Research Article

Fruit extracts of Rosa canina L. and Rosa pimpinellifolia L.: Phytochemical profiles, in vitro antioxidant, anti-inflammatory, xanthine oxidase inhibitory effects, and in silico molecular dynamics studies

Volume: 28 Number: 3 June 9, 2025
TR EN

Rosa canina ve Rosa pimpinellifolia meyve özütleri: Fitokimyasal profilleri, in vitro antioksidan, anti-inflamatuar, ksantin oksidaz inhibitör etkileri ve in silico moleküler dinamik çalışmaları

Öz

Bu çalışmada, Rosa canina (RC) ve R. pimpinellifolia (RP) meyve metanol özütlerinin fitokimyasal ve biyolojik aktiviteleri araştırılmıştır. HPLC'de, RP ve RC özütleri ana bileşenler olarak büyük miktarlarda askorbik asit ve gallik asit içermektedir. GC-MS/MS'de, her özütte en yüksek miktarlarda oleik asit, linoleik asit ve palmitik asit metil esteri bulunmuştur. RP ve RC'nin toplam fenol içerikleri sırasıyla 17.28±0.10 ve 5.19±0,22 mg GAE/g özüt olarak bulunmuştur. Özütlerin DPPH˙ süpürücü aktivitesinin (RC için 13.45±0.21 µg/mL ve RP için 3.41±0.05 µg/mL), askorbik asitten (42.15±1.35 µg/mL) daha yüksek olduğu gözlenmiştir. RC ve askorbik asidin indirgeyici güç kapasiteleri sırasıyla 55,57±3,23 ve 87,24±2,44 µg/mL olarak bulundu. BSA denatürasyon deneyine göre, RP'nin anti-inflamatuar etkisinin DFS ile düşük dozlarda daha etkili olduğu ve yüksek dozlardaki etkiye benzer olduğu bulundu. RC özütü, 2,28±0,25 µg/mL'lik IC50 değeri ile yüksek ksantin oksidaz (XO) inhibisyonu gösterdi. Askorbik ve gallik asidin XO ile bağlanma afiniteleri sırasıyla -6,20 ve -6,60 kcal/mol olarak belirlendi. Ayrıca, komplekslerin moleküler dinamik simülasyonları 100 ns boyunca uygulandı ve kararlı oldukları gözlendi. Bağlanma enerjileri MM/PBSA yapılarak belirlendi ve gallik asidin yüksek değerinin -21,50 kcal/mol olarak bulunduğu kaydedildi. Bu şekilde iki farklı kuşburnu türünün fitokimyasal bileşenleri ve biyolojik aktiviteleri karşılaştırılmış ve gıda, kozmetik ve ilaç gibi alanlarda kullanımına yönelik fikirler sunulmuştur.

Anahtar Kelimeler

Supporting Institution

Ondokuz Mayis University Iğdır University

Project Number

BAP01-2024-4682 ..... YİP0723İ01

Ethical Statement

yok

Thanks

Ondokuz Mayis University Iğdır University

References

  1. Abraham, M. J., Murtola, T., Schulz, R., Páll, S., Smith, J. C., Hess, B., & Lindahl, E. (2015). GROMACS: High performance molecular simulations through multi-level parallelism from laptops to supercomputers. SoftwareX, 1, 19-25. https://doi.org/https://doi.org/10.1016/j.softx.2015.06.001
  2. Akkoc, S., Karatas, H., Muhammed, M. T., Kökbudak, Z., Ceylan, A., Almalki, F., Laaroussi, H., & Ben Hadda, T. (2023). Drug design of new therapeutic agents: Molecular docking, molecular dynamics simulation, DFT and POM analyses of new Schiff base ligands and impact of substituents on bioactivity of their potential antifungal pharmacophore site. Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, 41(14), 6695-6708. https://doi.org/https://doi.org/10.1080/07391102.2022.2111360
  3. Atienza, S. G., Torres, A. M., Millan, T., & Cubero, J. I. (2005). Genetic diversity in Rosa as revealed by RAPDs. Agriculturae Conspectus Scientificus, 70(3), 75-85.
  4. Başar, Y., Demirtaş, İ., Yenigün, S., İpek, Y., Özen, T., & Behçet, L. (2024a). Molecular docking, molecular dynamics, MM/PBSA approaches and bioactivity studies of nepetanudoside B isolated from endemic Nepeta aristata. Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, 1-14.
  5. Başar, Y., & Erenler, R. (2024). Phytochemical analysis of Silybum marianum flowers: Quantitative analysis of natural compounds and molecular docking application. Turkish Journal of Biodiversity, 7(1), 20-31. https://doi.org/https://doi.org/10.38059/biodiversity.1450643
  6. Başar, Y., Gül, F., Nas, M. S., Alma, M. H., & Çalımlı, M. H. (2024b). Investigation of value-added compounds derived from oak wood using hydrothermal processing techniques and comprehensive analytical approaches (HPLC, GC-MS, FT-IR, and NMR). International Journal of Chemistry and Technology, 8(1), 53-61.
  7. Başar, Y., Yenigün, S., Gül, F., Ozen, T., Demirtas, İ., Alma, M. H., & Temel, S. (2024c). Phytochemical profiling, molecular docking and ADMET prediction of crude extract of Atriplex nitens Schkuhr for the screening of antioxidant and urease inhibitory. International Journal of Chemistry and Technology, 8(1), 62-71.
  8. Bjelkmar, P., Larsson, P., Cuendet, M. A., Hess, B., & Lindahl, E. (2010). Implementation of the CHARMM force field in GROMACS: analysis of protein stability effects from correction maps, virtual interaction sites, and water models. Journal of chemical theory and computation, 6(2), 459-466. https://doi.org/https://doi.org/10.1021/ct900549r

Details

Primary Language

English

Subjects

Pharmaceutical Botany

Journal Section

Research Article

Early Pub Date

May 1, 2025

Publication Date

June 9, 2025

Submission Date

February 13, 2025

Acceptance Date

April 11, 2025

Published in Issue

Year 1970 Volume: 28 Number: 3

APA
Başar, Y., Yenigün, S., Alma, M. H., Demirtas, İ., & Ozen, T. (2025). Fruit extracts of Rosa canina L. and Rosa pimpinellifolia L.: Phytochemical profiles, in vitro antioxidant, anti-inflammatory, xanthine oxidase inhibitory effects, and in silico molecular dynamics studies. Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tarım Ve Doğa Dergisi, 28(3), 636-649. https://doi.org/10.18016/ksutarimdoga.vi.1639294

Cited By


International Peer Reviewed Journal
Free submission and publication
Published 6 times a year



88x31.png


KSU Journal of Agriculture and Nature

e-ISSN: 2619-9149