Meloidogyne chitwoodi, dünyanın birçok yerinde tarım alanlarında ekonomik zarara neden olabilen istilacı bir nematoddur. Bitki paraziti nematodların tanımlanması temelde morfolojik özelliklerin ve morfometrik parametrelerin gözlenmesiyle yapılmaktadır. Ancak yayınlanmış orijinal betimlemeler ve tanılama anahtarlarının kullanılmasıyla her zaman doğru sonuç elde edilememektedir. Bu nedenle, bu çalışmada 2018 ve 2019 yılı üretim sezonu boyunca İç Anadolu Bölgesi’nden toplanan patates yumrularından izole edilen nematod örnekleri JMVhapla, JMV1 ve JMV2 primer setleri kullanılarak PCR tabanlı tanı yöntemi ile moleküler tanılama ile morfometrik ölçümler ve perineal pattern kullanılarak morfolojik olarak tanılanmıştır. İki yöntem sonucunda da nematod türü Meloidogyne chitwoodi olarak tespit edilmiştir. Ayrıca çalışmada yerel popülasyonların diğer Meloidogyne türleri ile ilişkilerini araştırmak için filogenetik analiz ve ikili uzaklık değerlendirilmesi yapılmıştır. Filogeni çalışmalarından sonra popülasyonların hem Türkiye popülasyonuna hem de diğer popülasyonlara %99 benzer olduğu tespit edilmiştir. Yayımlanmış yerel izolatların diğer sekansları ile karşılaştırıldığında bu çalışmadaki Niğde izolatı, Nevşehir (KF557791.1) izolatı ile oldukça benzerlik göstermiştir. Bu çalışma sonucunda İç Anadolu Bölgesi patates yetiştirme alanlarında zarar yapan M. chitwoodi ile ilgili veriler güncellenmiştir.
Meloidogyne chitwoodi is an invasive nematode that can cause economic damage to agricultural areas in many parts of the world. The identification of plant parasitic nematodes is basically carried out by observation of morphologic characteristics and morphometric parameters. However, it is not always possible to obtain certain results with the use of published original descriptions and diagnostic keys. Therefore, in this study, nematode samples isolated from potato tubers collected from the Central Anatolia region during the production season of 2018 and 2019 were determined molecularly by PCR-based diagnosis method using JMVhapla, JMV1 and JMV2 primer sets; and morphologically using morphometric measurements and perineal pattern. PCR reactions yielded 540 bp bands. As a result of both methods, the nematode species was determined as Meloidogyne chitwoodi. Phylogenetic analysis and pairwise distance were performed to evaluate the relationships of local populations with other Meloidogyne species. After phylogeny studies, it was determined that the populations were 99% similar to both the Turkish population and other populations. Compared to other sequences of published local isolates, the Niğde isolate in this study showed quiet similarity with Nevşehir (KF557791.1) isolate. As a result of this study, the data on M. chitwoodi, which causes damage in the potato growing areas of the Central Anatolia Region, has been updated.
Birincil Dil | İngilizce |
---|---|
Konular | Ziraat, Veterinerlik ve Gıda Bilimleri |
Bölüm | ARAŞTIRMA MAKALESİ (Research Article) |
Yazarlar | |
Yayımlanma Tarihi | 28 Şubat 2023 |
Gönderilme Tarihi | 3 Haziran 2021 |
Kabul Tarihi | 12 Ocak 2022 |
Yayımlandığı Sayı | Yıl 2023Cilt: 26 Sayı: 1 |
2022-JIF = 0.500
2022-JCI = 0.170
Uluslararası Hakemli Dergi (International
Peer Reviewed Journal)
Dergimiz, herhangi bir başvuru veya yayımlama ücreti almamaktadır. (Free submission and publication)
Yılda 6 sayı yayınlanır. (Published 6 times a year)
Bu web sitesi Creative Commons Atıf 4.0 Uluslararası Lisansı ile lisanslanmıştır.