Research Article
BibTex RIS Cite

Türk Aspir (Carthamus tinctorius L.) Genotiplerinde Genetik Çeşitliliğin iPBS Retrotranspozon Belirteçleri Kullanılarak Değerlendirilmesi

Year 2026, Issue: Advanced Online Publication, 955 - 967, 27.02.2026
https://doi.org/10.18016/ksutarimdoga.vi.1728043
https://izlik.org/JA67CZ66PT

Abstract

Aspir (Carthamus tinctorius L.), tarımsal ve tıbbi açıdan önemli, kuraklığa dayanıklı bir yağlı tohum bitkisidir. Genetik çeşitliliğinin anlaşılması, geliştirilmiş çeşitlerin elde edilmesi ve yerel gen kaynaklarının korunması açısından büyük önem taşımaktadır. Bu çalışmada, Türkiye’ye ait 8 kültür çeşidi ve 25 yerel çeşit olmak üzere toplam 33 aspir genotipi, 12 inter-primer binding site (iPBS) retrotranspozon markörü kullanılarak karakterize edilmiştir. Toplam 124 bant amplifiye edilmiş ve bunların 120’si (%96.77) polimorfik bulunmuştur. Primer başına alel sayısı 4 ile 22 arasında değişmiş olup, ortalama 10 olarak belirlenmiştir. Ortalama Polimorfik Bilgi İçeriği (PIC) 0.19, etkili alel sayısı (Ne) 1.30, Shannon Bilgi İndeksi (I) 1.31 ve Çözünürlük Gücü (Rp) ise 7.01 olarak tespit edilmiştir. Jaccard benzerlik katsayılarına dayalı kümeleme analizi, genotipleri UPGMA yöntemi ile dört ana kümeye ayırmış ve benzerlik değerleri 0.24 ile 0.85 arasında değişmiştir. Temel Koordinat Analizi (PCoA), ilk iki koordinatın toplam varyasyonun %68.21’ini açıklamasıyla kümeleme sonuçlarını desteklemiştir. PCoA ve UPGMA desenleri arasındaki uyum, iPBS markörlerinin aspir genotiplerini ayırt etmedeki güvenilirliğini doğrulamaktadır. Genel olarak, elde edilen bulgular, iPBS retrotranspozon markörlerinin Türk aspir materyali arasında anlamlı genetik çeşitliliği ortaya koymadaki etkinliğini göstermekte ve ıslah çalışmaları ile gen kaynaklarının yönetimi için değerli bir moleküler kaynak sunmaktadır.

References

  • Ahmadi, A. J., & Ahmadikhah, A. (2022). Occurrence of simple sequence repeats in cDNA sequences of safflower (Carthamus tinctorius) reveals the importance of SSR-containing genes for cell biology and dynamic response to environmental cues. Frontiers in Plant Science, 13, 991107. https://doi.org/10.3389/fpls.2022.991107
  • Ali, F., Yılmaz, A., Nadeem, M. A., Habyarimana, E., Subaşı, I., Nawaz, M. A., Çaudray, H.C., Şahid, M.K., Ercişli, S., Ziya, M.E.B., Chung, G., & Baloch, F. S. (2019). Mobile genomic element diversity in world collection of safflower (Carthamus tinctorius L.) panel using iPBS-retrotransposon markers. PloS one, 14 (2), e0211985. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0211985
  • Arslan, Y., Katar, D., Güneylioğlu, H., Subaşı, İ., Şahin, B., & Bülbül, A. S. (2010). Türkiye Florasındaki Yabani Carthamus L. Türleri ve Aspir (C. tinctorius L.) Islahında Değerlendirme Olanakları. Tarla Bitkileri Merkez Araştırma Enstitüsü Dergisi, 19(1-2), 36-43.
  • Ashri, A. & Knowles, P. F. (1960). Cytogenetics of safflower (Carthamus L.). Crop Science, 1(1), 44–47. https://doi.org/10.2135/cropsci1960.0011183X000100010017x
  • Askin, E. & Erbaş, S. (2020). Superior lines for agro-technological traits in safflower (Carthamus tinctorius L.). Turkish Journal of Field Crops, 25(1), 50-56. https://doi.org/10.17557/tjfc.737511
  • Barati, M. & Arzani, A. (2012). Genetic diversity revealed by EST-SSR markers in cultivated and wild safflower. Biochemical Systematics and Ecology, 44, 117–123. https://doi.org/10.1016/j.bse.2012.04.013
  • Bayraktar, N. (1997). Aspirde (Carthamus tinctorius L.) verim ve bazı verim öğeleri üzerine araştırmalar (Yayın No. 1475, Bilimsel Araştırma ve İnceleme: 811). Ankara Üniversitesi Ziraat Fakültesi Yayınları.
  • Bennetzen, J. L. (2000). Transposable element contributions to plant gene and genome evolution. Plant molecular biology, 42, 251-269. https://doi.org/10.1023/A:1006344508454
  • Bhattarai, B., Singh, S., Angadi, S. V., Begna, S., Saini, R., & Auld, D. (2020). Spring safflower water use patterns in response to pre- and in-season irrigation applications. Industrial Crops and Products, 153, 112576. https://doi.org/10.1016/j.indcrop.2020.112576
  • Chapman, M. A., Hvala, J., Strever, J., & Burke, J. M. (2010). Population genetic analysis of safflower (Carthamus tinctorius L.; Asteraceae) reveals a Near Eastern origin and five centers of diversity. American Journal of Botany. 97(5), 831–840. https://doi.org/10.3732/ajb.0900137
  • Cohen, J. (1988). Statistical Power Analysis for the Behavioral Sciences (2nd ed.). Hillsdale, NJ: Lawrence Erlbaum Associates.
  • Culpan, E. (2021). Bazı aspir genotip ve melezlerinin karakterizasyonu ve ileri kademe ıslah materyallerinin oluşturulması (Tez no 720364). (Doktora tezi, Tekirdağ Namık Kemal Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü). Yükseköğretim Kurulu Ulusal Tez Merkezi.
  • Culpan, E. (2023). Identification of cold tolerance and some agronomic traits of advanced safflower genotypes developed by hybridization. Journal of the American Oil Chemists' Society, 100(11), 915-926. https://doi.org/10.1002/aocs.12754
  • Demirel, F. (2020). Genetic diversity of Emmer wheats using iPBS markers. Avrupa Bilim ve Teknoloji Dergisi, 20, 640-646. https://doi.org/10.31590/ejosat.814537
  • Demirel, F., Yıldırım, B., Eren, B., Demirel, S., Türkoğlu, A., Haliloğlu, K., & Bocianowski, J. (2024). Revealing genetic diversity and population structure in Türkiye’s wheat germplasm using iPBS-retrotransposon markers. Agronomy, 14(2), 300. https://doi.org/10.3390/agronomy14020300
  • Doyle, J. J. & Doyle, J. L. (1987). A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue. Phytochemical Bulletin, 19(1), 11–15.
  • Erbaş, S. & Mutlucan, M. (2023). Investigation of flower yield and quality in different color safflower genotypes. Agronomy. 13(4), 956. https://doi.org/10.3390/agronomy13040956
  • Eren, B., Keskin, B., Demirel, F., Demirel, S., Türkoğlu, A., Yilmaz, A., & Haliloğlu, K. (2023). Assessment of genetic diversity and population structure in local alfalfa genotypes using iPBS molecular markers. Genetic Resources and Crop Evolution, 70(2), 617-628. https://doi.org/10.1007/s10722-022-01450-2
  • Esendal, E., Arslan, B., & Paşa, C. (2008). Effect of winter and spring sowing on yield and plant traits of safflower (Carthamus tinctorius L.). 7th International Safflower Conference, Wagga Wagga, Australia.
  • FAOSTAT. FAOSTAT Çevrimiçi Veritabanı. 2024. Çevrimiçi olarak erişilebilir: https://www.fao.org/faostat/en/#data/QCL/visualize
  • Giachino, R. R. A. & İnan, D. (2019). Assessment of genetic diversity in Safflower (Carthamus tinctorius L.) using RAPD markers. Yuzuncu Yıl University Journal of Agricultural Sciences, 29(2), 300-308. doi: 10.29133/yyutbd.560936
  • Giachino, R. R. A. (2023). Evaluation of Some Local and Registered Safflower (Carthamus tinctorius L.) Varieties Based on SRAP Markers. Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tarım ve Doğa Dergisi. 26(6), 1325-1336. https://doi.org/10.18016/ksutarimdoga.vi.1168608
  • Houmanat, K., Charafi, J., Mazouz, H., El Fechtali, M., & Nabloussi, A. (2016). Genetic diversity analysis of safflower (Carthamus tinctorius) accessions from different geographic origins using ISSR markers. International Journal of Agriculture and Biology, 18(6), 881–887. DOI: 10.17957/IJAB/15.0144
  • Hamdan, Y. A. (2024). Genetic diversity analysis of Palestinian safflower (Carthamus tinctorius L.) using inter simple sequence repeat (ISSR) markers. Genetic Resources and Crop Evolution, 1-13. https://doi.org/10.1007/s10722-024-01962-z
  • Hammer, Ø. and Harper, D. A. (2001). Past: paleontological statistics software package for education and data anlysis. Palaeontologia electronica, 4(1), 1.
  • Hassani, S. M. R., Talebi, R., Pourdad, S. S., Naji, A. M., & Fayaz, F. (2020). Morphological description, genetic diversity and population structure of safflower (Carthamus tinctorius L.) mini core collection using SRAP and SSR markers. Biotechnology & Biotechnological Equipment, 34(1), 1043-1055. https://doi.org/10.1080/ 13102818.2020.1818620
  • Ito, H., Gaubert, H., Bucher, E., Mirouze, M., Vaillant, I., & Paszkowski, J. (2011). An siRNA pathway prevents transgenerational retrotransposition in plants subjected to stress. Nature, 472(7341), 115–119. https://doi.org/10.1038/nature09861
  • Joshi, B. K., Ghimire, K. H., Neupane, S. P., Gauchan, D., & Mengistu, D. K. (2023). Approaches and advantages of increased crop genetic diversity in the fields. Diversity, 15(5), 603. https://doi.org/10.3390/d15050603
  • Kalendar, R., Antonius, K., Smýkal, P., & Schulman, A. H. (2010). iPBS: a universal method for DNA fingerprinting and retrotransposon isolation. Theoretical and Applied Genetics, 121, 1419-1430. https://doi.org/10.1007/s00122-010-1398-2
  • Kang, Z. L., Xie, J. J., Li, Y. P., Song, W. J., & Ma, H. J. (2023). Effects of Pre-Emulsified Safflower Oil with Magnetic Field Modified Soy 11S Globulin on the Gel, Rheological, and Sensory Properties of Reduced-Animal Fat Pork Batter. Meat Science, 198, 109087. https://doi.org/10.1016/j.meatsci.2022.109087
  • Karık, Ü., Nadeem, MA., Habyarimana, E., Ercişli, S., Yildiz, M., Yılmaz, A., Yang, SH, Chung, G., & Baloch, F.S. (2019). Exploring the genetic diversity and population structure of Turkish laurel germplasm by the iPBS-retrotransposon marker system. Agronomy, 9(10), 647. https://doi.org/10.3390/agronomy9100647
  • Kiran, B. U., Mukta, N., Kadirvel, P., Alivelu, K., Senthilvel, S., Kishore, P., & Varaprasad, K. S. (2017). Genetic diversity of safflower (Carthamus tinctorius L.) germplasm as revealed by SSR markers. Plant Genetic Resources, 15(1), 1-11. doi:10.1017/S1479262115000295
  • Kumari, A. (2008). Pollination ecology of safflower (Carthamus tinctorius Linn). Research Journal of Botany, 3(2), 146–153. https://doi.org/10.3923/rjb.2008.146.153
  • Kumar, S., Ambreen, H., Murali, T. V., Bali, S., Agarwal, M., Kumar, A., & Jagannath, A. (2015). Assessment of genetic diversity and population structure in a global reference collection of 531 accessions of Carthamus tinctorius L. (Safflower) using AFLP markers. Plant molecular biology reporter, 33(5), 1299-1313. https://doi.org/10.1007/s11105-014-0828-8
  • Kumar, S., Ambreen, H., Variath, M. T., Rao, A. R., Agarwal, M., Kumar, A., & Jagannath, A. (2016). Utilization of molecular, phenotypic, and geographical diversity to develop compact composite core collection in the oilseed crop, safflower (Carthamus tinctorius L.) through maximization strategy. Frontiers in plant science, 7, 1554. doi: 10.3389/fpls.2016.01554
  • Kumlay, A. M., Demirel, S., Demirel, F., & Yıldırım, B. (2021a). Bazı soya (Glycine max L.) çeşitlerinin IPBS markörleriyle moleküler karakterizasyonu. Yuzuncu Yıl University Journal of Agricultural Sciences, 31(1), 11-18. https://doi.org/10.29133/yyutbd.811158
  • Kumlay, A. M., Eren, B., Demirel, S., Demirel, F., & Yıldırım, B. (2021b). Bazı Pamuk Çeşitlerinde iPBS Analiziyle Genetik Varyasyonun Ortaya Çıkarılması. Avrupa Bilim ve Teknoloji Dergisi, 21, 67-73. https://doi.org/10.31590/ejosat.809479
  • Küyük, F., Aslan, M., & Özbek, Ö. (2021). Characterization of genetic diversity in populations of cultivated and wild safflower species in the genus Carthamus L. from Turkey as revealed by ISSR. Biology Bulletin, 48, 693-704. https://doi.org/10.1134/S1062359021130045
  • Mokhtari, N., Sayed-Tabatabaei, B. E., Bahar, M., & Arabnezhad, H. (2018). Assessment of genetic diversity and population genetic structure of Carthamus species and Iranian cultivar collection using developed SSR markers. Journal of genetics, 97, 67-78. https://doi.org/10.1007/s12041-018-0956-2
  • Mündel, H. H. & Bergman, J. W. (2009). Safflower. In J. Vollman & I. Rajcan (Eds.), Oil Crops, Handbook of Plant Breeding (pp 423-448). Springer, New York.
  • Mündel, H. H., Morrison, R.J., Blackshaw, R.E., & Roth, B. (1992). Safflower Production on the Canadian Prairies. (Project No. 87-0016, 35 p.). Agriculture Canada Research Station; Alberta Safflower Growers Association; Alberta Agriculture Research Institute.
  • Nadeem, M. A., Nawaz, M. A., Shahid, M. Q., Doğan, Y., Comertpay, G., Yildiz, M., & Baloch, F. S. (2018). DNA molecular markers in plant breeding: current status and recent advancements in genomic selection and genome editing. Biotechnology & Biotechnological Equipment, 32(2), 261-285. https://doi.org/10.1080/13102818.2017.1400401
  • Oliveira, A. J. D., Barelli, M. A. A., Oliveira, T. C. D., Sander, N. L., Azevedo, R. F., & Silva, C. R. D. (2023). Genetic variability in genotypes of safflower via SSR molecular marker. Ciência e Agrotecnologia, 47, e011922. https://doi.org/10.1590/1413-7054202347011922
  • Pasban Eslam, B. (2022). Effect of Early and Late Season Drought Stress on Agronomic Characteristics, Seed and Oil Yield of Safflower (Carthamus tinctorius L.) Genotypes in Marginal and Saline Soils around Lake Urmia. Seed and Plant Journal, 38(1), 91-108. https://doi.org/10.22092/SPJ.2023.360806.1285
  • Porebski, S., Bailey, L. G., & Baum, B. R. (1997). Modification of a CTAB DNA extraction protocol for plants containing high polysaccharide and polyphenol components. Plant molecular biology reporter, 15, 8-15. Https://doi.org/10.1007/bf02772108
  • R Core Team (2023). R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria. https://www.R-project.org/
  • Rehman, H., Rabbani, M. A., Shinwari, Z. K., & Akbar, F. (2015). RAPD Markers based genetic diversity of safflower (Carthamus tinctorius L.) germplasm. Pak. J. Bot, 47, 199-204.
  • Sehgal, D., Rajpal, V. R., Raina, S. N., Sasanuma, T., & Sasakuma, T. (2009). Assaying polymorphism at DNA level for genetic diversity diagnostics of the safflower (Carthamus tinctorius L.) world germplasm resources. Genetica, 135(3), 457–470. https://doi.org/10.1007/s10709-008-9292-4
  • Stecher, G., Tamura, K., & Kumar, S. (2020). Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) for macOS. Molecular Biology and Evolution, 37, 1237-1239. https://doi.org/10.1093/molbev/msz312
  • Tanksley, S. D., & McCouch, S. R. (1997). Seed banks and molecular maps: unlocking genetic potential from the wild. Science, 277(5329), 1063-1066. DOI: 10.1126/science.277.5329.1063
  • Tonguç, M., Erbaş, S., & Baydar, H. (2011). Aspirde geliştirilen rekombinant saf hat populasyonunun genetik harita populasyonu olarak kullanma imkanlarının araştırılması. Ziraat Fakültesi Dergisi. 6(2), 1-7.
  • Wu, Z., Liu, H., Zhan, W., Yu, Z., Qin, E., Liu, S., & Qin, R. (2021). The chromosome‐scale reference genome of safflower (Carthamus tinctorius) provides insights into linoleic acid and flavonoid biosynthesis. Plant Biotechnology Journal, 19(9), 1725-1742. https://doi.org/10.1111/pbi.13586
  • Yildiz, M., Altaf, M. T., Baloch, F. S., Koçak, M., Sadık, G., Kuzğun, C., Nadem, M. A., Ali, F., Bedir, M., & Tunçtürk, M. (2022). Assessment of genetic diversity among 131 safflower (Carthamus tinctorius L.) accessions using peroxidase gene polymorphism (POGP) markers. Molecular Biology Reports, 49(7), 6531-6539. DOI: 10.1007/s11033-022-07485-z
  • Yingqi, H., Ahmad, N., Yuanyuan, T., Jianyu, J., Liyan, W., Gang, W., Xiuming, L., Yuanyuan, D., Fawei, W., Weican, L., Xiaowei, L., Xu, Z., Na, Y., & Haiyan L. (2019). Genome-Wide Identification, Expression Analysis, and Subcellular Localization of Carthamus tinctorius bHLH Transcription Factors. International Journal of Molecular Sciences, 20(12), 3044. doi: 10.3390/ijms20123044
  • Yingqi, H., Lv, Y., Zhang, J., Ahmad, N., Li, Y., Wang, N., Xiuming, L., Na, Y., & Li, X. (2022). Identification and Functional Characterization of Safflower Cysteine Protease 1 as Negative Regulator in Response to low-Temperature Stress in Transgenic Arabidopsis. Planta, 255(5), 106. doi: 10.1007/s00425-022-03875-6.
  • Zeng, T., Xiao, Q., Zhang, J., Sun, X., Guo, B., Pei, J., Huang, L.F. (2023). Identification of a Secondary Q-Marker in High-Quality Ecotypes of Carthamus tinctorius L. and Exploration of the Target Preference. Food & Function, 14(6), 2710–2726. doi: 10.1039/d2fo02596e

Assessment of Genetic Diversity in Turkish Safflower (Carthamus tinctorius L.) Genotypes Using iPBS Retrotransposon Markers

Year 2026, Issue: Advanced Online Publication, 955 - 967, 27.02.2026
https://doi.org/10.18016/ksutarimdoga.vi.1728043
https://izlik.org/JA67CZ66PT

Abstract

Safflower (Carthamus tinctorius L.) is a drought-tolerant oilseed crop of agronomic and medicinal importance. Understanding its genetic diversity is crucial for developing improved cultivars and conserving local germplasm. In this study, 33 safflower genotypes, including 8 cultivars and 25 landraces from Türkiye, were characterized using 12 inter-primer binding site (iPBS) retrotransposon markers. A total of 124 bands were amplified, of which 120 (96.77%) were polymorphic. The number of alleles per primer ranged from 4 to 22, with an average of 10. Mean polymorphic information content (PIC), effective number of alleles (Ne), Shannon’s information index (I), and resolving power (Rp) were determined as 0.19, 1.30, 1.31, and 7.01, respectively. Cluster analysis based on Jaccard similarity coefficients grouped the genotypes into four major clusters using the UPGMA method, with a similarity range from 0.24 to 0.85. Principal Coordinate Analysis (PCoA) supported the clustering pattern, with the first two coordinates explaining 68.21% of the total genetic variation. The congruence between PCoA and UPGMA patterns confirms the robustness of the iPBS markers in discriminating safflower genotypes. Overall, the results demonstrate the effectiveness of iPBS markers in revealing significant genetic diversity among Turkish safflower accessions, providing a valuable molecular resource for breeding programs and germplasm management.

References

  • Ahmadi, A. J., & Ahmadikhah, A. (2022). Occurrence of simple sequence repeats in cDNA sequences of safflower (Carthamus tinctorius) reveals the importance of SSR-containing genes for cell biology and dynamic response to environmental cues. Frontiers in Plant Science, 13, 991107. https://doi.org/10.3389/fpls.2022.991107
  • Ali, F., Yılmaz, A., Nadeem, M. A., Habyarimana, E., Subaşı, I., Nawaz, M. A., Çaudray, H.C., Şahid, M.K., Ercişli, S., Ziya, M.E.B., Chung, G., & Baloch, F. S. (2019). Mobile genomic element diversity in world collection of safflower (Carthamus tinctorius L.) panel using iPBS-retrotransposon markers. PloS one, 14 (2), e0211985. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0211985
  • Arslan, Y., Katar, D., Güneylioğlu, H., Subaşı, İ., Şahin, B., & Bülbül, A. S. (2010). Türkiye Florasındaki Yabani Carthamus L. Türleri ve Aspir (C. tinctorius L.) Islahında Değerlendirme Olanakları. Tarla Bitkileri Merkez Araştırma Enstitüsü Dergisi, 19(1-2), 36-43.
  • Ashri, A. & Knowles, P. F. (1960). Cytogenetics of safflower (Carthamus L.). Crop Science, 1(1), 44–47. https://doi.org/10.2135/cropsci1960.0011183X000100010017x
  • Askin, E. & Erbaş, S. (2020). Superior lines for agro-technological traits in safflower (Carthamus tinctorius L.). Turkish Journal of Field Crops, 25(1), 50-56. https://doi.org/10.17557/tjfc.737511
  • Barati, M. & Arzani, A. (2012). Genetic diversity revealed by EST-SSR markers in cultivated and wild safflower. Biochemical Systematics and Ecology, 44, 117–123. https://doi.org/10.1016/j.bse.2012.04.013
  • Bayraktar, N. (1997). Aspirde (Carthamus tinctorius L.) verim ve bazı verim öğeleri üzerine araştırmalar (Yayın No. 1475, Bilimsel Araştırma ve İnceleme: 811). Ankara Üniversitesi Ziraat Fakültesi Yayınları.
  • Bennetzen, J. L. (2000). Transposable element contributions to plant gene and genome evolution. Plant molecular biology, 42, 251-269. https://doi.org/10.1023/A:1006344508454
  • Bhattarai, B., Singh, S., Angadi, S. V., Begna, S., Saini, R., & Auld, D. (2020). Spring safflower water use patterns in response to pre- and in-season irrigation applications. Industrial Crops and Products, 153, 112576. https://doi.org/10.1016/j.indcrop.2020.112576
  • Chapman, M. A., Hvala, J., Strever, J., & Burke, J. M. (2010). Population genetic analysis of safflower (Carthamus tinctorius L.; Asteraceae) reveals a Near Eastern origin and five centers of diversity. American Journal of Botany. 97(5), 831–840. https://doi.org/10.3732/ajb.0900137
  • Cohen, J. (1988). Statistical Power Analysis for the Behavioral Sciences (2nd ed.). Hillsdale, NJ: Lawrence Erlbaum Associates.
  • Culpan, E. (2021). Bazı aspir genotip ve melezlerinin karakterizasyonu ve ileri kademe ıslah materyallerinin oluşturulması (Tez no 720364). (Doktora tezi, Tekirdağ Namık Kemal Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü). Yükseköğretim Kurulu Ulusal Tez Merkezi.
  • Culpan, E. (2023). Identification of cold tolerance and some agronomic traits of advanced safflower genotypes developed by hybridization. Journal of the American Oil Chemists' Society, 100(11), 915-926. https://doi.org/10.1002/aocs.12754
  • Demirel, F. (2020). Genetic diversity of Emmer wheats using iPBS markers. Avrupa Bilim ve Teknoloji Dergisi, 20, 640-646. https://doi.org/10.31590/ejosat.814537
  • Demirel, F., Yıldırım, B., Eren, B., Demirel, S., Türkoğlu, A., Haliloğlu, K., & Bocianowski, J. (2024). Revealing genetic diversity and population structure in Türkiye’s wheat germplasm using iPBS-retrotransposon markers. Agronomy, 14(2), 300. https://doi.org/10.3390/agronomy14020300
  • Doyle, J. J. & Doyle, J. L. (1987). A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue. Phytochemical Bulletin, 19(1), 11–15.
  • Erbaş, S. & Mutlucan, M. (2023). Investigation of flower yield and quality in different color safflower genotypes. Agronomy. 13(4), 956. https://doi.org/10.3390/agronomy13040956
  • Eren, B., Keskin, B., Demirel, F., Demirel, S., Türkoğlu, A., Yilmaz, A., & Haliloğlu, K. (2023). Assessment of genetic diversity and population structure in local alfalfa genotypes using iPBS molecular markers. Genetic Resources and Crop Evolution, 70(2), 617-628. https://doi.org/10.1007/s10722-022-01450-2
  • Esendal, E., Arslan, B., & Paşa, C. (2008). Effect of winter and spring sowing on yield and plant traits of safflower (Carthamus tinctorius L.). 7th International Safflower Conference, Wagga Wagga, Australia.
  • FAOSTAT. FAOSTAT Çevrimiçi Veritabanı. 2024. Çevrimiçi olarak erişilebilir: https://www.fao.org/faostat/en/#data/QCL/visualize
  • Giachino, R. R. A. & İnan, D. (2019). Assessment of genetic diversity in Safflower (Carthamus tinctorius L.) using RAPD markers. Yuzuncu Yıl University Journal of Agricultural Sciences, 29(2), 300-308. doi: 10.29133/yyutbd.560936
  • Giachino, R. R. A. (2023). Evaluation of Some Local and Registered Safflower (Carthamus tinctorius L.) Varieties Based on SRAP Markers. Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tarım ve Doğa Dergisi. 26(6), 1325-1336. https://doi.org/10.18016/ksutarimdoga.vi.1168608
  • Houmanat, K., Charafi, J., Mazouz, H., El Fechtali, M., & Nabloussi, A. (2016). Genetic diversity analysis of safflower (Carthamus tinctorius) accessions from different geographic origins using ISSR markers. International Journal of Agriculture and Biology, 18(6), 881–887. DOI: 10.17957/IJAB/15.0144
  • Hamdan, Y. A. (2024). Genetic diversity analysis of Palestinian safflower (Carthamus tinctorius L.) using inter simple sequence repeat (ISSR) markers. Genetic Resources and Crop Evolution, 1-13. https://doi.org/10.1007/s10722-024-01962-z
  • Hammer, Ø. and Harper, D. A. (2001). Past: paleontological statistics software package for education and data anlysis. Palaeontologia electronica, 4(1), 1.
  • Hassani, S. M. R., Talebi, R., Pourdad, S. S., Naji, A. M., & Fayaz, F. (2020). Morphological description, genetic diversity and population structure of safflower (Carthamus tinctorius L.) mini core collection using SRAP and SSR markers. Biotechnology & Biotechnological Equipment, 34(1), 1043-1055. https://doi.org/10.1080/ 13102818.2020.1818620
  • Ito, H., Gaubert, H., Bucher, E., Mirouze, M., Vaillant, I., & Paszkowski, J. (2011). An siRNA pathway prevents transgenerational retrotransposition in plants subjected to stress. Nature, 472(7341), 115–119. https://doi.org/10.1038/nature09861
  • Joshi, B. K., Ghimire, K. H., Neupane, S. P., Gauchan, D., & Mengistu, D. K. (2023). Approaches and advantages of increased crop genetic diversity in the fields. Diversity, 15(5), 603. https://doi.org/10.3390/d15050603
  • Kalendar, R., Antonius, K., Smýkal, P., & Schulman, A. H. (2010). iPBS: a universal method for DNA fingerprinting and retrotransposon isolation. Theoretical and Applied Genetics, 121, 1419-1430. https://doi.org/10.1007/s00122-010-1398-2
  • Kang, Z. L., Xie, J. J., Li, Y. P., Song, W. J., & Ma, H. J. (2023). Effects of Pre-Emulsified Safflower Oil with Magnetic Field Modified Soy 11S Globulin on the Gel, Rheological, and Sensory Properties of Reduced-Animal Fat Pork Batter. Meat Science, 198, 109087. https://doi.org/10.1016/j.meatsci.2022.109087
  • Karık, Ü., Nadeem, MA., Habyarimana, E., Ercişli, S., Yildiz, M., Yılmaz, A., Yang, SH, Chung, G., & Baloch, F.S. (2019). Exploring the genetic diversity and population structure of Turkish laurel germplasm by the iPBS-retrotransposon marker system. Agronomy, 9(10), 647. https://doi.org/10.3390/agronomy9100647
  • Kiran, B. U., Mukta, N., Kadirvel, P., Alivelu, K., Senthilvel, S., Kishore, P., & Varaprasad, K. S. (2017). Genetic diversity of safflower (Carthamus tinctorius L.) germplasm as revealed by SSR markers. Plant Genetic Resources, 15(1), 1-11. doi:10.1017/S1479262115000295
  • Kumari, A. (2008). Pollination ecology of safflower (Carthamus tinctorius Linn). Research Journal of Botany, 3(2), 146–153. https://doi.org/10.3923/rjb.2008.146.153
  • Kumar, S., Ambreen, H., Murali, T. V., Bali, S., Agarwal, M., Kumar, A., & Jagannath, A. (2015). Assessment of genetic diversity and population structure in a global reference collection of 531 accessions of Carthamus tinctorius L. (Safflower) using AFLP markers. Plant molecular biology reporter, 33(5), 1299-1313. https://doi.org/10.1007/s11105-014-0828-8
  • Kumar, S., Ambreen, H., Variath, M. T., Rao, A. R., Agarwal, M., Kumar, A., & Jagannath, A. (2016). Utilization of molecular, phenotypic, and geographical diversity to develop compact composite core collection in the oilseed crop, safflower (Carthamus tinctorius L.) through maximization strategy. Frontiers in plant science, 7, 1554. doi: 10.3389/fpls.2016.01554
  • Kumlay, A. M., Demirel, S., Demirel, F., & Yıldırım, B. (2021a). Bazı soya (Glycine max L.) çeşitlerinin IPBS markörleriyle moleküler karakterizasyonu. Yuzuncu Yıl University Journal of Agricultural Sciences, 31(1), 11-18. https://doi.org/10.29133/yyutbd.811158
  • Kumlay, A. M., Eren, B., Demirel, S., Demirel, F., & Yıldırım, B. (2021b). Bazı Pamuk Çeşitlerinde iPBS Analiziyle Genetik Varyasyonun Ortaya Çıkarılması. Avrupa Bilim ve Teknoloji Dergisi, 21, 67-73. https://doi.org/10.31590/ejosat.809479
  • Küyük, F., Aslan, M., & Özbek, Ö. (2021). Characterization of genetic diversity in populations of cultivated and wild safflower species in the genus Carthamus L. from Turkey as revealed by ISSR. Biology Bulletin, 48, 693-704. https://doi.org/10.1134/S1062359021130045
  • Mokhtari, N., Sayed-Tabatabaei, B. E., Bahar, M., & Arabnezhad, H. (2018). Assessment of genetic diversity and population genetic structure of Carthamus species and Iranian cultivar collection using developed SSR markers. Journal of genetics, 97, 67-78. https://doi.org/10.1007/s12041-018-0956-2
  • Mündel, H. H. & Bergman, J. W. (2009). Safflower. In J. Vollman & I. Rajcan (Eds.), Oil Crops, Handbook of Plant Breeding (pp 423-448). Springer, New York.
  • Mündel, H. H., Morrison, R.J., Blackshaw, R.E., & Roth, B. (1992). Safflower Production on the Canadian Prairies. (Project No. 87-0016, 35 p.). Agriculture Canada Research Station; Alberta Safflower Growers Association; Alberta Agriculture Research Institute.
  • Nadeem, M. A., Nawaz, M. A., Shahid, M. Q., Doğan, Y., Comertpay, G., Yildiz, M., & Baloch, F. S. (2018). DNA molecular markers in plant breeding: current status and recent advancements in genomic selection and genome editing. Biotechnology & Biotechnological Equipment, 32(2), 261-285. https://doi.org/10.1080/13102818.2017.1400401
  • Oliveira, A. J. D., Barelli, M. A. A., Oliveira, T. C. D., Sander, N. L., Azevedo, R. F., & Silva, C. R. D. (2023). Genetic variability in genotypes of safflower via SSR molecular marker. Ciência e Agrotecnologia, 47, e011922. https://doi.org/10.1590/1413-7054202347011922
  • Pasban Eslam, B. (2022). Effect of Early and Late Season Drought Stress on Agronomic Characteristics, Seed and Oil Yield of Safflower (Carthamus tinctorius L.) Genotypes in Marginal and Saline Soils around Lake Urmia. Seed and Plant Journal, 38(1), 91-108. https://doi.org/10.22092/SPJ.2023.360806.1285
  • Porebski, S., Bailey, L. G., & Baum, B. R. (1997). Modification of a CTAB DNA extraction protocol for plants containing high polysaccharide and polyphenol components. Plant molecular biology reporter, 15, 8-15. Https://doi.org/10.1007/bf02772108
  • R Core Team (2023). R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria. https://www.R-project.org/
  • Rehman, H., Rabbani, M. A., Shinwari, Z. K., & Akbar, F. (2015). RAPD Markers based genetic diversity of safflower (Carthamus tinctorius L.) germplasm. Pak. J. Bot, 47, 199-204.
  • Sehgal, D., Rajpal, V. R., Raina, S. N., Sasanuma, T., & Sasakuma, T. (2009). Assaying polymorphism at DNA level for genetic diversity diagnostics of the safflower (Carthamus tinctorius L.) world germplasm resources. Genetica, 135(3), 457–470. https://doi.org/10.1007/s10709-008-9292-4
  • Stecher, G., Tamura, K., & Kumar, S. (2020). Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) for macOS. Molecular Biology and Evolution, 37, 1237-1239. https://doi.org/10.1093/molbev/msz312
  • Tanksley, S. D., & McCouch, S. R. (1997). Seed banks and molecular maps: unlocking genetic potential from the wild. Science, 277(5329), 1063-1066. DOI: 10.1126/science.277.5329.1063
  • Tonguç, M., Erbaş, S., & Baydar, H. (2011). Aspirde geliştirilen rekombinant saf hat populasyonunun genetik harita populasyonu olarak kullanma imkanlarının araştırılması. Ziraat Fakültesi Dergisi. 6(2), 1-7.
  • Wu, Z., Liu, H., Zhan, W., Yu, Z., Qin, E., Liu, S., & Qin, R. (2021). The chromosome‐scale reference genome of safflower (Carthamus tinctorius) provides insights into linoleic acid and flavonoid biosynthesis. Plant Biotechnology Journal, 19(9), 1725-1742. https://doi.org/10.1111/pbi.13586
  • Yildiz, M., Altaf, M. T., Baloch, F. S., Koçak, M., Sadık, G., Kuzğun, C., Nadem, M. A., Ali, F., Bedir, M., & Tunçtürk, M. (2022). Assessment of genetic diversity among 131 safflower (Carthamus tinctorius L.) accessions using peroxidase gene polymorphism (POGP) markers. Molecular Biology Reports, 49(7), 6531-6539. DOI: 10.1007/s11033-022-07485-z
  • Yingqi, H., Ahmad, N., Yuanyuan, T., Jianyu, J., Liyan, W., Gang, W., Xiuming, L., Yuanyuan, D., Fawei, W., Weican, L., Xiaowei, L., Xu, Z., Na, Y., & Haiyan L. (2019). Genome-Wide Identification, Expression Analysis, and Subcellular Localization of Carthamus tinctorius bHLH Transcription Factors. International Journal of Molecular Sciences, 20(12), 3044. doi: 10.3390/ijms20123044
  • Yingqi, H., Lv, Y., Zhang, J., Ahmad, N., Li, Y., Wang, N., Xiuming, L., Na, Y., & Li, X. (2022). Identification and Functional Characterization of Safflower Cysteine Protease 1 as Negative Regulator in Response to low-Temperature Stress in Transgenic Arabidopsis. Planta, 255(5), 106. doi: 10.1007/s00425-022-03875-6.
  • Zeng, T., Xiao, Q., Zhang, J., Sun, X., Guo, B., Pei, J., Huang, L.F. (2023). Identification of a Secondary Q-Marker in High-Quality Ecotypes of Carthamus tinctorius L. and Exploration of the Target Preference. Food & Function, 14(6), 2710–2726. doi: 10.1039/d2fo02596e
There are 56 citations in total.

Details

Primary Language English
Subjects Agricultural Biotechnology (Other)
Journal Section Research Article
Authors

Serap Demirel 0000-0002-1877-0797

Leyla Kurgan 0000-0002-2052-6013

Fatih Demirel 0000-0002-6846-8422

Barış Eren 0000-0002-3852-6476

Submission Date June 26, 2025
Acceptance Date October 30, 2025
Early Pub Date February 27, 2026
Publication Date February 27, 2026
DOI https://doi.org/10.18016/ksutarimdoga.vi.1728043
IZ https://izlik.org/JA67CZ66PT
Published in Issue Year 2026 Issue: Advanced Online Publication

Cite

APA Demirel, S., Kurgan, L., Demirel, F., & Eren, B. (2026). Assessment of Genetic Diversity in Turkish Safflower (Carthamus tinctorius L.) Genotypes Using iPBS Retrotransposon Markers. Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tarım Ve Doğa Dergisi, Advanced Online Publication, 955-967. https://doi.org/10.18016/ksutarimdoga.vi.1728043

Aim & Scope

2024-JIF = 0.500, 2024-JCI = 0.140,  Category Quartile = Q4, ICV-2022: 71.05

Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tarım ve Doğa Dergisi (Journal of Agricultural and Natural), uluslararası hakemli bir dergidir.

Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Fen ve Mühendislik Dergisi 1997 yılında yayın hayatına başlamış olup, 1999 yılı hariç bugüne kadar aralıksız yılda 2 sayı halinde hakemli ve danışma kurullu olarak yayın hayatına devam etmiştir.


Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Fen ve Mühendislik Dergisi, 2009 yılından itibaren format, vizyon ve misyonunda köklü değişikliğe giderek, çağın ve uluslararası bilim dünyasının gereklerini yerine getirme görevi içinde yeniden yapılanmıştır. Bu amaçla 2009 yılından itibaren "Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Doğa Bilimleri Dergisi" ve "Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Mühendislik Bilimleri Dergisi" olmak üzere iki ayrı elektronik dergi olarak yılda 2 sayı çıkarılmıştır.

Dergimiz yoğun ilgiden dolayı 2011 yılından itibaren yılda 4 sayı olarak yayınlanmıştır. 2018 yılından itibaren ise dergimizin adı “KSÜ Tarım ve Doğa Dergisi” olarak değiştirilmiş ve yılda 6 sayı olarak yayınlanmaya başlanmıştır.

Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tarım ve Doğa Dergisi (Journal of Agricultural and Natural), Açık Dergi Sistemi (Open Journal System;OJS) ile araştırma makalelerin on-line olarak kabul etmekte tüm sayılarındaki makalenin sınırsız erişim kolaylıkları ile paydaşların hizmetine sunmaktadır. Bilindiği gibi Açık Dergi Sistemleri abonelik ile dağılım sistemlerine göre ulusal ve uluslar arası ölçekte tüm okuyuculara daha nitelikli izleme olanakları sunarak makalelerin etki düzeyini de arttırmaktadır. OJS sistemleri ayrıca indeksleme, tekrar erişim, serbest erişim, çoğaltma gibi hususlar bakımından araştırmacılara kolaylıkla sunmaktadır.

Ulusal ve uluslararası düzeyde makale kabul eden dergimiz uluslararası kabule sahip SCI- Expanded vb. gibi indekslerde taranmak için gerekli şartları yerine getirmeye çalışmaktadır. Dergimiz 2017 yılından itibaren, Web of Science ve Emerging Sources Citation Index tarafından taranmaya başlanmıştır. Bundan sonraki yayın hayatında, bilimsellik ve etik kuralları çerçevesinde yoluna devam edecek olan dergimiz, siz değerli bilim adamı ve okuyucularının Türkçe ve İngilizce olarak yazılmış bilimsel araştırmalarını; makale, editöre not ve araştırma notu şeklinde yayınlamaya devam edecektir.

Dergimizde basılan makalelere araştırmacıların yapacağı atıflar, dergilerimizin ulusal ve uluslararası indekslerce taranması ve kabul görmesi açısından çok önemlidir.


Açık Erişim Politikası

KSÜ Tarım ve Doğa Dergisi, tamamen ücretsiz, uluslararası hakemli ve açık erişimli bir dergidir. Makale işlem ücreti (değerlendirme ücreti veya basım ücreti) ve makalelere erişim için abonelik ücreti talep etmez.

Editöryal Süreç

KSÜ Tarım ve Doğa Dergisi, tüm çalışmaların değerlendirme sürecinde çifte körleme yöntemini kullanmaktadır. Çift körleme yönteminde çalışmaların yazar ve hakem kimlikleri gizlenmektedir.

Editörler; dergi yayın politikalarında yer alan "Kör Hakemlik ve Değerlendirme Süreci" politikalarını uygulamakla yükümlüdür. Bu bağlamda editörler her çalışmanın adil, tarafsız ve zamanında değerlendirme sürecinin tamamlanmasını sağlar.

İntihal Denetimi

KSÜ Tarım ve Doğa Dergisi, yayın etiği gereği "Kör Hakemlik Değerlendirme Süreci"nden geçmiş her çalışmanın bütünlüğünü korumak adına intihal denetiminden geçirilmesini zorunlu kılar. Bu kapsamda her çalışmanın Türkçe ve İngilizce nüshaları intihal denetiminden geçirilir. Denetim kapsamında oluşan maddi sorumlulular yazar(lar)a aittir.

Editörlerin Etik Görev ve Sorumlulukları

KSÜ Tarım ve Doğa Dergisi, editör ve bölüm editörleri, açık erişim olarak Committee on Publication Ethics (COPE) tarafından yayınlanan "COPE Code of Conduct and Best Practice Guidelines for Journal Editors" ve "COPE Best Practice Guidelines for Journal Editors" rehberleri temelinde etik görev ve sorumluluklara sahip olduklarını taahhüt ederler.

Kapsam

Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tarım ve Doğa Dergisi (Journal of Agricultural and Natural), uluslar arası hakemli bir dergi olup, Tarım ve Biyoloji ile ilgili tüm alanlarında özgün, yeni ve bilimsel değere sahip orijinal araştırma makaleleri yayımlamaktadır.


01.08.2022 tarihinden itibaren yazım kuralları güncellenmiştir.

Gönderilecek makaleler aşağıdaki yazım kılavuzuna göre hazırlanmış olmalıdır.



DERGİ YAYIN İLKELERİ ve YAZIM KURALLARINI PDF FORMATINDA İNDİRMEK İÇİN TIKLAYIN


YAYIN POLİTİKASI

  • KSÜ Tarım ve Doğa Dergisi, COPE tarafından hazırlanan Dergi Editörleri için Yönerge (The COPE Code of Conduct for Journal Editors) hükümlerine uymayı kabul ve taahhüt etmiştir.

  • Açık Erişim Politikası: Tarım ve Doğa Dergisi tamamen ücretsiz, uluslararası hakemli ve açık erişimli bir dergidir.

  • Makale işlem ücreti (değerlendirme ücreti veya basım ücreti) ve makalelere erişim için abonelik ücreti talep etmez.

  • Gizlilik Beyanı: Tarım ve Doğa Dergisi yönetim sistemine girilen isim ve elektronik posta adresleri gibi kişisel bilgiler, yalnızca bu derginin bilimsel amaçları doğrultusunda kullanılacaktır. Bu bilgiler başka bir amaç veya bölüm için kullanılmayacak olup, üçüncü taraflarla paylaşılmayacaktır.

  • Etik ilkeler: Derginin editöryal ve yayın süreçleri International Committee of Medical Journal Editors (ICMJE), World Association of Medical Editors (WAME), Council of Science Editors (CSE), Committee on Publication Ethics (COPE), European Association of Science Editors (EASE) ve National Information Standards Organization (NISO) kılavuzlarına uygun olarak biçimlendirilmiştir. KSÜ Tarım ve Doğa Dergisinin editöryal ve yayın süreçleri, Akademik Yayıncılıkta Şeffaflık ve En İyi Uygulama (doaj.org/bestpractice) ilkelerine uygun olarak yürütülmektedir.

  • Arşivleme: Tarım ve Doğa Dergisi’nde yayınlan tüm makaleler TÜBİTAK ULAKBİM Yaşam Bilimleri Veritabanı aracılığıyla pdf formatında ULAKBİM sunucularında saklanmakta ve sunulmaktadır.

  • Sponsorluk ve Reklam: Tarım ve Doğa Dergisi yayın politikaları kapmasında sponsorluk ve reklam kabul etmemektedir.

  • Telif Hakkı Devri: Yayınlanmak üzere Tarım ve Doğa Dergisi'ne gönderilen çalışmalar, daha önce herhangi bir şekilde tam metin olarak yayınlanmamış veya herhangi bir yere yayınlanmak üzere gönderilmemiş özgün çalışma niteliği taşımalıdır. Yazarlar çalışmalarının telif hakkından feragat etmeyi kabul ederek, değerlendirme için gönderimle birlikte çalışmalarının telif hakkını Tarım ve Doğa Dergisi'ne devretmek zorundadır. Tarım ve Doğa Dergisi Yayın Kurulu makalenin yayımlanması konusunda yetkili kılınır. Tarım ve Doğa Dergisi 'ne çalışma gönderecek yazarlar, "Telif Hakkı Devir Formu" belgesini doldurmalıdır. Yazar(lar) doldurdukları formu ıslak imza ile imzalamalıdır. İmzalanan form taranarak sistem üzerinden çalışma gönderim adımlarının 4.’sünde ek dosya yükleme seçeneği ile yüklenmelidir. Telif Hakkı Devir Formunu iletmeyen yazarların çalışmaları yayınlanmaz.

  • Yazarlar makale sonunda “Araştırmacıların katkı oranı beyanı” ve “yazar çatışma beyanı” konusunda bilgi vermek zorundadır.

  • Kör Hakemlik ve Değerlendirme Süreci: Kör hakemlik, bilimsel yayınların en yüksek kalite ile yayınlanması için uygulanan bir yöntemdir. Bu yöntem, bilimsel çalışmaların nesnel (objektif) bir şekilde değerlendirilme sürecinin temelini oluşturmaktadır ve birçok bilimsel dergi tarafından tercih edilmektedir. Hakem görüşleri, Tarım ve Doğa Dergisi’nin yayın kalitesinde belirleyici bir yere sahiptir. Tarım ve Doğa Dergisi'ne gönderilen tüm çalışmalar aşağıda belirtilen aşamalara göre körleme yoluyla değerlendirilmektedir.

  • Körleme Hakemlik Türü: Tarım ve Doğa Dergisi, tüm çalışmaların değerlendirme sürecinde çifte körleme yöntemini kullanmaktadır. Çift körleme yönteminde çalışmaların yazar ve hakem kimlikleri gizlenmektedir.

  • İlk Değerlendirme Süreci: Tarım ve Doğa Dergisi'e gönderilen çalışmalar ilk olarak editörler tarafından değerlendirilir. Bu aşamada, derginin amaç ve kapsamına uymayan, Türkçe ve İngilizce olarak dil ve anlatım kuralları açısından zayıf, bilimsel açıdan kritik hatalar içeren, özgün değeri olmayan ve yayın politikalarını karşılamayan çalışmalar reddedilir. Reddedilen çalışmaların yazarları, gönderim tarihinden itibaren en geç iki hafta içerisinde bilgilendirilir. Uygun bulunan çalışmalar ise ön değerlendirme için çalışmanın ilgili olduğu alana yönelik bir Bölüm editörüne gönderilir.

  • Ön Değerlendirme Süreci: Ön değerlendirme sürecinde bölüm editörleri çalışmaların, giriş, materyal ve metod, bulgular, sonuç, değerlendirme ve tartışma bölümlerini dergi yayın politikaları ve kapsamı ile özgünlük açısından ayrıntılı bir şekilde inceler. Bu inceleme sonucunda uygun bulunmayan çalışmalar en geç dört hafta içerisinde bölüm editörü değerlendirme raporu ile birlikte iade edilir.

  • Hakemlendirme Süreci: Çalışmalar içeriğine ve hakemlerin uzmanlık alanlarına göre hakemlere gönderilir. Çalışmayı inceleyen bölüm editörü, Tarım ve Doğa Dergisi hakem havuzundan uzmanlık alanlarına göre en az iki hakem önerisinde bulunur veya çalışmanın alanına uygun yeni hakem önerebilir. Makale hakemlerinin her birinin farklı kurumlardan olmasına ve hakemlerle aynı kurumdan olmamasına özen gösterilir. Bölüm editöründen gelen hakem önerileri editörler tarafından değerlendirilir ve çalışmalar hakemlere iletilir. Hakemler değerlendirdikleri çalışmalar hakkındaki hiçbir süreci ve belgeyi paylaşmayacakları hakkında garanti vermek zorundadır.

  • Hakem Değerlendirme Süreci: Hakem değerlendirme süreci için hakemlere verilen süre 4 haftadır. Hakemlerden veya editörlerden gelen düzeltme önerilerinin yazarlar tarafından 1 ay içerisinde tamamlanması zorunludur. Hakemler bir çalışmanın düzeltmelerini inceleyerek uygunluğuna karar verebilecekleri gibi gerekliyse birden çok defa düzeltme talep edebilir. Değerlendirme Sonucu Hakemlerden gelen görüşler, Bölüm editörü tarafından en geç 2 hafta içerisinde incelenir. Bu inceleme sonucunda Bölüm editörü çalışmaya ilişkin nihai kararını editörlere iletir.

  • Yayın Kurulu Kararı: Editörler, Bölüm editörü ve hakem görüşlerine dayanarak çalışma ile ilgili yayın kurulu görüşlerini hazırlar. Hazırlanan görüşler editör tarafından Bölüm editörü ve hakem önerileri ile birlikte en geç 1 hafta içerisinde yazar(lar)a iletilir. Bu süreçte olumsuz görüş verilen çalışmalar intihal denetimi talep edilmeksizin iade edilir.

  • Makale Gönderme: Tarım ve Doğa Dergisi'de değerlendirilmek üzere çalışma gönderecek yazar(lar) https://dergipark.org.tr/ksudobil adresinde yer alan dergi yönetim sistemine üye olarak gönderim gerçekleştirebilir.

  • Yazarlar: Yazar(lar)ın yayınlanmış, erken görünüm veya değerlendirme aşamasındaki çalışmasıyla ilgili bir yanlış ya da hatayı fark etmesi durumunda, geri çekme işlemlerinde dergi editörüyle işbirliği yapma yükümlülüğü bulunmaktadır.

  • Makalelerin Geri Çekilmesi: Değerlendirme aşamasındaki çalışmasını geri çekme talebinde bulunmak isteyen yazar(lar), makale geri çekme talebini içeren dilekçeyi her bir yazarın ıslak imzası ile imzalanmış ve taratılmış halini dogabilimleri@ksu.edu.tr adresi üzerinden e-posta aracılığıyla yayın kuruluna iletmekle yükümlüdür. Yayın Kurulu geri çekme bildirimini inceleyerek en geç bir hafta içerisinde dönüş sağlar. Yayın kurulu tarafından telif hakları Tarım ve Doğa Dergisi gönderim aşamasında devredilmiş çalışmaların geri çekme isteği onaylanmadıkça yazarlar çalışmasını başka bir dergiye değerlendirme için gönderemezler.

  • Editörler: Tarım ve Doğa Dergisi yayın kurulu; yayınlanmış, basım aşamasındaki veya değerlendirme aşamasındaki bir çalışmaya ilişkin telif hakkı ve intihal şüphesi oluşması durumunda çalışmayı ilişkin bir soruşturma başlatma yükümlülüğü taşır. Yayın kurulu yapılan soruşturma sonucunda değerlendirme aşamasındaki çalışmada telif hakkı ve intihal yapıldığını tespit etmesi durumunda çalışmayı değerlendirmeden geri çeker ve tespit edilen durumları detaylı bir şekilde kaynak göstererek yazarlara iade eder. Yayın kurulu, yayınlanmış veya baskı halindeki bir çalışmada telif hakkı ihlali ve intihal yapıldığını tespit etmesi durumunda, en geç bir hafta içerisinde aşağıdaki geri çekme ve bildiri işlemlerini gerçekleştirir.

Dergimiz, herhangi bir başvuru veya yayımlama ücreti almamaktadır (Free submission and publication).

Dergi Editörler Kurulu

Data Analysis, Biostatistics, Computational Statistics, Statistical Analysis, Statistical Experiment Design, Applied Statistics, Animal Science, Genetics and Biostatistics
ResearcherID: V-5036-2017
Horticultural Production, Vegetable Growing and Treatment
Biological Sciences, Cancer Biology, Health Sciences
Plant Biochemistry, Analytical Biochemistry, Pharmacology and Pharmaceutical Sciences, Pharmaceutical Analytical Chemistry, Instrumental Methods, Metabolomic Chemistry
ksü ziraat fak. öğretim üyesi. Tarım ve Doğa Dergisi Editörü
Animal Biotechnology, Zootechny, Stock Farming and Treatment, Animal Growth and Development, Poultry Farming and Treatment, Sheep and Goat Breeding and Treatment
Animal Science, Genetics and Biostatistics
Plant Nutrition and Soil Fertility
Animal Feeding
Ecotoxicology
G-7994-2018
Agricultural Economics, Agricultural Marketing, Agricultural, Veterinary and Food Sciences, Farm Enterprises, Agricultural Policy, Agribusiness
Stres Fizyolojisi, Antioksidan Sistem, Sinyal Molekülleri, Tıbbı ve aromatik bitkiler, Bitki fizyolojisi, Bitki Biyokimyası
Biological Sciences, Plant Biochemistry, Plant Physiology, Pharmacology and Pharmaceutical Sciences, Agricultural, Veterinary and Food Sciences
Biological Sciences, Biochemistry and Cell Biology
Zootechny, Stock Farming and Treatment, Genetically Modified Animals
Genotoxicity and Cytotoxicity, Industrial Molecular Engineering of Nucleic Acids and Proteins, Cytogenetic, Molecular Genetics, Animal Biotechnology, Animal Cell and Molecular Biology, Vertebrate Biology, Animal Biotechnology in Agriculture
Animal Systematics and Taxonomy, Entomology, Invertebrate Biology
Entomology, Entomology in Agriculture, Forest Entomology and Forest Protection
Biological Sciences, Mathematical Sciences, Agricultural, Veterinary and Food Sciences, Food Sciences
Agribusiness

Prof. Dr. Selami SELVİ, Çanakkale Onsekizmart Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Biyoloji Bölümünden 2002 yılında  mezun olmuştur. Balıkesir Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Biyoloji Bölümü Botanik ABD’de 2003-2005 yılları arasında yüksek lisansını, aynı enstitüde 2005-2011 yılları arasında doktorasını tamamlamıştır. Halen Balıkesir Üniversitesi Altınoluk Meslek Yüksekokulu Bitkisel ve Hayvansal Üretim Bölümünde Öğretim üyesi olarak akademik hayatına devam etmektedir. Bitki Morfolojisi ve Anatomisi, Bitki Sistematiği, Bitki Ekolojisi Etnobotanik, Etnofarmakoloji ve Bitki Biyokimyası üzerine çalışmalar yapmaktadır.

Biological Sciences, Plant Biochemistry, Plant Morphology and Anatomy, Ethobotany, Ecology, Plant and Fungus Systematics and Taxonomy, Pharmacognosy, Pharmaceutical Botany

AK

Zootechny, Stock Farming and Treatment, Animal Growth and Development, Sheep and Goat Breeding and Treatment
Animal Systematics and Taxonomy
Entomology, Entomology in Agriculture
Vegetable Growing and Treatment
Cereals and Legumes
Prof. Dr. Soner Soylu, Lisans eğitimini 1990 yılında Çukurova Üniversitesi Ziraat Fakültesi, Bitki Koruma Bölümünde, doktora eğitimini ise 1998 yılında Wye College (Imperial College), University of London, İngiltere’de tamamlamıştır. Hatay Mustafa Kemal Üniversitesi Ziraat Fakültesi Bitki Koruma Bölümü'nde 1998 yılından itibaren Öğretim Üyesi ve Araştırmacı olarak görev yapmaktadır.

Kültür bitkilerinde sorun olan fungal ve bakteriyel hastalık etmenlerin irdelendiği Bitki Patolojisi alanında araştırma deneyimine sahip olup, birçok yüksek lisans ve doktora tezine ve çalışmasına danışmanlık yapmıştır.

Bitki patojeni bakteri ve fungal hastalık etmenlerinin moleküler ve morfolojik tanılanmaları, bitki uçucu yağ ve özütler gibi doğal antimikrobiyal maddelerin antimikrobiyal etkinliği, fungal ve bakteriyel bitki hastalık etmenlerine karşı teşvik edilmiş dayanıklılık, faydalı antagonist fungal ve bakteriyel etmenler ile fungal ve bakteriyel patojenlerin biyolojik kontrolü, bitki büyümesini teşvik eden endofitik ve epifitik bakteri izolatları (PGPB) ve bitki patojeni ile bitki savunma mekanizmaları arasındaki moleküler, biyokimyasal ve morfolojik etkileşimlerin karakterizasyonu konularında saygın dergilerde yayınlanmış çok sayıda araştırma makalesi, kitap bölümü ve konferans bildirileri bulunmaktadır. Çeşitli konularda yayınlanmış araştırma makaleleri dünya genelinde kapsamlı bir şekilde atıf almış ve Tarım Bilimleri alanında ilgili dergi kategorisinde "En Çok Atıf Alan Makaleler" arasında yer almıştır.

Özellikle, çeşitli bitkilerdeki sorun tohum, toprak ve hava kökenli fungal ve bakteriyel hastalıklar, külleme, mildiyö, pas gibi obligat hastalık etmenlerinin morfolojik ve moleküler tanımlanmasında uzmandır. Soylu’nun Türkiye için farklı konukçu bitkilerde sorun olan fungal ve bakteriyel hastalık etmenlerinin ilk kez patojen olduğu konusunda bildirimleri bulunmaktadır.

AB, TÜBİTAK, Üniversite, TAGEM, Kalkınma Bakanlığı gibi kuruluşlar tarafından destekli birçok projede yürütücü, yardımcı araştırıcı ve danışman olarak görev yapmış/yapmaktadır.

Türkiye'de ilk kez doğrudan çiftçiye hastalık, zararlı ve yabancı otlarla ilgili sorunlarına çözüm hizmeti sunan "Bitki Sağlığı Kliniği'nin kuruluşunda yer almıştır.

Alanında saygın ve prestijli birçok dergide Baş Editör, Yayın Kurulu Üyesi ve Hakem olarak görev yapmaktadır.
Plant Pathology, Phytopathology, Plant Protection (Other), Plant Bacteriology in Agriculture
Pharmacology and Pharmaceutical Sciences, Pharmaceutical Chemistry, Molecular Medicine
Plant Physiology, Agricultural Engineering (Other), Agronomy, Pasture-Meadow Forage Plants, Fertilisers and Application, Organic Agriculture

Dergi Sahibi

Cardiovascular Surgery, Health Sciences

Baş Editör

dergi

AK

Zootechny, Stock Farming and Treatment, Animal Growth and Development, Sheep and Goat Breeding and Treatment

Editörler

Horticultural Production, Vegetable Growing and Treatment
Biological Sciences
Genetically Modified Animals
Phytopathology, Plant Bacteriology in Agriculture
Zootechny, Stock Farming and Treatment, Animal Growth and Development, Sheep and Goat Breeding and Treatment
Plant Nutrition and Soil Fertility
Field Crops and Pasture Production
Cereals and Legumes
Agricultural Structures

Alan Editörleri

Uygulamalı istatistik, Varyans Unsurları, Regresyon ve korelasyon, Varyans Analizi -F testi, Parametrik ve parametrik olmayan testler, Biyoistatistik

Animal Science, Genetics and Biostatistics
Hydrobiology

1969 yılında Konya'nın Ilgın ilçesinde doğdu. 1988 yılında başladığı Anadolu Üniversitesi Fen-Edb. Fakültesi İstatistik bölümünden 1992 yılında mezun oldu. 1991-1992 öğretim yılında aynı üniversitede Eğitim Fakültesi'nde Öğretmenlik Sertifikası Programı (Pedagojik Formasyon) eğitimi aldı. 1993-1994 yıllarında yedek subay olarak askerlik hizmetini yerine getirdi. 1997 Haziran-2014 Ocak döneminde devlet memurluğu görevini yürüttü.

Devlet memurluğu esnasında; 1997-1998 yıllarında Ankara Türkiye İstatistik Kurumu'nda Hizmetiçi İstatistik eğitimi aldı ve bu eğitimi 1. olarak bitirdi. 2003 yılında Ortadoğu Teknik Üniversitesi (ODTU) 'nde Uygulamalı İstatistik eğitimi aldı.

2001-2003 yılları arası Ankara Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü İstatistik Anabilim Dalında Tezsiz Yüksek Lisans, 2004-2006 yılları arası Ankara Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü İstatistik Anabilim Dalında Tezli Yüksek Lisans eğitimini tamamladı.

2008-2013 yılları arası Ankara Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Zootekni Anabilim Dalı Biyometri ve Genetik Dalında Doktora eğitimini tamamladı. 2013 yılında Dr. ünvanını aldı. "Zaman Serileri Analizi ve Trafik Kazası Verilerine Uygulanması" isimli doktora tezi en yüksek yayın puanı alan tez ilan edildi ve ödüle layık görüldü.

2014 yılı Ocak ayında Bingöl Üniversitesi Ziraat Fakültesi Zootekni Bölümü'ne Yrd. Doç. Dr. olarak atandı. 2020 yılında Zootekni bilim dalı Biyometri ve Genetik Anabilim dalında Doçent ünvanını aldı.

2023 ve 2024 yıllarında ABD Stanford Üniversitesi'nin yaptığı araştırma sonucuna göre "Dünyanın en etkili bilim insanları” sıralamasına girdi ve bu listenin yüzde 2’lik dilim içerisinde yer aldı.

Animal Science, Genetics and Biostatistics
G-7994-2018
Agricultural Economics
Entomology, Entomology in Agriculture
Animal Feeding
Agricultural Biotechnology
Agribusiness
Biological Sciences, Biochemistry and Cell Biology
Stres Fizyolojisi, Antioksidan Sistem, Sinyal Molekülleri, Tıbbı ve aromatik bitkiler, Bitki fizyolojisi, Bitki Biyokimyası
Plant Physiology

Danışmanlar Kurulu

Animal Feeding
Green-House Growing and Treatment
Field Crops and Pasture Production
Entomology
Biostatistics, Sheep and Goat Breeding and Treatment, Genetically Modified Animals
Medicinal and Biomolecular Chemistry
Ethobotany, Pharmacognosy, Pharmaceutical Botany, Basic Pharmacology, Natural Products and Bioactive Compounds, Phytotherapy, Medicinal Plants, Food Chemistry and Food Sensory Science, Medicinal and Aromatic Plants
Biological Sciences, Plant Protection (Other), Plant Biotechnology in Agriculture
Stock Farming and Treatment
Stock Farming and Treatment
Sheep and Goat Breeding and Treatment
Medicinal and Aromatic Plants
Plant Biotechnology in Agriculture
Biostatistics, Animal Feeding
Plant Morphology and Anatomy
Medical Biochemistry and Metabolomics
Plant Protection
Stock Farming and Treatment
Pomology and Treatment
Animal Systematics and Taxonomy, Entomology, Invertebrate Biology
Animal Physiology-Ecophysiology
Agricultural, Veterinary and Food Sciences
Stock Farming and Treatment
Stock Farming and Treatment
Health Sciences
Agricultural Economics, Agricultural Marketing, Agricultural Economics, Agribusiness, Agricultural Land Management
Animal Feeding, Animal Biotechnology in Agriculture
Plant Biotechnology in Agriculture, Pasture-Meadow Forage Plants, Crop and Pasture Breeding
Stock Farming and Treatment, Animal Feeding
Food Sciences


International Peer Reviewed Journal
Free submission and publication
Published 6 times a year



88x31.png


KSU Journal of Agriculture and Nature

e-ISSN: 2619-9149