Bayesian Inference (BI) yöntemleri ile gerçekleştirilen filogenetik ağaçta da PPV-M ırkı ile kümelendiği gözlemlenmiştir. Enfekteli ağaçların imhasından sonra da aynı lokasyon ve bütün ilde yapılan sistematik sürveyler ve laboratuvar analizlerine iki yıl süre ile devam edilmiştir. Yapılan yoğun takip sürveyleri çerçevesinde ve laboratuvar analizleri sonucunda, Zonguldak ilindeki bahçelerin PPV’den arındırılması sağlanmış ve 1 km çapındaki alanda tampon bölge oluşturulmuştur. Tampon bölge içerisinde 3 yıl süreyle Prunus türlerinin yetiştiriciliği yasaklanmış, takip ve gözlem çalışmaları sonucunda bölgenin virüsten ari olması sağlanmıştır.
Tarım ve Orman Bakanlığı Tarımsal Araştırmalar ve Politikalar Genel Müdürlüğü Ankara Zirai Mücadele Merkez Araştırma Enstitüsü Müdürlüğü
Sürvey çalışmalarında emeği geçen Tarım ve Orman Bakanlığı Zonguldak İl Tarım ve Orman Müdürlüğünde görevli personelleri ile Tarımsal Araştırmalar ve Politikalar Genel Müdürlüğü Zirai Mücadele Merkez Araştırma Enstitüsü Müdürlüğüne desteklerinden dolayı teşekkür ederiz.
Plum pox virus (PPV) was first found in Turkey in 1968 in Edirne province, and then detected in different regions of the country. A total of 2539 samples were collected in Zonguldak province between 2019-2021 to investigate the presence of PPV within the scope of national surveys. It was determined that six plum trees belonging to the same home garden were infected with PPV by DAS-ELISA and RT-PCR. Partial sequences of 1533 bp including P3, 6K1, CI, and CP regions belonging to six PPV-isolates were deposited to GenBank. BlastN analysis showed that sequences of Zonguldak PPV-isolates had the highest sequence similarity at the nucleotide level with PPV-M isolates. It was observed that the infected isolates were clustered with the PPV-M strain in the phylogenetic tree generated by Maximum Likelihood (ML), Maximum Parsimony (MP), and Bayesian Inference (BI) methods. After eradication of the infected trees, systematic surveys and laboratory analyses (serological and molecular) carried out in the same location and in the whole province continued for two years. Within the framework of strict and intensive monitoring surveys and as a result of laboratory analyses, stone fruit orchards and residential sites in Zonguldak province were eliminated from PPV, and a buffer zone was established in an area of 1 km. The cultivation and planting of Prunus species in the buffer zone were prohibited for 3 years, and as a result of follow up and monitoring studies, the region was ensured to be virus-free.
Primary Language | Turkish |
---|---|
Subjects | Agricultural, Veterinary and Food Sciences |
Journal Section | RESEARCH ARTICLE |
Authors | |
Publication Date | December 30, 2022 |
Submission Date | October 28, 2021 |
Acceptance Date | December 20, 2021 |
Published in Issue | Year 2022Volume: 25 Issue: 6 |
International Peer Reviewed Journal
Free submission and publication
Published 6 times a year
KSU Journal of Agriculture and Nature
e-ISSN: 2619-9149