Taxonomic Studies on Rhodocybe asyae Specimens Discovered in a New Location

Ilgaz Akata; Gülce Ediş; Eda Kumru; İsmail Acar; Ergin Sahin

doi:10.18016/ksutarimdoga.vi.1507554

Research Article

Taxonomic Studies on Rhodocybe asyae Specimens Discovered in a New Location

Year 2024, Volume: 27 Issue: Ek Sayı 1 (Suppl 1), 124 - 132, 25.12.2024

Ilgaz Akata , Gülce Ediş , Eda Kumru , İsmail Acar , Ergin Sahin

https://doi.org/10.18016/ksutarimdoga.vi.1507554

Cited By: 6

Abstract

In 2023, fungal specimens were collected from the Tınaztepe Campus of Dokuz Eylül University (İzmir-Türkiye). These samples underwent a comprehensive and meticulous evaluation involving morphological examination and phylogenetic analysis based on nrITS rDNA sequencing. The DEU AKATA & SAHIN 148 samples exhibited microscopic and macroscopic characteristics that closely matched those of Rhodocybe asyae, initially described by Sesli & Vizzini. The genetic sequence analysis revealed over 99% similarity with R. asyae Sesli & Vizzini. This report represents the second recorded occurrence of R. asyae in Türkiye and the third globally. The study documents the collection site, geographical coordinates, habitat observations, the collection date, etc. Furthermore, the research provides macroscopic photographs, microscopic illustrations of the specimens, and detailed discussion, demonstrating the reliability of the present findings.

Keywords

Rhodocybe asyae , Asia Minor , Türkiye , New locality , Mycobiota

Project Number

Çalışma münferit olarak gerçekleştirilmiş olup, proje veya projeler kapsamında yapılmamıştır

References

Akata, I., & Erdoğdu, M. (2020). First report of Rutstroemia elatina (Ascomycota) from Turkey. Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tarım ve Doğa Dergisi, 23(2), 391-395.
Akata, I., Kumru, E., Ediş, G., Özbey, B.G. & Şahin. E. (2023). Three New Records For Turkish Agaricales Inhabiting Ankara University Beşevler 10th Year Campus Area. Kastamonu University Journal of Forestry Faculty, 23(3), 250-263.
Akata, I., Kumru, E., Sahin, E., Acar, İ. & Kaya, E. (2024a). Amanita vidua: A new record for Turkish Amanita Section Phalloideae based on morphological and molecular data. Trakya University Journal of Natural Sciences, 25(1), 97-110.
Akata, I., Ediş, G., Kumru, E., Acar, İ. & Şahin, E. (2024b). Initial Report of Inocybe costinitii in Türkiye with Morphological and Molecular Data. KSU J. Agric Nat 27 (6), 1304-1312.
Altuntaş, D., Sahin, E., Kabaktepe, Ş., Alli, H., & Akata, I. (2021). Albatrellopsis flettii, A New Genus for Turkish Albatrellaceae. Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tarım ve Doğa Dergisi, 24(4), 815-819.
Aplin, N., Cullington, P., Douglas, B., & Janke, E. (2022). DNA barcoding reveals three Rhodocybe species new to Britain. Field Mycology, 23(2), 41-47.
Bas C, Kuyper TW, Noordeloos ME, Vellinga EC (1988). Flora Agaricina Neerlandica. Vol. 1. Rotterdam, the Netherlands: Balkema.
Baroni, T.J. (1981). A revision of the genus Rhodocybe Maire (Agaricales). Beihefte Zur Nova hedwigia 67, 1-198.
Kluting KL, Baroni TJ & Bergemann SE. (2014). Toward a stable classification of genera within the Entolomataceae: a phylogenetic re-evaluation of the Rhodocybe-Clitopilus clade. Mycologia 106(6), 1127-1142.
Marian, I.M., Valdes, I.D., Hayes, R.D., La Butti, K., Duffy, K., Chovatia, M., Johnson J., Ng, V., Lugones L.G., Wösten, H.A.B., Grigoriev, I.V. & Ohm, R.A. (2024). High phenotypic and genotypic plasticity among strains of the mushroom-forming fungus Schizophyllum commune. BioRxiv, 2024-02.
Raja, H.A., Miller, A.N., Pearce, C.J. & Oberlies, N.H. (2017). Fungal identification using molecular tools: a primer for the natural products research community. Journal of Natural Products, 80(3), 756-770.
Sesli, E. (2021). Rhodocybe cistetorum (Basidiomycota, Entolomataceae), is a new species from the Colchic ecoregion of Turkey. Nordic Journal of Botany, 39(4),1-9.
Sesli, E., & Vizzini, A. (2017). Two new Rhodocybe species (sect. Rufobrunnea, Entolomataceae) from the east black sea coast of Turkey. Turkish Journal of Botany, 41(2), 200-210.
Sesli, E., Asan, A., Selçuk, F., Arabacı Günyar, Ö., Akata, I., Akgül, H., Aktaş, S., Alkan, S., Allı, H., Aydoğdu, H., Berikten, D., Demirel, K., Demirel, R., Doğan, H.H., Erdoğdu, M., Ergül, C.C., Eroğlu, G., Giray, G.., Halik Uztan, A., Kabaktepe, Ş., Kadaifçiler, D., Kalyoncu, F., Karaltı, İ., Kaşık, G., Kaya, A., Keleş, A., Kırbağ, S., Kıvanç, M., Ocak, İ., Ökten, S., Özkale, E., Öztürk, C., Sevindik, M., Şen, B., Şen, İ., Türkekul, İ., Ulukapı, M., Uzun, Ya., Uzun, Yu. & Yoltaş, A. (2020). Türkiye Mantarları Listesi. Ali Nihat Gökyiğit Vakfı Yayını, İstanbul, 1177 pp.
Silva-Filho A.G.S., Baroni T.J., Komura D.L., Moncalvo J. M., Baseia I.G. & Wartchow F. (2020). Rhodocybe fusipes (Entolomataceae) is a new species from Amazonian ‘terra-firme’ Forest of Brazil. Sydowia 72,163-170.
Sun, Y. L., & Bau, T. (2023). Rhodocybe subasyae, a new species of Rhodocybe sect. Rufobrunnea (Entolomataceae, Agaricales) from northeast China. Mycoscience, 64(3), 96-100.
Vizzini A, Baroni TJ, Sesli E, Antonín V. & Saar I (2016). Rhodocybe tugrulii (Agaricales, Entolomataceae), a new species from Turkey and Estonia based on morphological and molecular data, and a new combination in Clitocella (Entolomataceae). Phytotaxa, 267, 1-15.
Vizzini, A., Ferrari, R. J., Ercole, E. & Fellin, A. (2018). A new species of Rhodocybe sect. Rufobrunnea (Entolomataceae, Agaricales) from Italy. MycoKeys 36: 21-33.

Yeni Bir Lokasyonu Keşfedilen Rhodocybe asyae Örnekleri Üzerinde Taksonomik Çalışmalar

Year 2024, Volume: 27 Issue: Ek Sayı 1 (Suppl 1), 124 - 132, 25.12.2024

Ilgaz Akata , Gülce Ediş , Eda Kumru , İsmail Acar , Ergin Sahin

https://doi.org/10.18016/ksutarimdoga.vi.1507554

Cited By: 6

Abstract

Mantar örnekleri 2023 yılında Dokuz Eylül Üniversitesi Tınaztepe Kampüsü'nden (İzmir-Türkiye) toplanmıştır. Bu örnekler, morfolojik inceleme ve nrITS rDNA dizilemesine dayalı filogenetik analizi içeren kapsamlı ve titiz bir değerlendirmeden geçirilmiştir. DEU AKATA & SAHIN 148 örnekleri, orijinal olarak Sesli & Vizzini tarafından tanımlanan Rhodocybe asyae ile yakından eşleşen mikroskobik ve makroskobik özellikler sergilemiştir. Genetik dizi analizi de R. asyae Sesli & Vizzini ile %99'un üzerinde benzerlik göstermiştir. Bu rapor, R. asyae'nin Türkiye'de kaydedilen ikinci ve Dünya’daki üçüncü kaydını temsil etmektedir. Çalışma, coğrafi koordinatlar, habitat gözlemleri, toplama tarihi ve benzeri bilgileri de içermektedir. Ayrıca, araştırma makroskobik fotoğraflar, örneklerin mikroskobik çizimleri ve bulguların güvenilirliğini gösteren ayrıntılı tartışmalar sunmaktadır.

Keywords

Rhodocybe asyae , Türkiye , Yeni lokalite , Küçük Asya , Mikobiyota

Supporting Institution

Bu çalışma hiçbir kurum tarafından destek görmemiştir.

Project Number

Çalışma münferit olarak gerçekleştirilmiş olup, proje veya projeler kapsamında yapılmamıştır

Thanks

Teşekkür edilecek kurum, kuruluş, veya kişi bu çalışmada yoktur.

References

Akata, I., & Erdoğdu, M. (2020). First report of Rutstroemia elatina (Ascomycota) from Turkey. Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tarım ve Doğa Dergisi, 23(2), 391-395.
Akata, I., Kumru, E., Ediş, G., Özbey, B.G. & Şahin. E. (2023). Three New Records For Turkish Agaricales Inhabiting Ankara University Beşevler 10th Year Campus Area. Kastamonu University Journal of Forestry Faculty, 23(3), 250-263.
Akata, I., Kumru, E., Sahin, E., Acar, İ. & Kaya, E. (2024a). Amanita vidua: A new record for Turkish Amanita Section Phalloideae based on morphological and molecular data. Trakya University Journal of Natural Sciences, 25(1), 97-110.
Akata, I., Ediş, G., Kumru, E., Acar, İ. & Şahin, E. (2024b). Initial Report of Inocybe costinitii in Türkiye with Morphological and Molecular Data. KSU J. Agric Nat 27 (6), 1304-1312.
Altuntaş, D., Sahin, E., Kabaktepe, Ş., Alli, H., & Akata, I. (2021). Albatrellopsis flettii, A New Genus for Turkish Albatrellaceae. Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tarım ve Doğa Dergisi, 24(4), 815-819.
Aplin, N., Cullington, P., Douglas, B., & Janke, E. (2022). DNA barcoding reveals three Rhodocybe species new to Britain. Field Mycology, 23(2), 41-47.
Bas C, Kuyper TW, Noordeloos ME, Vellinga EC (1988). Flora Agaricina Neerlandica. Vol. 1. Rotterdam, the Netherlands: Balkema.
Baroni, T.J. (1981). A revision of the genus Rhodocybe Maire (Agaricales). Beihefte Zur Nova hedwigia 67, 1-198.
Kluting KL, Baroni TJ & Bergemann SE. (2014). Toward a stable classification of genera within the Entolomataceae: a phylogenetic re-evaluation of the Rhodocybe-Clitopilus clade. Mycologia 106(6), 1127-1142.
Marian, I.M., Valdes, I.D., Hayes, R.D., La Butti, K., Duffy, K., Chovatia, M., Johnson J., Ng, V., Lugones L.G., Wösten, H.A.B., Grigoriev, I.V. & Ohm, R.A. (2024). High phenotypic and genotypic plasticity among strains of the mushroom-forming fungus Schizophyllum commune. BioRxiv, 2024-02.
Raja, H.A., Miller, A.N., Pearce, C.J. & Oberlies, N.H. (2017). Fungal identification using molecular tools: a primer for the natural products research community. Journal of Natural Products, 80(3), 756-770.
Sesli, E. (2021). Rhodocybe cistetorum (Basidiomycota, Entolomataceae), is a new species from the Colchic ecoregion of Turkey. Nordic Journal of Botany, 39(4),1-9.
Sesli, E., & Vizzini, A. (2017). Two new Rhodocybe species (sect. Rufobrunnea, Entolomataceae) from the east black sea coast of Turkey. Turkish Journal of Botany, 41(2), 200-210.
Sesli, E., Asan, A., Selçuk, F., Arabacı Günyar, Ö., Akata, I., Akgül, H., Aktaş, S., Alkan, S., Allı, H., Aydoğdu, H., Berikten, D., Demirel, K., Demirel, R., Doğan, H.H., Erdoğdu, M., Ergül, C.C., Eroğlu, G., Giray, G.., Halik Uztan, A., Kabaktepe, Ş., Kadaifçiler, D., Kalyoncu, F., Karaltı, İ., Kaşık, G., Kaya, A., Keleş, A., Kırbağ, S., Kıvanç, M., Ocak, İ., Ökten, S., Özkale, E., Öztürk, C., Sevindik, M., Şen, B., Şen, İ., Türkekul, İ., Ulukapı, M., Uzun, Ya., Uzun, Yu. & Yoltaş, A. (2020). Türkiye Mantarları Listesi. Ali Nihat Gökyiğit Vakfı Yayını, İstanbul, 1177 pp.
Silva-Filho A.G.S., Baroni T.J., Komura D.L., Moncalvo J. M., Baseia I.G. & Wartchow F. (2020). Rhodocybe fusipes (Entolomataceae) is a new species from Amazonian ‘terra-firme’ Forest of Brazil. Sydowia 72,163-170.
Sun, Y. L., & Bau, T. (2023). Rhodocybe subasyae, a new species of Rhodocybe sect. Rufobrunnea (Entolomataceae, Agaricales) from northeast China. Mycoscience, 64(3), 96-100.
Vizzini A, Baroni TJ, Sesli E, Antonín V. & Saar I (2016). Rhodocybe tugrulii (Agaricales, Entolomataceae), a new species from Turkey and Estonia based on morphological and molecular data, and a new combination in Clitocella (Entolomataceae). Phytotaxa, 267, 1-15.
Vizzini, A., Ferrari, R. J., Ercole, E. & Fellin, A. (2018). A new species of Rhodocybe sect. Rufobrunnea (Entolomataceae, Agaricales) from Italy. MycoKeys 36: 21-33.

There are 18 citations in total.

Details

Primary Language	English
Subjects	Botany (Other)
Journal Section	RESEARCH ARTICLE
Authors	Ilgaz Akata 0000-0002-1731-1302 Gülce Ediş 0000-0001-7038-9865 Eda Kumru 0009-0000-7417-6197 İsmail Acar 0000-0002-6049-4896 Ergin Sahin 0000-0003-1711-738X
Project Number	Çalışma münferit olarak gerçekleştirilmiş olup, proje veya projeler kapsamında yapılmamıştır
Early Pub Date	September 15, 2024
Publication Date	December 25, 2024
Submission Date	June 30, 2024
Acceptance Date	August 17, 2024
Published in Issue	Year 2024 Volume: 27 Issue: Ek Sayı 1 (Suppl 1)

Cite

APA	Akata, I., Ediş, G., Kumru, E., … Acar, İ. (2024). Taxonomic Studies on Rhodocybe asyae Specimens Discovered in a New Location. Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tarım Ve Doğa Dergisi, 27(Ek Sayı 1 (Suppl 1), 124-132. https://doi.org/10.18016/ksutarimdoga.vi.1507554