Type 2 diabetes (T2D), typically characterized by insulin resistance, is a metabolic disorder that occurs when the body cannot use insulin effectively or does not produce enough insulin. In the treatment of T2D, insulin, metformin, and sulfonylureas are commonly used. Given the limitations of current treatment options, there is a strong need for intensive efforts in the discovery of new drugs. Berberine exhibits antidiabetic effects and possesses anti-inflammatory and antioxidant properties. Resveratrol is another natural compound that has been extensively researched due to its antioxidant and anti-inflammatory characteristics. This study aimed to investigate the interactions between berberine and resveratrol with proteins related to or causing T2D, including ADIPOR1 (PDB-ID: 6ks1), ADIPOR2 (PDB-ID: 5lxg), TNF-α (PDB-ID: 7kpb), PTP1B (PDB-ID: 4i8n), GLUT1 (PDB-ID: 4pyp), IGF-IR (PDB-ID: 8eyr), IGF1 (PDB-ID: 6pyh), ADAMTS9 (PDB-ID: 3ppv), and SPHK2 (PDB ID: 4v24). SwissADME was used to assess the pharmacokinetic properties of berberine and resveratrol. Molecular docking was performed to analyze the interactions between these ligands and the specified proteins. Additionally, the potential bioactivity features of compounds were determined. Protein-protein interactions were obtained from the STRING database. The study data indicated that both compounds have high blood-brain barrier (BBB) penetration and gastrointestinal absorption ability (HIA). Besides, berberine exhibited the highest binding affinity with GLUT4 (-10.1 Kcal/mol), GLUT1 (-9.3 Kcal/mol), and SPHK2 (-9.3 Kcal/mol), while resveratrol showed strong binding with SPHK2 (-9.0 Kcal/mol) and TNF-α (-8.7 Kcal/mol) and. All proteins displayed binding energies of more than -7 Kcal/mol, suggesting that both berberine and resveratrol hold promise as potential drug candidates for T2D.
Tip 2 diyabet (T2D), tipik olarak insülin direnci ile karakterize edilen ve vücudun insülini etkili bir şekilde kullanamadığı veya yeterli insülin üretemediği bir metabolik bozukluktur. T2D tedavisinde insülin, metformin ve sülfonilüreler yaygın olarak kullanılmaktadır. Mevcut tedavi seçeneklerinin sınırlamaları göz önüne alındığında, yeni ilaçların keşfinde yoğun çabalara ihtiyaç vardır. Berberin, antidiyabetik, anti-inflamatuvar ve antioksidan özelliklere sahiptir. Resveratrol, antioksidan ve anti-enflamatuvar özellikleri nedeniyle kapsamlı bir şekilde araştırılan bir başka doğal bileşiktir. Bu çalışmanın amacı, berberin ve resveratrolün ADIPOR1 (PDB-ID: 6ks1), ADIPOR2 (PDB-ID: 5lxg), TNF-α (PDB-ID: 7kpb), PTP1B (PDB-ID: 4i8n), GLUT1 (PDB-ID: 4pyp), IGF-IR (PDB-ID: 8eyr), IGF1 (PDB-ID: 6pyh), ADAMTS9 (PDB-ID: 3ppv) ve SPHK2 (PDB ID: 4v24) dahil olmak üzere T2D ile ilişkili veya T2D'ye neden olan proteinlerle olan etkileşimlerini araştırmaktır. Berberin ve resveratrolün farmakokinetik özelliklerini değerlendirmek için SwissADME kullanılmıştır. Bu ligandlar ile belirtilen proteinler arasındaki etkileşimleri analiz etmek için moleküler yerleştirme yapılmıştır. Ayrıca, bileşiklerin potansiyel biyoyararlılık özellikleri belirlenmiştir. Protein-protein etkileşimleri STRING veri tabanından elde edilmiştir. Çalışma verileri, her iki bileşiğin de yüksek kan-beyin bariyeri (BBB) penetrasyonu ve gastrointestinal emilim yeteneğine (HIA) sahip olduğunu göstermiştir. Bunun yanında, berberin GLUT4 (-10.1 Kcal/mol), GLUT1 (-9.3 Kcal/mol) ve SPHK2 (-9.3 Kcal/mol) ile en yüksek bağlanma afinitesini gösterirken, resveratrol SPHK2 (-9.0 Kcal/mol) ve TNFR1 (-8.7 Kcal/mol) ile güçlü bağlanma göstermiştir. Tüm proteinler, -7 Kcal/mol'den daha yüksek bağlanma enerjileri sergilemiş, bu da berberin ve resveratrolün T2D için potansiyel ilaç adayları olarak umut verici olduğunu göstermektedir.
Birincil Dil | İngilizce |
---|---|
Konular | Eczacılık ve İlaç Bilimleri (Diğer) |
Bölüm | ARAŞTIRMA MAKALESİ (Research Article) |
Yazarlar | |
Erken Görünüm Tarihi | 19 Aralık 2024 |
Yayımlanma Tarihi | |
Gönderilme Tarihi | 19 Temmuz 2024 |
Kabul Tarihi | 12 Ekim 2024 |
Yayımlandığı Sayı | Yıl 2024Cilt: 27 Sayı: Ek Sayı 2 (Suppl 2) |
2022-JIF = 0.500
2022-JCI = 0.170
Uluslararası Hakemli Dergi (International
Peer Reviewed Journal)
Dergimiz, herhangi bir başvuru veya yayımlama ücreti almamaktadır. (Free submission and publication)
Yılda 6 sayı yayınlanır. (Published 6 times a year)
Bu web sitesi Creative Commons Atıf 4.0 Uluslararası Lisansı ile lisanslanmıştır.