Taxonomic Studies on Rhodocybe asyae Specimens Discovered in a New Location
Year 2024,
Volume: 27 Issue: Ek Sayı 1 (Suppl 1), 124 - 132
Ilgaz Akata
,
Gülce Ediş
,
Eda Kumru
,
İsmail Acar
,
Ergin Sahin
Abstract
In 2023, fungal specimens were collected from the Tınaztepe Campus of Dokuz Eylül University (İzmir-Türkiye). These samples underwent a comprehensive and meticulous evaluation involving morphological examination and phylogenetic analysis based on nrITS rDNA sequencing. The DEU AKATA & SAHIN 148 samples exhibited microscopic and macroscopic characteristics that closely matched those of Rhodocybe asyae, initially described by Sesli & Vizzini. The genetic sequence analysis revealed over 99% similarity with R. asyae Sesli & Vizzini. This report represents the second recorded occurrence of R. asyae in Türkiye and the third globally. The study documents the collection site, geographical coordinates, habitat observations, the collection date, etc. Furthermore, the research provides macroscopic photographs, microscopic illustrations of the specimens, and detailed discussion, demonstrating the reliability of the present findings.
Project Number
Çalışma münferit olarak gerçekleştirilmiş olup, proje veya projeler kapsamında yapılmamıştır
References
- Akata, I., & Erdoğdu, M. (2020). First report of Rutstroemia elatina (Ascomycota) from Turkey. Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tarım ve Doğa Dergisi, 23(2), 391-395.
- Akata, I., Kumru, E., Ediş, G., Özbey, B.G. & Şahin. E. (2023). Three New Records For Turkish Agaricales Inhabiting Ankara University Beşevler 10th Year Campus Area. Kastamonu University Journal of Forestry Faculty, 23(3), 250-263.
- Akata, I., Kumru, E., Sahin, E., Acar, İ. & Kaya, E. (2024a). Amanita vidua: A new record for Turkish Amanita Section Phalloideae based on morphological and molecular data. Trakya University Journal of Natural Sciences, 25(1), 97-110.
- Akata, I., Ediş, G., Kumru, E., Acar, İ. & Şahin, E. (2024b). Initial Report of Inocybe costinitii in Türkiye with Morphological and Molecular Data. KSU J. Agric Nat 27 (6), 1304-1312.
- Altuntaş, D., Sahin, E., Kabaktepe, Ş., Alli, H., & Akata, I. (2021). Albatrellopsis flettii, A New Genus for Turkish Albatrellaceae. Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tarım ve Doğa Dergisi, 24(4), 815-819.
- Aplin, N., Cullington, P., Douglas, B., & Janke, E. (2022). DNA barcoding reveals three Rhodocybe species new to Britain. Field Mycology, 23(2), 41-47.
- Bas C, Kuyper TW, Noordeloos ME, Vellinga EC (1988). Flora Agaricina Neerlandica. Vol. 1. Rotterdam, the Netherlands: Balkema.
- Baroni, T.J. (1981). A revision of the genus Rhodocybe Maire (Agaricales). Beihefte Zur Nova hedwigia 67, 1-198.
- Kluting KL, Baroni TJ & Bergemann SE. (2014). Toward a stable classification of genera within the Entolomataceae: a phylogenetic re-evaluation of the Rhodocybe-Clitopilus clade. Mycologia 106(6), 1127-1142.
- Marian, I.M., Valdes, I.D., Hayes, R.D., La Butti, K., Duffy, K., Chovatia, M., Johnson J., Ng, V., Lugones L.G., Wösten, H.A.B., Grigoriev, I.V. & Ohm, R.A. (2024). High phenotypic and genotypic plasticity among strains of the mushroom-forming fungus Schizophyllum commune. BioRxiv, 2024-02.
- Raja, H.A., Miller, A.N., Pearce, C.J. & Oberlies, N.H. (2017). Fungal identification using molecular tools: a primer for the natural products research community. Journal of Natural Products, 80(3), 756-770.
- Sesli, E. (2021). Rhodocybe cistetorum (Basidiomycota, Entolomataceae), is a new species from the Colchic ecoregion of Turkey. Nordic Journal of Botany, 39(4),1-9.
- Sesli, E., & Vizzini, A. (2017). Two new Rhodocybe species (sect. Rufobrunnea, Entolomataceae) from the east black sea coast of Turkey. Turkish Journal of Botany, 41(2), 200-210.
- Sesli, E., Asan, A., Selçuk, F., Arabacı Günyar, Ö., Akata, I., Akgül, H., Aktaş, S., Alkan, S., Allı, H., Aydoğdu, H., Berikten, D., Demirel, K., Demirel, R., Doğan, H.H., Erdoğdu, M., Ergül, C.C., Eroğlu, G., Giray, G.., Halik Uztan, A.,
Kabaktepe, Ş., Kadaifçiler, D., Kalyoncu, F., Karaltı, İ., Kaşık, G., Kaya, A., Keleş, A., Kırbağ, S., Kıvanç, M., Ocak, İ.,
Ökten, S., Özkale, E., Öztürk, C., Sevindik, M., Şen, B., Şen, İ., Türkekul, İ., Ulukapı, M., Uzun, Ya., Uzun, Yu. & Yoltaş, A. (2020). Türkiye Mantarları Listesi. Ali Nihat Gökyiğit Vakfı Yayını, İstanbul, 1177 pp.
- Silva-Filho A.G.S., Baroni T.J., Komura D.L., Moncalvo J. M., Baseia I.G. & Wartchow F. (2020). Rhodocybe fusipes (Entolomataceae) is a new species from Amazonian ‘terra-firme’ Forest of Brazil. Sydowia 72,163-170.
- Sun, Y. L., & Bau, T. (2023). Rhodocybe subasyae, a new species of Rhodocybe sect. Rufobrunnea (Entolomataceae, Agaricales) from northeast China. Mycoscience, 64(3), 96-100.
- Vizzini A, Baroni TJ, Sesli E, Antonín V. & Saar I (2016). Rhodocybe tugrulii (Agaricales, Entolomataceae), a new species from Turkey and Estonia based on morphological and molecular data, and a new combination in Clitocella (Entolomataceae). Phytotaxa, 267, 1-15.
- Vizzini, A., Ferrari, R. J., Ercole, E. & Fellin, A. (2018). A new species of Rhodocybe sect. Rufobrunnea (Entolomataceae, Agaricales) from Italy. MycoKeys 36: 21-33.
Yeni Bir Lokasyonu Keşfedilen Rhodocybe asyae Örnekleri Üzerinde Taksonomik Çalışmalar
Year 2024,
Volume: 27 Issue: Ek Sayı 1 (Suppl 1), 124 - 132
Ilgaz Akata
,
Gülce Ediş
,
Eda Kumru
,
İsmail Acar
,
Ergin Sahin
Abstract
Mantar örnekleri 2023 yılında Dokuz Eylül Üniversitesi Tınaztepe Kampüsü'nden (İzmir-Türkiye) toplanmıştır. Bu örnekler, morfolojik inceleme ve nrITS rDNA dizilemesine dayalı filogenetik analizi içeren kapsamlı ve titiz bir değerlendirmeden geçirilmiştir. DEU AKATA & SAHIN 148 örnekleri, orijinal olarak Sesli & Vizzini tarafından tanımlanan Rhodocybe asyae ile yakından eşleşen mikroskobik ve makroskobik özellikler sergilemiştir. Genetik dizi analizi de R. asyae Sesli & Vizzini ile %99'un üzerinde benzerlik göstermiştir. Bu rapor, R. asyae'nin Türkiye'de kaydedilen ikinci ve Dünya’daki üçüncü kaydını temsil etmektedir. Çalışma, coğrafi koordinatlar, habitat gözlemleri, toplama tarihi ve benzeri bilgileri de içermektedir. Ayrıca, araştırma makroskobik fotoğraflar, örneklerin mikroskobik çizimleri ve bulguların güvenilirliğini gösteren ayrıntılı tartışmalar sunmaktadır.
Supporting Institution
Bu çalışma hiçbir kurum tarafından destek görmemiştir.
Project Number
Çalışma münferit olarak gerçekleştirilmiş olup, proje veya projeler kapsamında yapılmamıştır
Thanks
Teşekkür edilecek kurum, kuruluş, veya kişi bu çalışmada yoktur.
References
- Akata, I., & Erdoğdu, M. (2020). First report of Rutstroemia elatina (Ascomycota) from Turkey. Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tarım ve Doğa Dergisi, 23(2), 391-395.
- Akata, I., Kumru, E., Ediş, G., Özbey, B.G. & Şahin. E. (2023). Three New Records For Turkish Agaricales Inhabiting Ankara University Beşevler 10th Year Campus Area. Kastamonu University Journal of Forestry Faculty, 23(3), 250-263.
- Akata, I., Kumru, E., Sahin, E., Acar, İ. & Kaya, E. (2024a). Amanita vidua: A new record for Turkish Amanita Section Phalloideae based on morphological and molecular data. Trakya University Journal of Natural Sciences, 25(1), 97-110.
- Akata, I., Ediş, G., Kumru, E., Acar, İ. & Şahin, E. (2024b). Initial Report of Inocybe costinitii in Türkiye with Morphological and Molecular Data. KSU J. Agric Nat 27 (6), 1304-1312.
- Altuntaş, D., Sahin, E., Kabaktepe, Ş., Alli, H., & Akata, I. (2021). Albatrellopsis flettii, A New Genus for Turkish Albatrellaceae. Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tarım ve Doğa Dergisi, 24(4), 815-819.
- Aplin, N., Cullington, P., Douglas, B., & Janke, E. (2022). DNA barcoding reveals three Rhodocybe species new to Britain. Field Mycology, 23(2), 41-47.
- Bas C, Kuyper TW, Noordeloos ME, Vellinga EC (1988). Flora Agaricina Neerlandica. Vol. 1. Rotterdam, the Netherlands: Balkema.
- Baroni, T.J. (1981). A revision of the genus Rhodocybe Maire (Agaricales). Beihefte Zur Nova hedwigia 67, 1-198.
- Kluting KL, Baroni TJ & Bergemann SE. (2014). Toward a stable classification of genera within the Entolomataceae: a phylogenetic re-evaluation of the Rhodocybe-Clitopilus clade. Mycologia 106(6), 1127-1142.
- Marian, I.M., Valdes, I.D., Hayes, R.D., La Butti, K., Duffy, K., Chovatia, M., Johnson J., Ng, V., Lugones L.G., Wösten, H.A.B., Grigoriev, I.V. & Ohm, R.A. (2024). High phenotypic and genotypic plasticity among strains of the mushroom-forming fungus Schizophyllum commune. BioRxiv, 2024-02.
- Raja, H.A., Miller, A.N., Pearce, C.J. & Oberlies, N.H. (2017). Fungal identification using molecular tools: a primer for the natural products research community. Journal of Natural Products, 80(3), 756-770.
- Sesli, E. (2021). Rhodocybe cistetorum (Basidiomycota, Entolomataceae), is a new species from the Colchic ecoregion of Turkey. Nordic Journal of Botany, 39(4),1-9.
- Sesli, E., & Vizzini, A. (2017). Two new Rhodocybe species (sect. Rufobrunnea, Entolomataceae) from the east black sea coast of Turkey. Turkish Journal of Botany, 41(2), 200-210.
- Sesli, E., Asan, A., Selçuk, F., Arabacı Günyar, Ö., Akata, I., Akgül, H., Aktaş, S., Alkan, S., Allı, H., Aydoğdu, H., Berikten, D., Demirel, K., Demirel, R., Doğan, H.H., Erdoğdu, M., Ergül, C.C., Eroğlu, G., Giray, G.., Halik Uztan, A.,
Kabaktepe, Ş., Kadaifçiler, D., Kalyoncu, F., Karaltı, İ., Kaşık, G., Kaya, A., Keleş, A., Kırbağ, S., Kıvanç, M., Ocak, İ.,
Ökten, S., Özkale, E., Öztürk, C., Sevindik, M., Şen, B., Şen, İ., Türkekul, İ., Ulukapı, M., Uzun, Ya., Uzun, Yu. & Yoltaş, A. (2020). Türkiye Mantarları Listesi. Ali Nihat Gökyiğit Vakfı Yayını, İstanbul, 1177 pp.
- Silva-Filho A.G.S., Baroni T.J., Komura D.L., Moncalvo J. M., Baseia I.G. & Wartchow F. (2020). Rhodocybe fusipes (Entolomataceae) is a new species from Amazonian ‘terra-firme’ Forest of Brazil. Sydowia 72,163-170.
- Sun, Y. L., & Bau, T. (2023). Rhodocybe subasyae, a new species of Rhodocybe sect. Rufobrunnea (Entolomataceae, Agaricales) from northeast China. Mycoscience, 64(3), 96-100.
- Vizzini A, Baroni TJ, Sesli E, Antonín V. & Saar I (2016). Rhodocybe tugrulii (Agaricales, Entolomataceae), a new species from Turkey and Estonia based on morphological and molecular data, and a new combination in Clitocella (Entolomataceae). Phytotaxa, 267, 1-15.
- Vizzini, A., Ferrari, R. J., Ercole, E. & Fellin, A. (2018). A new species of Rhodocybe sect. Rufobrunnea (Entolomataceae, Agaricales) from Italy. MycoKeys 36: 21-33.