Gerze Tavuğu ve Bazı Saf Hat Genotiplerinde Majör Doku Uyumluluğu Gen Kompleksi Polimorfizmi

The aim of this study was to molecularly investigate the major histocompatibility complex (MHC) polymorphisms of the Gerze chicken population of 43 samples and the commercial pure line population of 50 samples. Allelic diversity was calculated based on PCR amplification of MCW0371 and LEI0258 microsatellite loci in MHC and separation of DNA fragments by agarose gel electrophoresis. In the Gerze population, number of different alleles, number of effective alleles, observed heterozygosity and expected heterozygosity values were calculated as: 16, 10.82, 0.67, 0.91, whereas the values were determined as 19, 11.84, 0.60, 0.92 for the pure line population, respectively for LEI0258 locus. As for MCW0371 locus, the values were calculated as 3, 2.68, 0, 0.63 in the Gerze population and 3, 1.96, 0, 0.49 in the Pure line population, respectively. Nei’s genetic distance and genetic identity values between the populations were calculated as 0.419 and 0.658, respectively. The F_ST value among the populations was found to be 0.068. The findings revealed that Gerze chicken should be included in breeding programs as a unique genetic resource with its allelic richness.

Bu çalışmada Gerze tavuğu popülasyonuna ait 43 örnek ile ticari saf hatlardan oluşturulan 50 örneklik Saf hat popülasyonunun majör doku uyumluluğu gen kompleksi (MHC) bakımından moleküler incelenmesi amaçlanmıştır. Allelik çeşitlilik, MHC içerisinde yer alan MCW0371 ve LEI0258 mikrosatellit lokuslarının PCR yöntemi yardımıyla çoğaltılarak elde edilen DNA fragmentlerinin agaroz jel elektroforezi ile ayrımlanması ile hesaplanmıştır. Gerze popülasyonunda LEI0258 lokusunda elde edilen allel sayısı, etkili allel sayısı, gözlenen heterozigotluk ve beklenen heterozigotluk değerleri sırasıyla; 16, 10.82, 0.67, 0.91, Saf hat popülasyonunda ise 19, 11.84, 0.60, 0.92 olarak bulunmuştur. MCW0371 lokusu için sırasıyla; Gerze popülasyonunda 3, 2.68, 0, 0.63 ve Saf hat popülasyonunda 3, 1.96, 0, 0.49 olarak tespit edilmiştir. Popülasyonlar arasında Nei genetik uzaklık ve genetik benzerlik değerleri sırasıyla 0.419 ve 0.658 olarak hesaplanmıştır. Popülasyonlar arasında F_ST değeri 0.068 olarak bulunmuştur. Elde edilen bulgular, içerdiği allel deseni bakımından Gerze tavuğunun özgün bir genetik kaynak olarak korunmasının ve ıslah programlarına dahil edilmesinin önemli olduğu sonucuna varılmıştır.