Research Article

Molecular Characterization and Assessment of Population Structure of Hulled Wheats

Volume: 25 Number: Ek Sayı 1 December 30, 2022
TR EN

Kavuzlu Buğdayların Moleküler Karakterizasyonu ve Popülasyon Yapısının Değerlendirilmesi

Öz

Genotipler arasındaki genetik çeşitliliğin ve popülasyonlar arasındaki farklılaşmanın analizi, koruma stratejilerinin belirlenmesi ve en iyi bitki ıslah yaklaşımlarından biri için çok önemlidir. 23 kavuzlu buğdayda genetik varyasyonu ve popülasyon yapısını belirlemek için ISSR markörleri kullanılmıştır. Kontrol makarnalık buğday ve ekmeklik buğday tescilli çeşitleriyle birlikte, 14 ISSR markörü ile 32 buğday genotipi analiz edildi. Lokus başına alel sayısı 3 ile 13 arasında ve polimorfizm bilgi içeriği (PIC) değeri UBC-852 için 0.27 ile UBC-824 için 0.37 arasında ve ortalama 0.33 olarak belirlenmiştir. ISSR primerleri için yüksek düzeyde polimorfizm oranı (%100) gözlenmiştir. Ortalama polimorfik alel sayısı (N), beklenen heterozigotluk (He), PIC, etkili allel sayısı (Ne), Shanon bilgi indeksi (I) ve genetik varyasyon (FST) sırasıyla 10.21, 0.42, 0.33, 1.78, 0.61 ve 0,63 olarak belirlenmiştir. Dice genetik benzerliğine dayanan UPGMA analizi, kavuzlu buğday genotipleri arasındaki yüksek genetik çeşitliliği göstermiş olup 0.981 ile 0.112 arasında değişmiştir. Sonuçlar, ISSR markörlerinin kavuzlu buğday genotiplerinin popülasyon yapısı ve genetik çeşitliliğinin değerlendirilmesi için güvenilir ve tekrarlanabilir parmak izi profilleri sağladığını göstermiştir. Mevcut çalışmadan elde edilen bu moleküler varyasyonlar, ıslah çalışmaları için ebeveyn seçiminde kullanılabilir.

Anahtar Kelimeler

Supporting Institution

Erciyes University

Project Number

FYL-2013-4233

References

  1. Abou-Deif MH, Rashed MA, Sallam MAA, Mostafa EAH, Ramadan WA 2013. Characterization of Twenty Wheat Varieties by ISSR Markers. Middle East Journal of Scientific Research 15(2): 168-175.
  2. Carvalho A, Lima-Brito J, Maçãs B, Guedes-Pinto H 2009. Genetic Diversity and Variation Among Botanical Varieties of Old Portuguese Wheat Cultivars Revealed by ISSR Assays. Biochemical Genetics 47(3-4): 276-294.
  3. Du JK, Yao YY, Ni ZF, Peng HR, Sun QX 2002. Genetic Diversity Revealed by ISSR Molecular Marker in Common Wheat, Spelt, Compactum and Progeny of Recurrent Selection. Yi Chuan Xue Bao= Acta Genetica Sinica 29(5): 445-452.
  4. El Maati FB, Jlibene M, Moumni M 2004. Study of The Polymorphism of Common Wheat Using ISSR Markers. Journal of Food, Agriculture and Environment 2(3-4): 121-125.
  5. Evanno G, Regnaut S, Goudet J 2005. Detecting The Number of Clusters of Individuals Using The Software Structure: A Simulation Study. Molecular Ecology 14(8): 2611-2620.
  6. Fahmy EM, Abd El-Gawad NM, El-Geddawy IH, Saleh OM, El-Azab NM 2016. Development of RAPD and ISSR Markers for Drought Tolerance in Sugarcane (Saccharum officinarum L.). Egyptian Journal of Genetics and Cytology 37(1): 1-15.
  7. Gulbitti O, Sümer S, Özcan S 2007. Determination of Phylogenetic Relationships Between Some Wild Wheat Species Using Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) Markers. Botanical Journal of the Linnean Society 153(1): 67-72.
  8. Gulsen O, Shearman RC, Vogel KP, Lee DJ, Baenziger PS, Heng-Moss TM, Budak H 2005. Nuclear Genome Diversity and relationships Among Naturally Occurring Buffalograss Genotypes Determined by Sequence-Related Amplified Polymorphism Markers. Hort Science 40(3): 537-541.

Details

Primary Language

English

Subjects

Agricultural, Veterinary and Food Sciences

Journal Section

Research Article

Publication Date

December 30, 2022

Submission Date

July 9, 2021

Acceptance Date

February 17, 2022

Published in Issue

Year 1970 Volume: 25 Number: Ek Sayı 1

APA
Demirel, F., Gürcan, K., & Akar, T. (2022). Molecular Characterization and Assessment of Population Structure of Hulled Wheats. Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tarım Ve Doğa Dergisi, 25(Ek Sayı 1), 192-199. https://doi.org/10.18016/ksutarimdoga.vi.968009

Cited By


International Peer Reviewed Journal
Free submission and publication
Published 6 times a year



88x31.png


KSU Journal of Agriculture and Nature

e-ISSN: 2619-9149