Research Article
BibTex RIS Cite

Aridanin'in Potansiyel Bir Antikanser ve Antibakteriyel Ajan Olarak İn Siliko Tahmini

Year 2026, Volume: 29 Issue: 2, 265 - 284, 21.01.2026

Chi Godloves Fru , Yunus Başar , Melvis Akwen Chongong , Semiha Yenigün , G. Aponglen Ayimele , İbrahim Demirtas

https://doi.org/10.18016/ksutarimdoga.vi.1623765
https://izlik.org/JA95BW98JH

Abstract

Tetrapleura tetraptera'dan izole edilen Aridanin, 3-O-[β-D-glucopyranosyl-(2’-acetamido)]-3β-olean-12-en-28-oik asit, özellikle dirençli kanserlere karşı antikanser ilacı olarak kullanım için iyi potansiyellere sahip olduğu bildirilmiştir. Aridanin/doksorubisin ve kanser kemoterapisinde yer alan 6 enzim ve antibakteriyel 3 enzimin bağlanma modlarını değerlendirmek için bir in siliko çalışması yürütülmüştür. Ayrıca, olası biyoaktiviteleri ve farmakokinetik özellikleri hakkında tahminler yapılmıştır. Aridanin/doksorubisin enzim etkileşimleri, antikanser aktivitesini açıklamak için moleküler yerleştirme ve moleküler dinamik simülasyonları kullanılarak belirlenmiştir. Molekülün biyoaktivite, farmakokinetik özellikleri ve biyoyararlanım puanlarının tahminleri PASS, SwissADME ve pKCSM kullanılarak hesaplanmıştır. Sonuçlar, standart ilacınkine benzer MolDock puanları ve nispeten daha yüksek bağlanma enerjileriyle önceki deneysel verileri doğrulamıştır. Buna göre, aridanin teorik olarak doksorubisinden daha iyi bir çalışılan enzim inhibitörüdür. En yüksek inhibisyon topoizomeraz II alfa, DNA metiltransferaz ve DD-peptidaz için sırasıyla -9,9, -9,2 ve -10,9 kcal/mol bağlanma enerjileri olarak kaydedildi. Bu, aridaninin antikanser özelliğinin daha çok DNA ile ilişkili proteinlere müdahale yoluyla olabileceğini düşündürmektedir. Ek olarak, ADMET/PASS aridaninin toksik olmadığını, 0,56'lık iyi bir biyoyararlanım puanına sahip olduğunu ve birkaç farklı biyoaktivite gösterebileceğini öngörmüştür. Sonuç olarak, aridanin klinik çalışmalar için dikkate alınması gereken dirençli kanserlere ve bakterilere karşı güçlü bir kemoterapötik ajandır.

Keywords

Aridanin Doksorubisin Antikanser/Antibakteriyal Moleküler yerleştirme Moleküler dinamik

Project Number

3240328525

References

  • Abdullahi, S. H., Adamu, U., Adamu, S. G., Sani, U., & and Umar, A. B. (2022). Molecular Docking , ADMET and Pharmacokinetic properties predictions of some di-aryl Pyridinamine derivatives as Estrogen Receptor (Er+) Kinase Inhibitors. Egyptian Journal of Basic and Applied Sciences, 9(1), 180-204. https://doi.org/10.1080/2314808X.2022.2050115
  • Aderibigbe, A., Iwalewa, E. O., Adesina, K. S., & Agboola, I. O. (2011). Anxiolytic effect of aridanin isolated from Tetrapleura tetraptera in mice. International Journal of Biological and Chemical Sciences, 4. https://doi.org/10.4314/ijbcs.v4i5.65523
  • Adesina, S., Iwalewa, E. O., & Johnny, I. (2016). Tetrapleura tetraptera Taub- Ethnopharmacology, Chemistry, Medicinal and Nutritional Values- A Review. British Journal of Pharmaceutical Research, 12, 1-22. https://doi.org/10.9734/BJPR/2016/26554
  • Adesina, S. K., & Reisch, J. (1985). A triterpenoid glycoside from Tetrapleura tetraptera fruit. Phytochemistry, 24(12), 3003-3006. https://doi.org/https://doi.org/10.1016/0031-9422(85)80044-3
  • Alminderej, F., Bakari, S., Almundarij, T. I., Snoussi, M., Aouadi, K., & Kadri, A. (2020). Antioxidant Activities of a New Chemotype of Piper cubeba L. Fruit Essential Oil (Methyleugenol/Eugenol): In Silico Molecular Docking and ADMET Studies. Plants (Basel), 9(11). https://doi.org/10.3390/plants9111534
  • Altshuler, R. D., Minasian, L. M., Schweppe, C. A., & Kadan-Lottick, N. S. (2025). Chemotherapy-induced peripheral neuropathy research: a National Institutes of Health (NIH) grant portfolio analysis (2014-2023). JNCI Cancer Spectrum, 9(3). https://doi.org/10.1093/jncics/pkaf039
  • Anyamele, T., Onwuegbuchu, P. N., Ugbogu, E. A., & Ibe, C. (2023). Phytochemical composition, bioactive properties, and toxicological profile of Tetrapleura tetraptera. Bioorganic Chemistry, 131, 106288. https://doi.org/10.1016/j.bioorg.2022.106288
  • Bandyopadhyay, D., Lopez, G., Cantu, S., Balboa, S., Garcia, A., Silva, C., & Valdes, D. (2018). Key Enzymes in Cancer: Mechanism of Action and Inhibition With Anticancer Agents.
  • Başar, Y., Hosaflıoğlu, İ., & Erenler, R. (2024). Phytochemical analysis of Robinia pseudoacacia flowers and leaf: quantitative analysis of natural compounds and molecular docking application. Turkish Journal of Biodiversity, 7(1), 1-10.
  • Başar, Y., & Karadağ, M. (2024). Phytochemical Content Analysis of Different Lavandula Officinalis Extracts by LC-ESI-MS/MS and In Silico Molecular Docking Studies. Turkish Journal of Applied Sciences and Technology, 5(1), 12-22. https://doi.org/10.5281/zenodo.11237944
  • Başar, Y., Yenigün, S., Alma, M. H., Demirtas, İ., & Ozen, T. (2025). Fruit extracts of Rosa canina L. and Rosa pimpinellifolia L.: Phytochemical profiles, in vitro antioxidant, anti-inflammatory, xanthine oxidase inhibitory effects, and in silico molecular dynamics studies. Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tarım ve Doğa Dergisi, 28(3), 636-649. https://doi.org/https://doi.org/10.18016/ksutarimdoga.vi.1639294
  • Bonsou, I. N., Mbaveng, A. T., Nguenang, G. S., Chi, G. F., Kuete, V., & Efferth, T. (2022). Cytotoxicity, acute and sub-chronic toxicities of the fruit extract of Tetrapleura tetraptera (Schumm. & Thonn.) Taub. (Fabaceae). BMC Complement Med Ther, 22(1), 178. https://doi.org/10.1186/s12906-022-03659-1
  • Brogi, S., Ramalho, T. C., Kuca, K., Medina-Franco, J. L., & Valko, M. (2020). Editorial: In silico Methods for Drug Design and Discovery. Front Chem, 8, 612. https://doi.org/10.3389/fchem.2020.00612
  • Bruno, S., Bersani, M., Astore, S., Chiabotto, G., Barge, A., Binello, A., & Spyrakis, F. (2022). Lack of interaction of the fluorosurfactant C6O4 with human renal transporters: In vitro/in silico analysis. Toxicology, 476, 153257. https://doi.org/10.1016/j.tox.2022.153257
  • Chen, C., Lu, L., Yan, S., Yi, H., Yao, H., Wu, D., He, G., Tao, X., & Deng, X. (2018). Autophagy and doxorubicin resistance in cancer. Anti-Cancer Drugs, 29(1), 1-9. https://doi.org/10.1097/cad.0000000000000572
  • Chhikara, B., & Parang, K. (2022). Global Cancer Statistics 2022: The Trends Projection Analysis. Chemical Biology Letters, 10, 451.
  • Chi, G. F., Khan, S., Başar, Y., Kuete, J. R. N., Matieta, V. Y., Kuete, J. B. T., Megaptche, J. F., Chongong, M. A., Yenigün, S., Ayimele, G. A., Mbaveng, A. T., Kuete, V., & Shaheen, F. (2025). Antibacterial flavonoids from Tetrapleura tetraptera (Fabaceae) fruit pulp, in silico studies. South African Journal of Botany, 180, 96-106. https://doi.org/https://doi.org/10.1016/j.sajb.2025.02.026
  • Chi, G. F., Serab, K., N., K. J. R., Y., M. V., O., O. J., N., T. A., F., M. J., A., C. M., B., D. T., Victor, K., & and Shaheen, F. (2024). Triterpenoid saponins from the fruit pulp of Tetrapleura tetraptera (Fabaceae). Natural Product Research, 1-13. https://doi.org/10.1080/14786419.2024.2426072
  • Daina, A., Michielin, O., & Zoete, V. (2017). SwissADME: a free web tool to evaluate pharmacokinetics, drug-likeness and medicinal chemistry friendliness of small molecules. Scientific Reports, 7, 42717. https://doi.org/10.1038/srep42717
  • Darboe, S., Bradbury, R. S., Phelan, J., Kanteh, A., Muhammad, A.-K., Worwui, A., Yang, S., Nwakanma, D., Perez-Sepulveda, B., & Kariuki, S. (2022). Genomic diversity and antimicrobial resistance among non-typhoidal Salmonella associated with human disease in The Gambia. Microbial Genomics, 8(3), 000785. https://doi.org/https://doi.org/10.1099/mgen.0.000785
  • Decherchi, S., & Cavalli, A. (2020). Thermodynamics and Kinetics of Drug-Target Binding by Molecular Simulation. Chem Rev, 120(23), 12788-12833. https://doi.org/10.1021/acs.chemrev.0c00534
  • Elkaeed, E. B., Yousef, R. G., Elkady, H., Gobaara, I. M. M., Alsfouk, B. A., Husein, D. Z., Ibrahim, I. M., Metwaly, A. M., & Eissa, I. H. (2022). Design, Synthesis, Docking, DFT, MD Simulation Studies of a New Nicotinamide-Based Derivative: In Vitro Anticancer and VEGFR-2 Inhibitory Effects. Molecules, 27(14), 4606. https://www.mdpi.com/1420-3049/27/14/4606
  • Espinosa, E., Zamora, P., Feliu, J., & González Barón, M. (2003). Classification of anticancer drugs--a new system based on therapeutic targets. Cancer Treatment Reviews, 29(6), 515-523. https://doi.org/10.1016/s0305-7372(03)00116-6
  • Fulda, S. (2008). Betulinic Acid for Cancer Treatment and Prevention. International Journal of Molecular Sciences, 9(6), 1096-1107. https://www.mdpi.com/1422-0067/9/6/1096
  • Gok, M., Basar, Y., Yenigun, S., Ipek, Y., Behcet, L., Ozen, T., & Demirtas, I. (2025). Bioactive Apigenin‐7‐O‐β‐Glucoside and Rosmarinic Acid Molecules From Two Nepeta Species: Bioactivity‐Guided Isolation, In Vitro Evaluations, Pharmacokinetic and In Silico Approaches as Metabolic Enzyme Inhibition Agents. Phytochemical Analysis. https://doi.org/https://doi.org/10.1002/pca.3536
  • Gupta, N. (2022). A review on recent developments in the anticancer potential of oleanolic acid and its analogs (2017-2020). Mini Reviews in Medicinal Chemistry, 22(4), 600-616. https://doi.org/10.2174/1389557521666210810153627
  • Hafezi, S., & Rahmani, M. (2021). Targeting BCL-2 in Cancer: Advances, Challenges, and Perspectives. Cancers, 13(6). https://doi.org/10.3390/cancers13061292
  • Horchani, M., Heise, N. V., Csuk, R., Ben Jannet, H., Harrath, A. H., & Romdhane, A. (2022). Synthesis and In Silico Docking Study towards M-Pro of Novel Heterocyclic Compounds Derived from Pyrazolopyrimidinone as Putative SARS-CoV-2 Inhibitors. Molecules, 27(16). https://doi.org/10.3390/molecules27165303
  • İpek, Y., Yunus, B., Semiha, Y., Lütfi, B., Tevfik, Ö., & and Demirtaş, İ. In vitro bioactivities and in silico enzyme interactions of abietatrien-3β-ol by bio-guided isolation from Nepeta italica subsp. italica. Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, 1-24. https://doi.org/10.1080/07391102.2024.2322626
  • Kamdem Kengne, M. H., Gertrude Laura, F., Silihe, K., More, G., Mphahlele, M., Moswetsa, T., Tata, C., Tonga, J., Ojo, O., Thierry, F., Mmutlane, E., & Ndinteh, D. (2022). Cytotoxic and antibacterial activities of compounds isolated from the fruits and stem-bark of Tetrapleura tetraptera (Schumach. & Thonn.) Taub. (Fabaceae). Medicinal Chemistry Research, 31. https://doi.org/10.1007/s00044-022-02956-1
  • Kaur, J., Singh, H., & Sethi, T. (2024). Emerging trends in antimicrobial resistance in bloodstream infections: multicentric longitudinal study in India (2017–2022). The Lancet Regional Health - Southeast Asia, 26. https://doi.org/10.1016/j.lansea.2024.100412
  • Kim, D. W., & Cha, C. J. (2021). Antibiotic resistome from the One-Health perspective: understanding and controlling antimicrobial resistance transmission. Exp Mol Med, 53(3), 301-309. https://doi.org/10.1038/s12276-021-00569-z
  • Kohanski, M. A., Dwyer, D. J., & Collins, J. J. (2010). How antibiotics kill bacteria: from targets to networks. Nature Reviews: Microbiology, 8(6), 423-435. https://doi.org/10.1038/nrmicro2333
  • Kumar, S., Ahmad, M., Waseem, M., & Pandey, A. K. (2015). Drug Targets for Cancer Treatment: An Overview. Medicinal Chemistry, 5. https://doi.org/10.4172/2161-0444.1000252
  • Kumari, R., Kumar, R., Consortium, O. S. D. D., & Lynn, A. (2014). g_mmpbsa A GROMACS tool for high-throughput MM-PBSA calculations. Journal of chemical information and modeling, 54(7), 1951-1962.
  • Lagunin, A., Stepanchikova, A., Filimonov, D., & Poroikov, V. (2000). PASS: prediction of activity spectra for biologically active substances. Bioinformatics, 16(8), 747-748. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/16.8.747
  • Lao, J., Madani, J., Puértolas, T., Alvarez, M., Hernández, A., Pazo-Cid, R., Artal, A., & Antón Torres, A. (2013). Liposomal Doxorubicin in the treatment of breast cancer patients: a review. J Drug Deliv, 2013, 456409. https://doi.org/10.1155/2013/456409
  • Lin, J. H. (2016). Review structure- and dynamics-based computational design of anticancer drugs. Biopolymers, 105(1), 2-9. https://doi.org/10.1002/bip.22744
  • Liu, X., Shi, D., Zhou, S., Liu, H., Liu, H., & Yao, X. (2018). Molecular dynamics simulations and novel drug discovery. Expert Opin Drug Discov, 13(1), 23-37. https://doi.org/10.1080/17460441.2018.1403419
  • Majewski, M., Ruiz Carmona, S., & Barril, X. (2019). An investigation of structural stability in protein-ligand complexes reveals the balance between order and disorder. Communications Chemistry, 2, 1-8. https://doi.org/10.1038/s42004-019-0205-5
  • Marvalim, C., Datta, A., & Lee, S. C. (2023). Role of p53 in breast cancer progression: An insight into p53 targeted therapy. Theranostics, 13(4), 1421-1442. https://doi.org/10.7150/thno.81847
  • Mbaveng, A. T., Chi, G. F., Bonsou, I. N., Abdelfatah, S., Tamfu, A. N., Yeboah, E. M. O., Kuete, V., & Efferth, T. (2020). N-acetylglycoside of oleanolic acid (aridanin) displays promising cytotoxicity towards human and animal cancer cells, inducing apoptotic, ferroptotic and necroptotic cell death. Phytomedicine, 76, 153261. https://doi.org/10.1016/j.phymed.2020.153261
  • Mbaveng, A. T., Chi, G. F., Bonsou, I. N., Ombito, J. O., Yeboah, S. O., Kuete, V., & Efferth, T. (2021). Cytotoxic phytochemicals from the crude extract of Tetrapleura tetraptera fruits towards multi-factorial drug resistant cancer cells. J Ethnopharmacol, 267, 113632. https://doi.org/10.1016/j.jep.2020.113632
  • Meredith, A. M., & Dass, C. R. (2016). Increasing role of the cancer chemotherapeutic doxorubicin in cellular metabolism. Journal of Pharmacy and Pharmacology, 68(6), 729-741. https://doi.org/10.1111/jphp.12539
  • Micallef, I., & Baron, B. (2020). Doxorubicin: An Overview of the Anti-Cancer and Chemoresistance Mechanisms OPEN ACCESS. 3, 1031.
  • Namba-Nzanguim, C. T., Simoben, C. V., Bekono, B. D., Tietjen, I., Cassel, J., Salvino, J. M., Montaner, L. J., Davis, R. A., & Ntie-Kang, F. (2024). Investigation of some plant stilbenoids and their fragments for the identification of inhibitors of SARS-CoV-2 viral spike/ACE2 protein binding. The Microbe, 3, 100059. https://doi.org/https://doi.org/10.1016/j.microb.2024.100059
  • Okeke, I. N., de Kraker, M. E. A., Van Boeckel, T. P., Kumar, C. K., Schmitt, H., Gales, A. C., Bertagnolio, S., Sharland, M., & Laxminarayan, R. (2024). The scope of the antimicrobial resistance challenge. The Lancet, 403(10442), 2426-2438. https://doi.org/10.1016/S0140-6736(24)00876-6
  • Ooi, K. X., Poo, C. L., Subramaniam, M., Cordell, G. A., & Lim, Y. M. (2023). Maslinic acid exerts anticancer effects by targeting cancer hallmarks. Phytomedicine, 110, 154631. https://doi.org/10.1016/j.phymed.2022.154631
  • Qian, S., Wei, Z., Yang, W., Huang, J., Yang, Y., & Wang, J. (2022). The role of BCL-2 family proteins in regulating apoptosis and cancer therapy. Frontiers in Oncology, 12, 985363. https://doi.org/10.3389/fonc.2022.985363
  • Rapaport, D. (2004). The Art of Molecular Dynamics Simulaton. The Art of Molecular Dynamics Simulation. https://doi.org/10.1017/CBO9780511816581
  • Rehman, M. T., AlAjmi, M. F., Hussain, A., Rather, G. M., & Khan, M. A. (2019). High-Throughput Virtual Screening, Molecular Dynamics Simulation, and Enzyme Kinetics Identified ZINC84525623 as a Potential Inhibitor of NDM-1. International Journal of Molecular Sciences, 20(4). https://doi.org/10.3390/ijms20040819
  • Siegel, R. L., Miller, K. D., Wagle, N. S., & Jemal, A. (2023). Cancer statistics, 2023. CA: A Cancer Journal for Clinicians, 73(1), 17-48. https://doi.org/10.3322/caac.21763
  • Sikam, K., Ntabo, V., Happi, G., Meikeu, L., & Wansi, J. (2022). Chemistry and pharmacological aspects of Aridanin, a lead compound from Tetrapleura tetraptera (Fabaceae). Natural Resources for Human Health, 3. https://doi.org/10.53365/nrfhh/152273
  • Sikam, K. G., Happi, G. M., Ahmed, S. A., Wakeu, B. N. K., Meikeu, L. Z., Salau, S., & Wansi, J. D. (2022). In vitro antiplasmodial, molecular docking and pharmacokinetics studies of specialized metabolites from Tetrapleura tetraptera (Fabaceae). South African Journal of Botany, 151, 949-959. https://doi.org/https://doi.org/10.1016/j.sajb.2022.11.021
  • Spencer, A. C., & Panda, S. S. (2023). DNA Gyrase as a Target for Quinolones. Biomedicines, 11(2)., 1-15. https://doi.org/10.3390/biomedicines11020371
  • Taiwo, B. J., Olubiyi, O. O., Wang, X., Fisusi, F. A., Akinniyi, G. A., Van Heerden, F. R., & Strodel, B. (2018). Schistosomiasis: Snail-vector control, molecular modelling and dynamic studies of bioactive N-acetylglycoside saponins from Tetrapleura tetraptera. Comput Biol Chem, 77, 363-372. https://doi.org/10.1016/j.compbiolchem.2018.09.011
  • Tang, Z.-Y., Li, Y., Tang, Y.-T., Ma, X.-D., & Tang, Z.-Y. (2022). Anticancer activity of oleanolic acid and its derivatives: Recent advances in evidence, target profiling and mechanisms of action. Biomedicine and Pharmacotherapy, 145, 112397. https://doi.org/https://doi.org/10.1016/j.biopha.2021.112397
  • Velazquez-Meza, M. E., Galarde-López, M., Carrillo-Quiróz, B., & Alpuche-Aranda, C. M. (2022). Antimicrobial resistance: One Health approach. Vet World, 15(3), 743-749. https://doi.org/10.14202/vetworld.2022.743-749
  • Wang, W., Albadari, N., Du, Y., Fowler, J. F., Sang, H. T., Xian, W., McKeon, F., Li, W., Zhou, J., & Zhang, R. (2024). MDM2 Inhibitors for Cancer Therapy: The Past, Present, and Future. Pharmacological Reviews, 76(3), 414-453. https://doi.org/10.1124/pharmrev.123.001026
  • WHO. (2024). WHO bacterial priority pathogens list, 2024: bacterial pathogens of public health importance, to guide research, development, and strategies to prevent and control antimicrobial resistance. World Health Organization.
  • Wojciechowski, M., Milewski, S., Mazerski, J., & Borowski, E. (2005). Glucosamine-6-phosphate synthase, a novel target for antifungal agents. Molecular modelling studies in drug design. Acta Biochimica Polonica, 52(3), 647-653.
  • Ye, F., Ma, P., Zhang, Y. Y., Li, P., Yang, F., & Fu, Y. (2018). Herbicidal Activity and Molecular Docking Study of Novel ACCase Inhibitors. Frontiers of Plant Science, 9, 1850. https://doi.org/10.3389/fpls.2018.01850
  • Yenigun, S., Yunus, B., Yasar, I., Lutfi, B., Ibrahim, D., & and Ozen, T. (2024a). Comprehensive evaluation of Ixoroside: An iridoid glycoside from Nepeta aristata and N. baytopii, assessing antioxidant, antimicrobial, enzyme inhibitory, DNA protective properties, with computational and pharmacokinetic analyses. Journal of Biologically Active Products from Nature, 14(3), 286-315. https://doi.org/10.1080/22311866.2024.2358785
  • Yenigun, S., Yunus, B., Yasar, I., Lutfi, B., Ibrahim, D., & and Ozen, T. (2024b). DNA protection, molecular docking, molecular dynamic, enzyme inhibition, and kinetics studies of apigenin isolated from Nepeta baytopii Hedge & Lamond by bioactivity-guided fractionation. Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, 1-12. https://doi.org/10.1080/07391102.2024.2442753
  • Yenigün, S., Başar, Y., Yılmaz, S., Demirtas, İ., & Ozen, T. (2024c). Phytochemical Contents and Antioxidant Activity Paliurus Spina-Christi Miller Leaf and Seed Extracts: PASS Predictions, In Silico Studies on Xanthine Oxidase and Cytochrome P450 1A1. Current Perspectives on Medicinal and Aromatic Plants, 7(2), 96-106. https://doi.org/10.38093/cupmap.1516991
  • Yoshino, T., Shiina, H., Urakami, S., Kikuno, N., Yoneda, T., Shigeno, K., & Igawa, M. (2006). Bcl-2 expression as a predictive marker of hormone-refractory prostate cancer treated with taxane-based chemotherapy. Clin Cancer Res, 12(20 Pt 1), 6116-6124. https://doi.org/10.1158/1078-0432.Ccr-06-0147
  • Yousef, R. G., Albaraa, I., M., K. M., M., E. W., M., G. I. M., M., M. A. B., B., E. E., A., A. A., M., M. A., & and Eissa, I. H. (2022). Discovery of new nicotinamides as apoptotic VEGFR-2 inhibitors: virtual screening, synthesis, anti-proliferative, immunomodulatory, ADMET, toxicity, and molecular dynamic simulation studies. Journal of Enzyme Inhibition and Medicinal Chemistry, 37(1), 1389-1403. https://doi.org/10.1080/14756366.2022.2070744
  • Zhang, C., Wang, X., Du, J., Gu, Z., & Zhao, Y. (2021). Reactive Oxygen Species-Regulating Strategies Based on Nanomaterials for Disease Treatment. Adv Sci (Weinh), 8(3), 2002797. https://doi.org/10.1002/advs.202002797
  • Zhang, Z., Wang, G., Li, Y., Lei, D., Xiang, J., Ouyang, L., Wang, Y., & Yang, J. (2022). Recent progress in DNA methyltransferase inhibitors as anticancer agents. Frontiers in Pharmacology, 13, 1072651. https://doi.org/10.3389/fphar.2022.1072651
  • Zhao, Y., Yu, H., & Hu, W. (2014). The regulation of MDM2 oncogene and its impact on human cancers. Acta Biochim Biophys Sin (Shanghai), 46(3), 180-189. https://doi.org/10.1093/abbs/gmt147
  • Zheng, K., Dong, Y., Yang, R., Liang, Y., Wu, H., & He, Z. (2021). Regulation of ferroptosis by bioactive phytochemicals: Implications for medical nutritional therapy. Pharmacological Research, 168, 105580. https://doi.org/10.1016/j.phrs.2021.105580
  • Znati, M., Bordes, C., Forquet, V., Lantéri, P., Ben Jannet, H., & Bouajila, J. (2019). Synthesis, molecular properties, anti-inflammatory and anticancer activities of novel 3-hydroxyflavone derivatives. Bioorganic Chemistry, 89, 103009. https://doi.org/10.1016/j.bioorg.2019.103009

In Silico Prediction of Aridanin as a Potential Anticancer and Antibacterial Agent

Year 2026, Volume: 29 Issue: 2, 265 - 284, 21.01.2026

Chi Godloves Fru , Yunus Başar , Melvis Akwen Chongong , Semiha Yenigün , G. Aponglen Ayimele , İbrahim Demirtas

https://doi.org/10.18016/ksutarimdoga.vi.1623765
https://izlik.org/JA95BW98JH

Abstract

Aridanin, 3-O-[β-D-glucopyranosyl-(2’-acetamido)]-3β-olean-12-en-28-oic acid, isolated from Tetrapleura tetraptera, is reported to have good potential for use as an anticancer drug, especially against resistant cancers. In an in-silico study, the binding modes of aridanin/doxorubicin and 6 enzymes involved in cancer chemotherapy, as well as 3 antibacterial enzymes, were investigated. Also, predictions on its possible bioactivities and pharmacokinetic properties were made. Aridanin/doxorubicin enzyme interactions were determined using molecular docking and molecular dynamics simulations to attempt an explanation for its anticancer activity. Predictions of bioactivity, pharmacokinetic properties, and bioavailability scores of the molecule were calculated using PASS, SwissADME, and pKCSM. The results corroborated previous experimental data, with MolDock scores comparable to those of the standard drug and relatively higher binding energies. Accordingly, aridanin theoretically is a better inhibitor of the studied enzymes than doxorubicin. The highest inhibition recorded binding energies of -9.9, -9.2, and -10.9 kcal/mol for topoisomerase II alpha, DNA methyltransferase, and DD-peptidase, respectively. This suggests that aridanin’s anticancer property may be more through interference with DNA-related proteins. In addition, ADMET/PASS anticipated that aridanin is not toxic, has a good bioavailability score of 0.56, and may display several different bioactivities. Consequently, aridanin is a potent chemotherapeutic agent against resistant cancers and bacteria that should be considered for clinical studies.

Keywords

Aridanin Doxorubicin Anticancer/Antibacterial Molecular docking Molecular dynamics

Project Number

3240328525

Thanks

We acknowledge support from TÜBİTAK through grant no: 3240328525. We are also thankful to Pr. Dr. Shaheen F. and the ICCBS where the spectra were recorded.

References

  • Abdullahi, S. H., Adamu, U., Adamu, S. G., Sani, U., & and Umar, A. B. (2022). Molecular Docking , ADMET and Pharmacokinetic properties predictions of some di-aryl Pyridinamine derivatives as Estrogen Receptor (Er+) Kinase Inhibitors. Egyptian Journal of Basic and Applied Sciences, 9(1), 180-204. https://doi.org/10.1080/2314808X.2022.2050115
  • Aderibigbe, A., Iwalewa, E. O., Adesina, K. S., & Agboola, I. O. (2011). Anxiolytic effect of aridanin isolated from Tetrapleura tetraptera in mice. International Journal of Biological and Chemical Sciences, 4. https://doi.org/10.4314/ijbcs.v4i5.65523
  • Adesina, S., Iwalewa, E. O., & Johnny, I. (2016). Tetrapleura tetraptera Taub- Ethnopharmacology, Chemistry, Medicinal and Nutritional Values- A Review. British Journal of Pharmaceutical Research, 12, 1-22. https://doi.org/10.9734/BJPR/2016/26554
  • Adesina, S. K., & Reisch, J. (1985). A triterpenoid glycoside from Tetrapleura tetraptera fruit. Phytochemistry, 24(12), 3003-3006. https://doi.org/https://doi.org/10.1016/0031-9422(85)80044-3
  • Alminderej, F., Bakari, S., Almundarij, T. I., Snoussi, M., Aouadi, K., & Kadri, A. (2020). Antioxidant Activities of a New Chemotype of Piper cubeba L. Fruit Essential Oil (Methyleugenol/Eugenol): In Silico Molecular Docking and ADMET Studies. Plants (Basel), 9(11). https://doi.org/10.3390/plants9111534
  • Altshuler, R. D., Minasian, L. M., Schweppe, C. A., & Kadan-Lottick, N. S. (2025). Chemotherapy-induced peripheral neuropathy research: a National Institutes of Health (NIH) grant portfolio analysis (2014-2023). JNCI Cancer Spectrum, 9(3). https://doi.org/10.1093/jncics/pkaf039
  • Anyamele, T., Onwuegbuchu, P. N., Ugbogu, E. A., & Ibe, C. (2023). Phytochemical composition, bioactive properties, and toxicological profile of Tetrapleura tetraptera. Bioorganic Chemistry, 131, 106288. https://doi.org/10.1016/j.bioorg.2022.106288
  • Bandyopadhyay, D., Lopez, G., Cantu, S., Balboa, S., Garcia, A., Silva, C., & Valdes, D. (2018). Key Enzymes in Cancer: Mechanism of Action and Inhibition With Anticancer Agents.
  • Başar, Y., Hosaflıoğlu, İ., & Erenler, R. (2024). Phytochemical analysis of Robinia pseudoacacia flowers and leaf: quantitative analysis of natural compounds and molecular docking application. Turkish Journal of Biodiversity, 7(1), 1-10.
  • Başar, Y., & Karadağ, M. (2024). Phytochemical Content Analysis of Different Lavandula Officinalis Extracts by LC-ESI-MS/MS and In Silico Molecular Docking Studies. Turkish Journal of Applied Sciences and Technology, 5(1), 12-22. https://doi.org/10.5281/zenodo.11237944
  • Başar, Y., Yenigün, S., Alma, M. H., Demirtas, İ., & Ozen, T. (2025). Fruit extracts of Rosa canina L. and Rosa pimpinellifolia L.: Phytochemical profiles, in vitro antioxidant, anti-inflammatory, xanthine oxidase inhibitory effects, and in silico molecular dynamics studies. Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tarım ve Doğa Dergisi, 28(3), 636-649. https://doi.org/https://doi.org/10.18016/ksutarimdoga.vi.1639294
  • Bonsou, I. N., Mbaveng, A. T., Nguenang, G. S., Chi, G. F., Kuete, V., & Efferth, T. (2022). Cytotoxicity, acute and sub-chronic toxicities of the fruit extract of Tetrapleura tetraptera (Schumm. & Thonn.) Taub. (Fabaceae). BMC Complement Med Ther, 22(1), 178. https://doi.org/10.1186/s12906-022-03659-1
  • Brogi, S., Ramalho, T. C., Kuca, K., Medina-Franco, J. L., & Valko, M. (2020). Editorial: In silico Methods for Drug Design and Discovery. Front Chem, 8, 612. https://doi.org/10.3389/fchem.2020.00612
  • Bruno, S., Bersani, M., Astore, S., Chiabotto, G., Barge, A., Binello, A., & Spyrakis, F. (2022). Lack of interaction of the fluorosurfactant C6O4 with human renal transporters: In vitro/in silico analysis. Toxicology, 476, 153257. https://doi.org/10.1016/j.tox.2022.153257
  • Chen, C., Lu, L., Yan, S., Yi, H., Yao, H., Wu, D., He, G., Tao, X., & Deng, X. (2018). Autophagy and doxorubicin resistance in cancer. Anti-Cancer Drugs, 29(1), 1-9. https://doi.org/10.1097/cad.0000000000000572
  • Chhikara, B., & Parang, K. (2022). Global Cancer Statistics 2022: The Trends Projection Analysis. Chemical Biology Letters, 10, 451.
  • Chi, G. F., Khan, S., Başar, Y., Kuete, J. R. N., Matieta, V. Y., Kuete, J. B. T., Megaptche, J. F., Chongong, M. A., Yenigün, S., Ayimele, G. A., Mbaveng, A. T., Kuete, V., & Shaheen, F. (2025). Antibacterial flavonoids from Tetrapleura tetraptera (Fabaceae) fruit pulp, in silico studies. South African Journal of Botany, 180, 96-106. https://doi.org/https://doi.org/10.1016/j.sajb.2025.02.026
  • Chi, G. F., Serab, K., N., K. J. R., Y., M. V., O., O. J., N., T. A., F., M. J., A., C. M., B., D. T., Victor, K., & and Shaheen, F. (2024). Triterpenoid saponins from the fruit pulp of Tetrapleura tetraptera (Fabaceae). Natural Product Research, 1-13. https://doi.org/10.1080/14786419.2024.2426072
  • Daina, A., Michielin, O., & Zoete, V. (2017). SwissADME: a free web tool to evaluate pharmacokinetics, drug-likeness and medicinal chemistry friendliness of small molecules. Scientific Reports, 7, 42717. https://doi.org/10.1038/srep42717
  • Darboe, S., Bradbury, R. S., Phelan, J., Kanteh, A., Muhammad, A.-K., Worwui, A., Yang, S., Nwakanma, D., Perez-Sepulveda, B., & Kariuki, S. (2022). Genomic diversity and antimicrobial resistance among non-typhoidal Salmonella associated with human disease in The Gambia. Microbial Genomics, 8(3), 000785. https://doi.org/https://doi.org/10.1099/mgen.0.000785
  • Decherchi, S., & Cavalli, A. (2020). Thermodynamics and Kinetics of Drug-Target Binding by Molecular Simulation. Chem Rev, 120(23), 12788-12833. https://doi.org/10.1021/acs.chemrev.0c00534
  • Elkaeed, E. B., Yousef, R. G., Elkady, H., Gobaara, I. M. M., Alsfouk, B. A., Husein, D. Z., Ibrahim, I. M., Metwaly, A. M., & Eissa, I. H. (2022). Design, Synthesis, Docking, DFT, MD Simulation Studies of a New Nicotinamide-Based Derivative: In Vitro Anticancer and VEGFR-2 Inhibitory Effects. Molecules, 27(14), 4606. https://www.mdpi.com/1420-3049/27/14/4606
  • Espinosa, E., Zamora, P., Feliu, J., & González Barón, M. (2003). Classification of anticancer drugs--a new system based on therapeutic targets. Cancer Treatment Reviews, 29(6), 515-523. https://doi.org/10.1016/s0305-7372(03)00116-6
  • Fulda, S. (2008). Betulinic Acid for Cancer Treatment and Prevention. International Journal of Molecular Sciences, 9(6), 1096-1107. https://www.mdpi.com/1422-0067/9/6/1096
  • Gok, M., Basar, Y., Yenigun, S., Ipek, Y., Behcet, L., Ozen, T., & Demirtas, I. (2025). Bioactive Apigenin‐7‐O‐β‐Glucoside and Rosmarinic Acid Molecules From Two Nepeta Species: Bioactivity‐Guided Isolation, In Vitro Evaluations, Pharmacokinetic and In Silico Approaches as Metabolic Enzyme Inhibition Agents. Phytochemical Analysis. https://doi.org/https://doi.org/10.1002/pca.3536
  • Gupta, N. (2022). A review on recent developments in the anticancer potential of oleanolic acid and its analogs (2017-2020). Mini Reviews in Medicinal Chemistry, 22(4), 600-616. https://doi.org/10.2174/1389557521666210810153627
  • Hafezi, S., & Rahmani, M. (2021). Targeting BCL-2 in Cancer: Advances, Challenges, and Perspectives. Cancers, 13(6). https://doi.org/10.3390/cancers13061292
  • Horchani, M., Heise, N. V., Csuk, R., Ben Jannet, H., Harrath, A. H., & Romdhane, A. (2022). Synthesis and In Silico Docking Study towards M-Pro of Novel Heterocyclic Compounds Derived from Pyrazolopyrimidinone as Putative SARS-CoV-2 Inhibitors. Molecules, 27(16). https://doi.org/10.3390/molecules27165303
  • İpek, Y., Yunus, B., Semiha, Y., Lütfi, B., Tevfik, Ö., & and Demirtaş, İ. In vitro bioactivities and in silico enzyme interactions of abietatrien-3β-ol by bio-guided isolation from Nepeta italica subsp. italica. Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, 1-24. https://doi.org/10.1080/07391102.2024.2322626
  • Kamdem Kengne, M. H., Gertrude Laura, F., Silihe, K., More, G., Mphahlele, M., Moswetsa, T., Tata, C., Tonga, J., Ojo, O., Thierry, F., Mmutlane, E., & Ndinteh, D. (2022). Cytotoxic and antibacterial activities of compounds isolated from the fruits and stem-bark of Tetrapleura tetraptera (Schumach. & Thonn.) Taub. (Fabaceae). Medicinal Chemistry Research, 31. https://doi.org/10.1007/s00044-022-02956-1
  • Kaur, J., Singh, H., & Sethi, T. (2024). Emerging trends in antimicrobial resistance in bloodstream infections: multicentric longitudinal study in India (2017–2022). The Lancet Regional Health - Southeast Asia, 26. https://doi.org/10.1016/j.lansea.2024.100412
  • Kim, D. W., & Cha, C. J. (2021). Antibiotic resistome from the One-Health perspective: understanding and controlling antimicrobial resistance transmission. Exp Mol Med, 53(3), 301-309. https://doi.org/10.1038/s12276-021-00569-z
  • Kohanski, M. A., Dwyer, D. J., & Collins, J. J. (2010). How antibiotics kill bacteria: from targets to networks. Nature Reviews: Microbiology, 8(6), 423-435. https://doi.org/10.1038/nrmicro2333
  • Kumar, S., Ahmad, M., Waseem, M., & Pandey, A. K. (2015). Drug Targets for Cancer Treatment: An Overview. Medicinal Chemistry, 5. https://doi.org/10.4172/2161-0444.1000252
  • Kumari, R., Kumar, R., Consortium, O. S. D. D., & Lynn, A. (2014). g_mmpbsa A GROMACS tool for high-throughput MM-PBSA calculations. Journal of chemical information and modeling, 54(7), 1951-1962.
  • Lagunin, A., Stepanchikova, A., Filimonov, D., & Poroikov, V. (2000). PASS: prediction of activity spectra for biologically active substances. Bioinformatics, 16(8), 747-748. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/16.8.747
  • Lao, J., Madani, J., Puértolas, T., Alvarez, M., Hernández, A., Pazo-Cid, R., Artal, A., & Antón Torres, A. (2013). Liposomal Doxorubicin in the treatment of breast cancer patients: a review. J Drug Deliv, 2013, 456409. https://doi.org/10.1155/2013/456409
  • Lin, J. H. (2016). Review structure- and dynamics-based computational design of anticancer drugs. Biopolymers, 105(1), 2-9. https://doi.org/10.1002/bip.22744
  • Liu, X., Shi, D., Zhou, S., Liu, H., Liu, H., & Yao, X. (2018). Molecular dynamics simulations and novel drug discovery. Expert Opin Drug Discov, 13(1), 23-37. https://doi.org/10.1080/17460441.2018.1403419
  • Majewski, M., Ruiz Carmona, S., & Barril, X. (2019). An investigation of structural stability in protein-ligand complexes reveals the balance between order and disorder. Communications Chemistry, 2, 1-8. https://doi.org/10.1038/s42004-019-0205-5
  • Marvalim, C., Datta, A., & Lee, S. C. (2023). Role of p53 in breast cancer progression: An insight into p53 targeted therapy. Theranostics, 13(4), 1421-1442. https://doi.org/10.7150/thno.81847
  • Mbaveng, A. T., Chi, G. F., Bonsou, I. N., Abdelfatah, S., Tamfu, A. N., Yeboah, E. M. O., Kuete, V., & Efferth, T. (2020). N-acetylglycoside of oleanolic acid (aridanin) displays promising cytotoxicity towards human and animal cancer cells, inducing apoptotic, ferroptotic and necroptotic cell death. Phytomedicine, 76, 153261. https://doi.org/10.1016/j.phymed.2020.153261
  • Mbaveng, A. T., Chi, G. F., Bonsou, I. N., Ombito, J. O., Yeboah, S. O., Kuete, V., & Efferth, T. (2021). Cytotoxic phytochemicals from the crude extract of Tetrapleura tetraptera fruits towards multi-factorial drug resistant cancer cells. J Ethnopharmacol, 267, 113632. https://doi.org/10.1016/j.jep.2020.113632
  • Meredith, A. M., & Dass, C. R. (2016). Increasing role of the cancer chemotherapeutic doxorubicin in cellular metabolism. Journal of Pharmacy and Pharmacology, 68(6), 729-741. https://doi.org/10.1111/jphp.12539
  • Micallef, I., & Baron, B. (2020). Doxorubicin: An Overview of the Anti-Cancer and Chemoresistance Mechanisms OPEN ACCESS. 3, 1031.
  • Namba-Nzanguim, C. T., Simoben, C. V., Bekono, B. D., Tietjen, I., Cassel, J., Salvino, J. M., Montaner, L. J., Davis, R. A., & Ntie-Kang, F. (2024). Investigation of some plant stilbenoids and their fragments for the identification of inhibitors of SARS-CoV-2 viral spike/ACE2 protein binding. The Microbe, 3, 100059. https://doi.org/https://doi.org/10.1016/j.microb.2024.100059
  • Okeke, I. N., de Kraker, M. E. A., Van Boeckel, T. P., Kumar, C. K., Schmitt, H., Gales, A. C., Bertagnolio, S., Sharland, M., & Laxminarayan, R. (2024). The scope of the antimicrobial resistance challenge. The Lancet, 403(10442), 2426-2438. https://doi.org/10.1016/S0140-6736(24)00876-6
  • Ooi, K. X., Poo, C. L., Subramaniam, M., Cordell, G. A., & Lim, Y. M. (2023). Maslinic acid exerts anticancer effects by targeting cancer hallmarks. Phytomedicine, 110, 154631. https://doi.org/10.1016/j.phymed.2022.154631
  • Qian, S., Wei, Z., Yang, W., Huang, J., Yang, Y., & Wang, J. (2022). The role of BCL-2 family proteins in regulating apoptosis and cancer therapy. Frontiers in Oncology, 12, 985363. https://doi.org/10.3389/fonc.2022.985363
  • Rapaport, D. (2004). The Art of Molecular Dynamics Simulaton. The Art of Molecular Dynamics Simulation. https://doi.org/10.1017/CBO9780511816581
  • Rehman, M. T., AlAjmi, M. F., Hussain, A., Rather, G. M., & Khan, M. A. (2019). High-Throughput Virtual Screening, Molecular Dynamics Simulation, and Enzyme Kinetics Identified ZINC84525623 as a Potential Inhibitor of NDM-1. International Journal of Molecular Sciences, 20(4). https://doi.org/10.3390/ijms20040819
  • Siegel, R. L., Miller, K. D., Wagle, N. S., & Jemal, A. (2023). Cancer statistics, 2023. CA: A Cancer Journal for Clinicians, 73(1), 17-48. https://doi.org/10.3322/caac.21763
  • Sikam, K., Ntabo, V., Happi, G., Meikeu, L., & Wansi, J. (2022). Chemistry and pharmacological aspects of Aridanin, a lead compound from Tetrapleura tetraptera (Fabaceae). Natural Resources for Human Health, 3. https://doi.org/10.53365/nrfhh/152273
  • Sikam, K. G., Happi, G. M., Ahmed, S. A., Wakeu, B. N. K., Meikeu, L. Z., Salau, S., & Wansi, J. D. (2022). In vitro antiplasmodial, molecular docking and pharmacokinetics studies of specialized metabolites from Tetrapleura tetraptera (Fabaceae). South African Journal of Botany, 151, 949-959. https://doi.org/https://doi.org/10.1016/j.sajb.2022.11.021
  • Spencer, A. C., & Panda, S. S. (2023). DNA Gyrase as a Target for Quinolones. Biomedicines, 11(2)., 1-15. https://doi.org/10.3390/biomedicines11020371
  • Taiwo, B. J., Olubiyi, O. O., Wang, X., Fisusi, F. A., Akinniyi, G. A., Van Heerden, F. R., & Strodel, B. (2018). Schistosomiasis: Snail-vector control, molecular modelling and dynamic studies of bioactive N-acetylglycoside saponins from Tetrapleura tetraptera. Comput Biol Chem, 77, 363-372. https://doi.org/10.1016/j.compbiolchem.2018.09.011
  • Tang, Z.-Y., Li, Y., Tang, Y.-T., Ma, X.-D., & Tang, Z.-Y. (2022). Anticancer activity of oleanolic acid and its derivatives: Recent advances in evidence, target profiling and mechanisms of action. Biomedicine and Pharmacotherapy, 145, 112397. https://doi.org/https://doi.org/10.1016/j.biopha.2021.112397
  • Velazquez-Meza, M. E., Galarde-López, M., Carrillo-Quiróz, B., & Alpuche-Aranda, C. M. (2022). Antimicrobial resistance: One Health approach. Vet World, 15(3), 743-749. https://doi.org/10.14202/vetworld.2022.743-749
  • Wang, W., Albadari, N., Du, Y., Fowler, J. F., Sang, H. T., Xian, W., McKeon, F., Li, W., Zhou, J., & Zhang, R. (2024). MDM2 Inhibitors for Cancer Therapy: The Past, Present, and Future. Pharmacological Reviews, 76(3), 414-453. https://doi.org/10.1124/pharmrev.123.001026
  • WHO. (2024). WHO bacterial priority pathogens list, 2024: bacterial pathogens of public health importance, to guide research, development, and strategies to prevent and control antimicrobial resistance. World Health Organization.
  • Wojciechowski, M., Milewski, S., Mazerski, J., & Borowski, E. (2005). Glucosamine-6-phosphate synthase, a novel target for antifungal agents. Molecular modelling studies in drug design. Acta Biochimica Polonica, 52(3), 647-653.
  • Ye, F., Ma, P., Zhang, Y. Y., Li, P., Yang, F., & Fu, Y. (2018). Herbicidal Activity and Molecular Docking Study of Novel ACCase Inhibitors. Frontiers of Plant Science, 9, 1850. https://doi.org/10.3389/fpls.2018.01850
  • Yenigun, S., Yunus, B., Yasar, I., Lutfi, B., Ibrahim, D., & and Ozen, T. (2024a). Comprehensive evaluation of Ixoroside: An iridoid glycoside from Nepeta aristata and N. baytopii, assessing antioxidant, antimicrobial, enzyme inhibitory, DNA protective properties, with computational and pharmacokinetic analyses. Journal of Biologically Active Products from Nature, 14(3), 286-315. https://doi.org/10.1080/22311866.2024.2358785
  • Yenigun, S., Yunus, B., Yasar, I., Lutfi, B., Ibrahim, D., & and Ozen, T. (2024b). DNA protection, molecular docking, molecular dynamic, enzyme inhibition, and kinetics studies of apigenin isolated from Nepeta baytopii Hedge & Lamond by bioactivity-guided fractionation. Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, 1-12. https://doi.org/10.1080/07391102.2024.2442753
  • Yenigün, S., Başar, Y., Yılmaz, S., Demirtas, İ., & Ozen, T. (2024c). Phytochemical Contents and Antioxidant Activity Paliurus Spina-Christi Miller Leaf and Seed Extracts: PASS Predictions, In Silico Studies on Xanthine Oxidase and Cytochrome P450 1A1. Current Perspectives on Medicinal and Aromatic Plants, 7(2), 96-106. https://doi.org/10.38093/cupmap.1516991
  • Yoshino, T., Shiina, H., Urakami, S., Kikuno, N., Yoneda, T., Shigeno, K., & Igawa, M. (2006). Bcl-2 expression as a predictive marker of hormone-refractory prostate cancer treated with taxane-based chemotherapy. Clin Cancer Res, 12(20 Pt 1), 6116-6124. https://doi.org/10.1158/1078-0432.Ccr-06-0147
  • Yousef, R. G., Albaraa, I., M., K. M., M., E. W., M., G. I. M., M., M. A. B., B., E. E., A., A. A., M., M. A., & and Eissa, I. H. (2022). Discovery of new nicotinamides as apoptotic VEGFR-2 inhibitors: virtual screening, synthesis, anti-proliferative, immunomodulatory, ADMET, toxicity, and molecular dynamic simulation studies. Journal of Enzyme Inhibition and Medicinal Chemistry, 37(1), 1389-1403. https://doi.org/10.1080/14756366.2022.2070744
  • Zhang, C., Wang, X., Du, J., Gu, Z., & Zhao, Y. (2021). Reactive Oxygen Species-Regulating Strategies Based on Nanomaterials for Disease Treatment. Adv Sci (Weinh), 8(3), 2002797. https://doi.org/10.1002/advs.202002797
  • Zhang, Z., Wang, G., Li, Y., Lei, D., Xiang, J., Ouyang, L., Wang, Y., & Yang, J. (2022). Recent progress in DNA methyltransferase inhibitors as anticancer agents. Frontiers in Pharmacology, 13, 1072651. https://doi.org/10.3389/fphar.2022.1072651
  • Zhao, Y., Yu, H., & Hu, W. (2014). The regulation of MDM2 oncogene and its impact on human cancers. Acta Biochim Biophys Sin (Shanghai), 46(3), 180-189. https://doi.org/10.1093/abbs/gmt147
  • Zheng, K., Dong, Y., Yang, R., Liang, Y., Wu, H., & He, Z. (2021). Regulation of ferroptosis by bioactive phytochemicals: Implications for medical nutritional therapy. Pharmacological Research, 168, 105580. https://doi.org/10.1016/j.phrs.2021.105580
  • Znati, M., Bordes, C., Forquet, V., Lantéri, P., Ben Jannet, H., & Bouajila, J. (2019). Synthesis, molecular properties, anti-inflammatory and anticancer activities of novel 3-hydroxyflavone derivatives. Bioorganic Chemistry, 89, 103009. https://doi.org/10.1016/j.bioorg.2019.103009
There are 72 citations in total.

Details

Primary Language English
Subjects Plant Biochemistry, Pharmacology and Pharmaceutical Sciences (Other)
Journal Section Research Article
Authors

Chi Godloves Fru 0000-0002-1484-3995

Yunus Başar 0000-0002-7785-3242

Melvis Akwen Chongong 0009-0002-3641-040X

Semiha Yenigün 0000-0002-1979-5427

G. Aponglen Ayimele 0000-0002-1070-1236

İbrahim Demirtas 0000-0001-8946-647X

Project Number 3240328525
Submission Date January 24, 2025
Acceptance Date June 16, 2025
Early Pub Date January 21, 2026
Publication Date January 21, 2026
DOI https://doi.org/10.18016/ksutarimdoga.vi.1623765
IZ https://izlik.org/JA95BW98JH
Published in Issue Year 2026 Volume: 29 Issue: 2

Cite

APA Godloves Fru, C., Başar, Y., Chongong, M. A., Yenigün, S., Ayimele, G. A., & Demirtas, İ. (2026). In Silico Prediction of Aridanin as a Potential Anticancer and Antibacterial Agent. Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tarım Ve Doğa Dergisi, 29(2), 265-284. https://doi.org/10.18016/ksutarimdoga.vi.1623765

Aim & Scope

2024-JIF = 0.500, 2024-JCI = 0.140,  Category Quartile = Q4, ICV-2022: 71.05

Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tarım ve Doğa Dergisi (Journal of Agricultural and Natural), uluslararası hakemli bir dergidir.

Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Fen ve Mühendislik Dergisi 1997 yılında yayın hayatına başlamış olup, 1999 yılı hariç bugüne kadar aralıksız yılda 2 sayı halinde hakemli ve danışma kurullu olarak yayın hayatına devam etmiştir.


Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Fen ve Mühendislik Dergisi, 2009 yılından itibaren format, vizyon ve misyonunda köklü değişikliğe giderek, çağın ve uluslararası bilim dünyasının gereklerini yerine getirme görevi içinde yeniden yapılanmıştır. Bu amaçla 2009 yılından itibaren "Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Doğa Bilimleri Dergisi" ve "Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Mühendislik Bilimleri Dergisi" olmak üzere iki ayrı elektronik dergi olarak yılda 2 sayı çıkarılmıştır.

Dergimiz yoğun ilgiden dolayı 2011 yılından itibaren yılda 4 sayı olarak yayınlanmıştır. 2018 yılından itibaren ise dergimizin adı “KSÜ Tarım ve Doğa Dergisi” olarak değiştirilmiş ve yılda 6 sayı olarak yayınlanmaya başlanmıştır.

Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tarım ve Doğa Dergisi (Journal of Agricultural and Natural), Açık Dergi Sistemi (Open Journal System;OJS) ile araştırma makalelerin on-line olarak kabul etmekte tüm sayılarındaki makalenin sınırsız erişim kolaylıkları ile paydaşların hizmetine sunmaktadır. Bilindiği gibi Açık Dergi Sistemleri abonelik ile dağılım sistemlerine göre ulusal ve uluslar arası ölçekte tüm okuyuculara daha nitelikli izleme olanakları sunarak makalelerin etki düzeyini de arttırmaktadır. OJS sistemleri ayrıca indeksleme, tekrar erişim, serbest erişim, çoğaltma gibi hususlar bakımından araştırmacılara kolaylıkla sunmaktadır.

Ulusal ve uluslararası düzeyde makale kabul eden dergimiz uluslararası kabule sahip SCI- Expanded vb. gibi indekslerde taranmak için gerekli şartları yerine getirmeye çalışmaktadır. Dergimiz 2017 yılından itibaren, Web of Science ve Emerging Sources Citation Index tarafından taranmaya başlanmıştır. Bundan sonraki yayın hayatında, bilimsellik ve etik kuralları çerçevesinde yoluna devam edecek olan dergimiz, siz değerli bilim adamı ve okuyucularının Türkçe ve İngilizce olarak yazılmış bilimsel araştırmalarını; makale, editöre not ve araştırma notu şeklinde yayınlamaya devam edecektir.

Dergimizde basılan makalelere araştırmacıların yapacağı atıflar, dergilerimizin ulusal ve uluslararası indekslerce taranması ve kabul görmesi açısından çok önemlidir.


Açık Erişim Politikası

KSÜ Tarım ve Doğa Dergisi, tamamen ücretsiz, uluslararası hakemli ve açık erişimli bir dergidir. Makale işlem ücreti (değerlendirme ücreti veya basım ücreti) ve makalelere erişim için abonelik ücreti talep etmez.

Editöryal Süreç

KSÜ Tarım ve Doğa Dergisi, tüm çalışmaların değerlendirme sürecinde çifte körleme yöntemini kullanmaktadır. Çift körleme yönteminde çalışmaların yazar ve hakem kimlikleri gizlenmektedir.

Editörler; dergi yayın politikalarında yer alan "Kör Hakemlik ve Değerlendirme Süreci" politikalarını uygulamakla yükümlüdür. Bu bağlamda editörler her çalışmanın adil, tarafsız ve zamanında değerlendirme sürecinin tamamlanmasını sağlar.

İntihal Denetimi

KSÜ Tarım ve Doğa Dergisi, yayın etiği gereği "Kör Hakemlik Değerlendirme Süreci"nden geçmiş her çalışmanın bütünlüğünü korumak adına intihal denetiminden geçirilmesini zorunlu kılar. Bu kapsamda her çalışmanın Türkçe ve İngilizce nüshaları intihal denetiminden geçirilir. Denetim kapsamında oluşan maddi sorumlulular yazar(lar)a aittir.

Editörlerin Etik Görev ve Sorumlulukları

KSÜ Tarım ve Doğa Dergisi, editör ve bölüm editörleri, açık erişim olarak Committee on Publication Ethics (COPE) tarafından yayınlanan "COPE Code of Conduct and Best Practice Guidelines for Journal Editors" ve "COPE Best Practice Guidelines for Journal Editors" rehberleri temelinde etik görev ve sorumluluklara sahip olduklarını taahhüt ederler.

Kapsam

Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tarım ve Doğa Dergisi (Journal of Agricultural and Natural), uluslar arası hakemli bir dergi olup, Tarım ve Biyoloji ile ilgili tüm alanlarında özgün, yeni ve bilimsel değere sahip orijinal araştırma makaleleri yayımlamaktadır.


01.08.2022 tarihinden itibaren yazım kuralları güncellenmiştir.

Gönderilecek makaleler aşağıdaki yazım kılavuzuna göre hazırlanmış olmalıdır.



DERGİ YAYIN İLKELERİ ve YAZIM KURALLARINI PDF FORMATINDA İNDİRMEK İÇİN TIKLAYIN


YAYIN POLİTİKASI

  • KSÜ Tarım ve Doğa Dergisi, COPE tarafından hazırlanan Dergi Editörleri için Yönerge (The COPE Code of Conduct for Journal Editors) hükümlerine uymayı kabul ve taahhüt etmiştir.

  • Açık Erişim Politikası: Tarım ve Doğa Dergisi tamamen ücretsiz, uluslararası hakemli ve açık erişimli bir dergidir.

  • Makale işlem ücreti (değerlendirme ücreti veya basım ücreti) ve makalelere erişim için abonelik ücreti talep etmez.

  • Gizlilik Beyanı: Tarım ve Doğa Dergisi yönetim sistemine girilen isim ve elektronik posta adresleri gibi kişisel bilgiler, yalnızca bu derginin bilimsel amaçları doğrultusunda kullanılacaktır. Bu bilgiler başka bir amaç veya bölüm için kullanılmayacak olup, üçüncü taraflarla paylaşılmayacaktır.

  • Etik ilkeler: Derginin editöryal ve yayın süreçleri International Committee of Medical Journal Editors (ICMJE), World Association of Medical Editors (WAME), Council of Science Editors (CSE), Committee on Publication Ethics (COPE), European Association of Science Editors (EASE) ve National Information Standards Organization (NISO) kılavuzlarına uygun olarak biçimlendirilmiştir. KSÜ Tarım ve Doğa Dergisinin editöryal ve yayın süreçleri, Akademik Yayıncılıkta Şeffaflık ve En İyi Uygulama (doaj.org/bestpractice) ilkelerine uygun olarak yürütülmektedir.

  • Arşivleme: Tarım ve Doğa Dergisi’nde yayınlan tüm makaleler TÜBİTAK ULAKBİM Yaşam Bilimleri Veritabanı aracılığıyla pdf formatında ULAKBİM sunucularında saklanmakta ve sunulmaktadır.

  • Sponsorluk ve Reklam: Tarım ve Doğa Dergisi yayın politikaları kapmasında sponsorluk ve reklam kabul etmemektedir.

  • Telif Hakkı Devri: Yayınlanmak üzere Tarım ve Doğa Dergisi'ne gönderilen çalışmalar, daha önce herhangi bir şekilde tam metin olarak yayınlanmamış veya herhangi bir yere yayınlanmak üzere gönderilmemiş özgün çalışma niteliği taşımalıdır. Yazarlar çalışmalarının telif hakkından feragat etmeyi kabul ederek, değerlendirme için gönderimle birlikte çalışmalarının telif hakkını Tarım ve Doğa Dergisi'ne devretmek zorundadır. Tarım ve Doğa Dergisi Yayın Kurulu makalenin yayımlanması konusunda yetkili kılınır. Tarım ve Doğa Dergisi 'ne çalışma gönderecek yazarlar, "Telif Hakkı Devir Formu" belgesini doldurmalıdır. Yazar(lar) doldurdukları formu ıslak imza ile imzalamalıdır. İmzalanan form taranarak sistem üzerinden çalışma gönderim adımlarının 4.’sünde ek dosya yükleme seçeneği ile yüklenmelidir. Telif Hakkı Devir Formunu iletmeyen yazarların çalışmaları yayınlanmaz.

  • Yazarlar makale sonunda “Araştırmacıların katkı oranı beyanı” ve “yazar çatışma beyanı” konusunda bilgi vermek zorundadır.

  • Kör Hakemlik ve Değerlendirme Süreci: Kör hakemlik, bilimsel yayınların en yüksek kalite ile yayınlanması için uygulanan bir yöntemdir. Bu yöntem, bilimsel çalışmaların nesnel (objektif) bir şekilde değerlendirilme sürecinin temelini oluşturmaktadır ve birçok bilimsel dergi tarafından tercih edilmektedir. Hakem görüşleri, Tarım ve Doğa Dergisi’nin yayın kalitesinde belirleyici bir yere sahiptir. Tarım ve Doğa Dergisi'ne gönderilen tüm çalışmalar aşağıda belirtilen aşamalara göre körleme yoluyla değerlendirilmektedir.

  • Körleme Hakemlik Türü: Tarım ve Doğa Dergisi, tüm çalışmaların değerlendirme sürecinde çifte körleme yöntemini kullanmaktadır. Çift körleme yönteminde çalışmaların yazar ve hakem kimlikleri gizlenmektedir.

  • İlk Değerlendirme Süreci: Tarım ve Doğa Dergisi'e gönderilen çalışmalar ilk olarak editörler tarafından değerlendirilir. Bu aşamada, derginin amaç ve kapsamına uymayan, Türkçe ve İngilizce olarak dil ve anlatım kuralları açısından zayıf, bilimsel açıdan kritik hatalar içeren, özgün değeri olmayan ve yayın politikalarını karşılamayan çalışmalar reddedilir. Reddedilen çalışmaların yazarları, gönderim tarihinden itibaren en geç iki hafta içerisinde bilgilendirilir. Uygun bulunan çalışmalar ise ön değerlendirme için çalışmanın ilgili olduğu alana yönelik bir Bölüm editörüne gönderilir.

  • Ön Değerlendirme Süreci: Ön değerlendirme sürecinde bölüm editörleri çalışmaların, giriş, materyal ve metod, bulgular, sonuç, değerlendirme ve tartışma bölümlerini dergi yayın politikaları ve kapsamı ile özgünlük açısından ayrıntılı bir şekilde inceler. Bu inceleme sonucunda uygun bulunmayan çalışmalar en geç dört hafta içerisinde bölüm editörü değerlendirme raporu ile birlikte iade edilir.

  • Hakemlendirme Süreci: Çalışmalar içeriğine ve hakemlerin uzmanlık alanlarına göre hakemlere gönderilir. Çalışmayı inceleyen bölüm editörü, Tarım ve Doğa Dergisi hakem havuzundan uzmanlık alanlarına göre en az iki hakem önerisinde bulunur veya çalışmanın alanına uygun yeni hakem önerebilir. Makale hakemlerinin her birinin farklı kurumlardan olmasına ve hakemlerle aynı kurumdan olmamasına özen gösterilir. Bölüm editöründen gelen hakem önerileri editörler tarafından değerlendirilir ve çalışmalar hakemlere iletilir. Hakemler değerlendirdikleri çalışmalar hakkındaki hiçbir süreci ve belgeyi paylaşmayacakları hakkında garanti vermek zorundadır.

  • Hakem Değerlendirme Süreci: Hakem değerlendirme süreci için hakemlere verilen süre 4 haftadır. Hakemlerden veya editörlerden gelen düzeltme önerilerinin yazarlar tarafından 1 ay içerisinde tamamlanması zorunludur. Hakemler bir çalışmanın düzeltmelerini inceleyerek uygunluğuna karar verebilecekleri gibi gerekliyse birden çok defa düzeltme talep edebilir. Değerlendirme Sonucu Hakemlerden gelen görüşler, Bölüm editörü tarafından en geç 2 hafta içerisinde incelenir. Bu inceleme sonucunda Bölüm editörü çalışmaya ilişkin nihai kararını editörlere iletir.

  • Yayın Kurulu Kararı: Editörler, Bölüm editörü ve hakem görüşlerine dayanarak çalışma ile ilgili yayın kurulu görüşlerini hazırlar. Hazırlanan görüşler editör tarafından Bölüm editörü ve hakem önerileri ile birlikte en geç 1 hafta içerisinde yazar(lar)a iletilir. Bu süreçte olumsuz görüş verilen çalışmalar intihal denetimi talep edilmeksizin iade edilir.

  • Makale Gönderme: Tarım ve Doğa Dergisi'de değerlendirilmek üzere çalışma gönderecek yazar(lar) https://dergipark.org.tr/ksudobil adresinde yer alan dergi yönetim sistemine üye olarak gönderim gerçekleştirebilir.

  • Yazarlar: Yazar(lar)ın yayınlanmış, erken görünüm veya değerlendirme aşamasındaki çalışmasıyla ilgili bir yanlış ya da hatayı fark etmesi durumunda, geri çekme işlemlerinde dergi editörüyle işbirliği yapma yükümlülüğü bulunmaktadır.

  • Makalelerin Geri Çekilmesi: Değerlendirme aşamasındaki çalışmasını geri çekme talebinde bulunmak isteyen yazar(lar), makale geri çekme talebini içeren dilekçeyi her bir yazarın ıslak imzası ile imzalanmış ve taratılmış halini dogabilimleri@ksu.edu.tr adresi üzerinden e-posta aracılığıyla yayın kuruluna iletmekle yükümlüdür. Yayın Kurulu geri çekme bildirimini inceleyerek en geç bir hafta içerisinde dönüş sağlar. Yayın kurulu tarafından telif hakları Tarım ve Doğa Dergisi gönderim aşamasında devredilmiş çalışmaların geri çekme isteği onaylanmadıkça yazarlar çalışmasını başka bir dergiye değerlendirme için gönderemezler.

  • Editörler: Tarım ve Doğa Dergisi yayın kurulu; yayınlanmış, basım aşamasındaki veya değerlendirme aşamasındaki bir çalışmaya ilişkin telif hakkı ve intihal şüphesi oluşması durumunda çalışmayı ilişkin bir soruşturma başlatma yükümlülüğü taşır. Yayın kurulu yapılan soruşturma sonucunda değerlendirme aşamasındaki çalışmada telif hakkı ve intihal yapıldığını tespit etmesi durumunda çalışmayı değerlendirmeden geri çeker ve tespit edilen durumları detaylı bir şekilde kaynak göstererek yazarlara iade eder. Yayın kurulu, yayınlanmış veya baskı halindeki bir çalışmada telif hakkı ihlali ve intihal yapıldığını tespit etmesi durumunda, en geç bir hafta içerisinde aşağıdaki geri çekme ve bildiri işlemlerini gerçekleştirir.

Dergimiz, herhangi bir başvuru veya yayımlama ücreti almamaktadır (Free submission and publication).

Citation Indexes

TR Dizin
Emerging Sources Citation Index (ESCI)

Other Indexes

Online Journal Platform and Indexing Association
Web of Science
Crossref
Worldcat
Index Copernicus
DRJI
TR-DİZİN
CAB Abstract

Dergi Editörler Kurulu

Mustafa Küsek
Mustafa KÜSEK
Phytopathology, Plant Bacteriology in Agriculture
Rabia Albayrak Delialioğlu
Rabia ALBAYRAK DELİALİOĞLU
Data Analysis, Biostatistics, Computational Statistics, Statistical Analysis, Statistical Experiment Design, Applied Statistics, Animal Science, Genetics and Biostatistics
İrfan Ersin Akıncı
İrfan Ersin AKINCI
ResearcherID: V-5036-2017
Horticultural Production, Vegetable Growing and Treatment
Burhan Arslan
Burhan ARSLAN
Agricultural, Veterinary and Food Sciences, Industrial Crops, Medicinal and Aromatic Plants
Sabahattin Cömertpay
Sabahattin CÖMERTPAY
Biological Sciences, Cancer Biology, Health Sciences
Default avatar
Mustafa Abdullah YILMAZ
Plant Biochemistry, Analytical Biochemistry, Pharmacology and Pharmaceutical Sciences, Pharmaceutical Analytical Chemistry, Instrumental Methods, Metabolomic Chemistry
Ali Kaygısız
Ali KAYGISIZ
ksü ziraat fak. öğretim üyesi. Tarım ve Doğa Dergisi Editörü
Animal Biotechnology, Zootechny, Stock Farming and Treatment, Animal Growth and Development, Poultry Farming and Treatment, Sheep and Goat Breeding and Treatment
İsmail Akyol
İsmail AKYOL
Animal Science, Genetics and Biostatistics
Ali Çaylı
Ali ÇAYLI
Agricultural Engineering, Biosystem, Agricultural Structures
Kerim Mesut Çimrin
Kerim Mesut ÇİMRİN
Plant Nutrition and Soil Fertility
Tugay Ayaşan
Tugay AYAŞAN
Animal Feeding
Levent Bat
Levent BAT
Ecotoxicology
Köksal Karadaş
Köksal KARADAŞ
G-7994-2018
Agricultural Economics, Agricultural Marketing, Agricultural, Veterinary and Food Sciences, Farm Enterprises, Agricultural Policy, Agribusiness
Default avatar
Oğuz Ayhan KİREÇCİ
Stres Fizyolojisi, Antioksidan Sistem, Sinyal Molekülleri, Tıbbı ve aromatik bitkiler, Bitki fizyolojisi, Bitki Biyokimyası
Biological Sciences, Plant Biochemistry, Plant Physiology, Pharmacology and Pharmaceutical Sciences, Agricultural, Veterinary and Food Sciences
Default avatar
Ayşe Dilek ÖZŞAHİN
Biological Sciences, Biochemistry and Cell Biology
Ömer Akbulut
Ömer AKBULUT
Zootechny, Stock Farming and Treatment, Genetically Modified Animals
Kadyrbai Chekirov
Kadyrbai CHEKİROV
Genotoxicity and Cytotoxicity, Industrial Molecular Engineering of Nucleic Acids and Proteins, Cytogenetic, Molecular Genetics, Animal Biotechnology, Animal Cell and Molecular Biology, Vertebrate Biology, Animal Biotechnology in Agriculture
Murat Kütük
Murat KÜTÜK
Animal Systematics and Taxonomy, Entomology, Invertebrate Biology
Ahmet Levent İnanç
Ahmet Levent İNANÇ
Food Sciences
Parisa Lotfollahi
Parisa LOTFOLLAHİ
Entomology, Entomology in Agriculture, Forest Entomology and Forest Protection
Ön Kontrol Editörü
Ön Kontrol EDİTÖRÜ
Biological Sciences, Mathematical Sciences, Agricultural, Veterinary and Food Sciences, Food Sciences
Default avatar
Nuran TAPKI
Agribusiness
Selami Selvi
Selami SELVİ

Prof. Dr. Selami SELVİ, Çanakkale Onsekizmart Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Biyoloji Bölümünden 2002 yılında  mezun olmuştur. Balıkesir Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Biyoloji Bölümü Botanik ABD’de 2003-2005 yılları arasında yüksek lisansını, aynı enstitüde 2005-2011 yılları arasında doktorasını tamamlamıştır. Halen Balıkesir Üniversitesi Altınoluk Meslek Yüksekokulu Bitkisel ve Hayvansal Üretim Bölümünde Öğretim üyesi olarak akademik hayatına devam etmektedir. Bitki Morfolojisi ve Anatomisi, Bitki Sistematiği, Bitki Ekolojisi Etnobotanik, Etnofarmakoloji ve Bitki Biyokimyası üzerine çalışmalar yapmaktadır.
Biological Sciences, Plant Biochemistry, Plant Morphology and Anatomy, Ethobotany, Ecology, Plant and Fungus Systematics and Taxonomy, Pharmacognosy, Pharmaceutical Botany
Ali Kaygısız
Ali KAYGISIZ

AK
Zootechny, Stock Farming and Treatment, Animal Growth and Development, Sheep and Goat Breeding and Treatment
Ersen Aydın Yağmur
Ersen Aydın YAĞMUR
Animal Systematics and Taxonomy
Saliha Çoruh
Saliha ÇORUH
Entomology, Entomology in Agriculture
Default avatar
Önder TÜRKMEN
Vegetable Growing and Treatment
Default avatar
Hüseyin GÖZÜBENLİ
Cereals and Legumes
Soner Soylu
Soner SOYLU
Prof. Dr. Soner Soylu, Lisans eğitimini 1990 yılında Çukurova Üniversitesi Ziraat Fakültesi, Bitki Koruma Bölümünde, doktora eğitimini ise 1998 yılında Wye College (Imperial College), University of London, İngiltere’de tamamlamıştır. Hatay Mustafa Kemal Üniversitesi Ziraat Fakültesi Bitki Koruma Bölümü'nde 1998 yılından itibaren Öğretim Üyesi ve Araştırmacı olarak görev yapmaktadır.

Kültür bitkilerinde sorun olan fungal ve bakteriyel hastalık etmenlerin irdelendiği Bitki Patolojisi alanında araştırma deneyimine sahip olup, birçok yüksek lisans ve doktora tezine ve çalışmasına danışmanlık yapmıştır.

Bitki patojeni bakteri ve fungal hastalık etmenlerinin moleküler ve morfolojik tanılanmaları, bitki uçucu yağ ve özütler gibi doğal antimikrobiyal maddelerin antimikrobiyal etkinliği, fungal ve bakteriyel bitki hastalık etmenlerine karşı teşvik edilmiş dayanıklılık, faydalı antagonist fungal ve bakteriyel etmenler ile fungal ve bakteriyel patojenlerin biyolojik kontrolü, bitki büyümesini teşvik eden endofitik ve epifitik bakteri izolatları (PGPB) ve bitki patojeni ile bitki savunma mekanizmaları arasındaki moleküler, biyokimyasal ve morfolojik etkileşimlerin karakterizasyonu konularında saygın dergilerde yayınlanmış çok sayıda araştırma makalesi, kitap bölümü ve konferans bildirileri bulunmaktadır. Çeşitli konularda yayınlanmış araştırma makaleleri dünya genelinde kapsamlı bir şekilde atıf almış ve Tarım Bilimleri alanında ilgili dergi kategorisinde "En Çok Atıf Alan Makaleler" arasında yer almıştır.

Özellikle, çeşitli bitkilerdeki sorun tohum, toprak ve hava kökenli fungal ve bakteriyel hastalıklar, külleme, mildiyö, pas gibi obligat hastalık etmenlerinin morfolojik ve moleküler tanımlanmasında uzmandır. Soylu’nun Türkiye için farklı konukçu bitkilerde sorun olan fungal ve bakteriyel hastalık etmenlerinin ilk kez patojen olduğu konusunda bildirimleri bulunmaktadır.

AB, TÜBİTAK, Üniversite, TAGEM, Kalkınma Bakanlığı gibi kuruluşlar tarafından destekli birçok projede yürütücü, yardımcı araştırıcı ve danışman olarak görev yapmış/yapmaktadır.

Türkiye'de ilk kez doğrudan çiftçiye hastalık, zararlı ve yabancı otlarla ilgili sorunlarına çözüm hizmeti sunan "Bitki Sağlığı Kliniği'nin kuruluşunda yer almıştır.

Alanında saygın ve prestijli birçok dergide Baş Editör, Yayın Kurulu Üyesi ve Hakem olarak görev yapmaktadır.
Plant Pathology, Phytopathology, Plant Protection (Other), Plant Bacteriology in Agriculture
Default avatar
Mehtap TUĞRAK SAKARYA
Pharmacology and Pharmaceutical Sciences, Pharmaceutical Chemistry, Molecular Medicine
Negar Tebrizli
Negar TEBRİZLİ
Plant Physiology, Agricultural Engineering (Other), Agronomy, Pasture-Meadow Forage Plants, Fertilisers and Application, Organic Agriculture

Dergi Sahibi

Default avatar
Alptekin YASIM
Cardiovascular Surgery, Health Sciences

Baş Editör

dergi

Ali Kaygısız
Ali KAYGISIZ

AK
Zootechny, Stock Farming and Treatment, Animal Growth and Development, Sheep and Goat Breeding and Treatment

Editörler

İrfan Ersin Akıncı
İrfan Ersin AKINCI
Horticultural Production, Vegetable Growing and Treatment
Sakine Serap Avgın
Sakine Serap AVGIN
Biological Sciences
İsmail Akyol
İsmail AKYOL
Genetically Modified Animals
Mustafa Küsek
Mustafa KÜSEK
Phytopathology, Plant Bacteriology in Agriculture
Ali Kaygısız
Ali KAYGISIZ
Zootechny, Stock Farming and Treatment, Animal Growth and Development, Sheep and Goat Breeding and Treatment
Kerim Mesut Çimrin
Kerim Mesut ÇİMRİN
Plant Nutrition and Soil Fertility
Burhan Arslan
Burhan ARSLAN
Field Crops and Pasture Production
Mustafa Yıldırım
Mustafa YILDIRIM
Cereals and Legumes
Ali Çaylı
Ali ÇAYLI
Agricultural Structures

Alan Editörleri

Hikmet Orhan
Hikmet ORHAN

Uygulamalı istatistik, Varyans Unsurları, Regresyon ve korelasyon, Varyans Analizi -F testi, Parametrik ve parametrik olmayan testler, Biyoistatistik
Animal Science, Genetics and Biostatistics
Levent Bat
Levent BAT
Hydrobiology
Ahmet Levent İnanç
Ahmet Levent İNANÇ
Food Sciences
Şenol Çelik
Şenol ÇELİK

1969 yılında Konya'nın Ilgın ilçesinde doğdu. 1988 yılında başladığı Anadolu Üniversitesi Fen-Edb. Fakültesi İstatistik bölümünden 1992 yılında mezun oldu. 1991-1992 öğretim yılında aynı üniversitede Eğitim Fakültesi'nde Öğretmenlik Sertifikası Programı (Pedagojik Formasyon) eğitimi aldı. 1993-1994 yıllarında yedek subay olarak askerlik hizmetini yerine getirdi. 1997 Haziran-2014 Ocak döneminde devlet memurluğu görevini yürüttü.

Devlet memurluğu esnasında; 1997-1998 yıllarında Ankara Türkiye İstatistik Kurumu'nda Hizmetiçi İstatistik eğitimi aldı ve bu eğitimi 1. olarak bitirdi. 2003 yılında Ortadoğu Teknik Üniversitesi (ODTU) 'nde Uygulamalı İstatistik eğitimi aldı.

2001-2003 yılları arası Ankara Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü İstatistik Anabilim Dalında Tezsiz Yüksek Lisans, 2004-2006 yılları arası Ankara Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü İstatistik Anabilim Dalında Tezli Yüksek Lisans eğitimini tamamladı.

2008-2013 yılları arası Ankara Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Zootekni Anabilim Dalı Biyometri ve Genetik Dalında Doktora eğitimini tamamladı. 2013 yılında Dr. ünvanını aldı. "Zaman Serileri Analizi ve Trafik Kazası Verilerine Uygulanması" isimli doktora tezi en yüksek yayın puanı alan tez ilan edildi ve ödüle layık görüldü.

2014 yılı Ocak ayında Bingöl Üniversitesi Ziraat Fakültesi Zootekni Bölümü'ne Yrd. Doç. Dr. olarak atandı. 2020 yılında Zootekni bilim dalı Biyometri ve Genetik Anabilim dalında Doçent ünvanını aldı.

2023 ve 2024 yıllarında ABD Stanford Üniversitesi'nin yaptığı araştırma sonucuna göre "Dünyanın en etkili bilim insanları” sıralamasına girdi ve bu listenin yüzde 2’lik dilim içerisinde yer aldı.
Animal Science, Genetics and Biostatistics
Köksal Karadaş
Köksal KARADAŞ
G-7994-2018
Agricultural Economics
Parisa Lotfollahi
Parisa LOTFOLLAHİ
Entomology, Entomology in Agriculture
Tugay Ayaşan
Tugay AYAŞAN
Animal Feeding
Sabahattin Cömertpay
Sabahattin CÖMERTPAY
Agricultural Biotechnology
Default avatar
Nuran TAPKI
Agribusiness
Default avatar
Ayşe Dilek ÖZŞAHİN
Biological Sciences, Biochemistry and Cell Biology
Default avatar
Oğuz Ayhan KİREÇCİ
Stres Fizyolojisi, Antioksidan Sistem, Sinyal Molekülleri, Tıbbı ve aromatik bitkiler, Bitki fizyolojisi, Bitki Biyokimyası
Plant Physiology

Danışmanlar Kurulu

Tugay Ayaşan
Tugay AYAŞAN
Animal Feeding
Default avatar
Yeşim MENDİ
Green-House Growing and Treatment
Khalıd Mahmood Khavar
Khalıd Mahmood KHAVAR
Field Crops and Pasture Production
Default avatar
Jose ZANUNCİO
Entomology
Eslam Faid-allah
Eslam FAİD-ALLAH
Biostatistics, Sheep and Goat Breeding and Treatment, Genetically Modified Animals
İlhami Gülçin
İlhami GÜLÇİN
Medicinal and Biomolecular Chemistry
Default avatar
Hakan BÜYÜKÇAPAR
Saravanan Vivekanandarajah
Saravanan VİVEKANANDARAJAH
Ethobotany, Pharmacognosy, Pharmaceutical Botany, Basic Pharmacology, Natural Products and Bioactive Compounds, Phytotherapy, Medicinal Plants, Food Chemistry and Food Sensory Science, Medicinal and Aromatic Plants
Default avatar
Mohammed H ABU-DİEYEH
Biological Sciences, Plant Protection (Other), Plant Biotechnology in Agriculture
Default avatar
Abdulmojeed YAKUBU
Stock Farming and Treatment
Thobela Louis Tyası
Thobela Louis TYASI
Stock Farming and Treatment
Default avatar
Wayne Allan GARDNER
Entomology
Default avatar
Mohammad TARİQ
Sheep and Goat Breeding and Treatment
Nazım Şekeroğlu
Nazım ŞEKEROĞLU
Medicinal and Aromatic Plants
Mehdi Rahimi
Mehdi RAHİMİ
Plant Biotechnology in Agriculture
Default avatar
Daniel ZABORSKİ
Biostatistics, Animal Feeding
Fatih Satıl
Fatih SATIL
Plant Morphology and Anatomy
Mahfuz Elmastaş
Mahfuz ELMASTAŞ
Medical Biochemistry and Metabolomics
Default avatar
Khairulmazmi AHMAD
Plant Protection
Alisa Pîrlog
Alisa PîRLOG
Stock Farming and Treatment
Default avatar
Fikri BALTA
Pomology and Treatment
Murat Kütük
Murat KÜTÜK
Animal Systematics and Taxonomy, Entomology, Invertebrate Biology
Default avatar
Kadir YILMAZ
Default avatar
Stanisaw HURUK
Animal Physiology-Ecophysiology
Default avatar
Ramazan MERAL
Agricultural, Veterinary and Food Sciences
Default avatar
Khalid JAVED
Stock Farming and Treatment
Default avatar
Adel Salah KHATTAB
Stock Farming and Treatment
Default avatar
Hüseyin SÜZEK
Health Sciences
Default avatar
Vytautas TAMUTIS
Entomology
İbrahim Yılmaz
İbrahim YILMAZ
Agricultural Economics, Agricultural Marketing, Agricultural Economics, Agribusiness, Agricultural Land Management
Larisa Caısın
Larisa CAISIN
Animal Feeding, Animal Biotechnology in Agriculture
Default avatar
Rüştü HATİPOĞLU
Plant Biotechnology in Agriculture, Pasture-Meadow Forage Plants, Crop and Pasture Breeding
Navid Ghavi Hossein-zadeh
Navid GHAVİ HOSSEİN-ZADEH
Stock Farming and Treatment, Animal Feeding
Default avatar
Ahmad SALAMA
Food Sciences


International Peer Reviewed Journal
Free submission and publication
Published 6 times a year



88x31.png


KSU Journal of Agriculture and Nature

e-ISSN: 2619-9149